Menneisyydessä, archaea luokiteltiin bakteerit ja kutsuttiin archaebacteria. Mutta havaittiin, että arhaalla on erillinen evoluutiohistoria ja biokemia verrattuna
1900-luvun puoliväliin asti biologit luokittelivat kaikki elävät esineet joko kasveiksi tai eläimiksi. Mutta tämä järjestelmä ei onnistunut majoittamaan sieniä, protisteja ja bakteereja. Joten 1970-luvulle mennessä luokittelujärjestelmä kehittyi niin kutsuttuun viiteen kuningaskuntaan - prokaryooteihin (bakteerit) ja eukaryooteihin (kasvit, eläimet, sienet, protistit). Eukaryooteille on ominaista ytimien, sytoskeletonien ja sisäisten membraanien läsnäolo soluissa.
1970-luvun lopulla tohtori Carl Woese ja hänen kollegansa Illinoisin yliopistossa tunnistivat ryhmän mikro-organismeja, joiden geneettinen rakenne poikkesi huomattavasti muista bakteereista. Joten he jakoivat prokaryoottisen elämän kutsutuiksi archaeabacteria ja eubakteereja. Myöhemmin he kuitenkin päättelivät, että "arhaeabakteerit" olivat riittävän erilaisia, jotta ne eivät olisi bakteereita. Joten ryhmät nimettiin uudelleen archaea ja bakteerit.
Elämäpuu, joka näyttää kaikkien elävien organismien luokituksen.Sekä arhaea että eubakteerit ovat muodoltaan ja kooltaan samanlaiset. Niitä molempia esiintyy sauvoina, kokkeina, spiraaleina, levyinä tai kelattuina.
Archaea ja bakteerien yleinen solurakenne ovat samat, mutta joidenkin rakenteiden koostumus ja organisaatio eroavat archaeassa. Samoin kuin bakteerit, archaea-alueella ei ole sisäkalvoja, mutta molemmilla on soluseinä ja ne käyttävät flagellaa uimaan.
Archaea eroaa siitä, että niiden soluseinä ei sisällä peptidoglykaania ja solukalvo käyttää eetteriin sidottuja lipidejä toisin kuin esteriin sidotut lipidit bakteereissa.
Archaea flagella kehittyi bakteerityypin IV pilistä, kun taas bakteeri flagella kehittyi tyypin III eritysjärjestelmästä. Bakteerikärpäs on kuin ontto varsi, joka on koottu alayksiköillä, jotka voivat liikkua vapaasti keskihuokosta ylöspäin lisäämällä flagellan kärkeen, kun taas archaeassa flagellan alayksiköt lisätään pohjaan.
archaea lisääntyä aseksuaalisesti binaarifission, orastuksen ja sirpaloitumisen avulla. eubakteereja lisääntyä aseksuaalisesti binaarifission, punoituksen, sirpaloitumisen kautta, mutta eubakteerilla on ainutlaatuinen kyky muodostaa itiöitä pysyäkseen lepotilassa vuosien ajan - ominaisuus, jota Archaea ei ole osoittanut. Bakteerien kasvu seuraa kolmessa vaiheessa, viivevaihe, kun solut mukautuvat uuteen ympäristöön, log-vaihe merkitsee eksponentiaalista kasvua ja paikallaan oleva vaihe, kun ravinteet loppuvat.
archaea voi selviytyä äärimmäisissä ja ankarissa ympäristöissä, kuten kuumia lähteitä, suolajärviä, soita, valtameriä, märehtijöiden ja ihmisten suolia. eubakteereja ovat kaikkialla läsnä olevia ja niitä löytyy maaperästä, kuumista lähteistä, radioaktiivisista jätevesistä, maankuoresta, orgaanisista aineista, kasvi- ja eläinruumista jne..