Amerikan baptistiliikkeen historia seuraa tarkkaan tärkeimpiä tapahtumia, jotka määrittelivät Amerikan kansana. Kirkon kasvu heijastaa alkuperäisen asuttajan saapumista, Yhdysvaltojen vallankumouksellista sotaa ja sisällissodan vaikutusta siihen. Jäljittämällä liikkeen alkuperät nähdään, miten erot eteläisen konventin ja amerikkalaisten baptistien välillä syntyivät. Eroista huolimatta näiden kahden haaran välillä on edelleen monia samankaltaisuuksia, jotka juontavat juurensa kirkkojen varhaisesta alkuperästä.
Baptistiliikkeen alkuperä on melko monimutkainen. Sitä voidaan pitää sellaisena, joka kasvoi protestanttisista aloista eikä muodostunut yön yli. Vaikka jotkut tutkijat ovat yrittäneet jäljittää baptistien alkuperää raamatullisiin päiviin, monet tutkijat ja kriitikot diskontoivat tämän ja näkevät Isossa-Britanniassa alkavan liikkeen alkuperän 1500-luvun alkupuolella. Englannissa 1700-luvun alussa monet kristityt olivat tyytymättömiä Englannin kirkkoon. Tämä johtui osittain Englannin kirkon ilmeisestä roomalaiskatolisesta vaikutuksesta (McBeth n.d.). Jaot kirkosta alkoivat siitä, että monet halusivat palata Raamatun yksinkertaisempiin opetuksiin. Näitä kirkkoja kutsuttiin löysästi ”separatisteiksi”.
Kaksi tyyppiä baptistikuntaa tulivat separatistien suuremmasta joukosta. He olivat yleisiä baptisteja, jotka uskoivat yleiseen sovitukseen Kristuksen kuoleman yhteydessä, ja erityisiä baptisteja, jotka uskoivat vain tietyn ryhmän, nimeltään "valitut", sovittiin (McBeth n.d.). Erityinen baptisti aloitti upotuskasteen harjoittamisen, kun koko ruumis ja pää upotettiin veteen (McBeth n.d.). Kastajien edelleen harjoittama käytäntö, joka on peräisin separatisteilta, jotka matkustivat Hollantiin ja olivat todistamassa hollantilaisten anabaptistien lahkojen kastavan tällä tavalla. Termi Baptist oli, kuten niin monia asioita läpi historian käytettiin poikkeuksellisesti. Alussa baptistit mainitsivat itsensä nimellä "Veljet" tai "Kastetun tien veljet" (McBeth n.d.).
Amerikan varhaiset baptistit saapuivat alun perin Englannista paeta uskonnollista vainoa samalla tavalla kuin muut separatistit. Rodger Williams ja John Clarke voidaan nähdä ensimmäisinä baptistiministereinä, jotka saapuvat Amerikkaan (Baker n.d.). He perustivat Providencessa ensimmäisen baptistikirkon, jota kutsuttiin melko alun perin Amerikan ensimmäiseksi baptistikirkoksi vuonna 1638. Kirkko varhaisvuosinaan ja koko baptistiliike ei kokenut uskovien lukumäärää kohden. Vuoteen 1740 mennessä Amerikassa oli noin 300–400 jäsentä (Baker n.d.).
Vuonna 1755 tapahtui kuitenkin suuri herätys. Tämä johtui kahdesta miehestä, erityisesti Shubal Steamsista ja Daniel Marshalista, jotka alkoivat saarnata innokkaasti eteläisissä siirtomaissa ja länsirajalla. Tämä herättäminen tarjosi malleja kirkon elämälle, jota eteläiset baptistit seuraavat edelleen tähän päivään saakka (Baker n.d.). Koska baptistit vastustivat julkisia veroja, jotka tukivat tiettyjä kirkkoja, nimittäin Englannin kirkkoa, ja heidän opinsa riippumattomuudesta valtion puuttumisesta; monista tuli aktiivisia isänmaallisuuksia Yhdysvaltojen vallankumouksellisessa sodassa 1775 ansaitsemalla joidenkin perustajien isän, kuten George Washingtonin (Baker n.d.) ihailua..
Vuosina 1707–1814 perustettiin erilaisia baptistijärjestöjä auttamaan kirkon vahvistamisessa, lähetyssaarnaajien muodostamisessa ja opin selventämisessä. Vasta yleisen lähetystyökokouksen muodostumisesta vuonna 1814 muista yhdistyksistä muodostettiin todellinen edustava elin koko Amerikkaan. Lähes alusta alkaen mielipide-erot nousivat pohjoisen ja etelän välillä. Eteläiset baptistit toivoivat organisaation olevan yhdistymisjärjestö, mikä tarkoittaa, että on olemassa yksi kirkkokunnan elin, joka valvoo kaikkia kirkon näkökohtia, eikä yhteiskuntamalli, jolla on erillinen yhteiskunta jokaiselle tehtävälle (Baker n.d.). Kuten jäljempänä esitetään, sellaiset erilaiset mielipiteet ja historialliset tapahtumat, jotka paljastuisivat, vaikuttaisivat syvästi yleiseen lähetystyökokoukseen valtion linjojen mukaisesti.
Kuten edellä mainittiin, yleinen lähetystyökokous toi esiin vanhat siirtomaaerot. Oli kyse sitten länsimaisesta viljelijästä, pohjoismaisista liikemiehistä vai eteläisestä viljelijästä, jokaisella oli erilainen mielipide siitä, kuinka parhaiten palvella baptistiuskoa. Kaikkein suurin kysymys oli orjuus. Voidaan väittää, että tämä heijasti suoraan vallitsevia jännitteitä ennen sisällissotaa ja sen aikana. Eteläiset baptistit alkoivat tukea sukukuntaa siinä mielessä, että heillä oli oikeus omistaa orjia, ja halusivat, että orjanomistajien sallitaan olevan lähetyssaarnaajia (Graham 2015). Orjuus on ihmiskunnan tahra. Monilla baptistihistorioitsijoilla on ollut vaivaa muistuttaa lukijoita siitä, että orjia omisti vain vähemmistö baptisteista, mutta noin kaksi kolmasosaa ei omista orjia (Baker n.d.). Baptistikirkot koostuivat yleensä alemmista taloudellisista luokista. Siitä huolimatta, historiallisena tosiasiana on edelleen, että eteläiset baptistit tukivat orjaomistajia institutionaalisella tasolla valvoessaan sitä, mitä he pitivät oikeutena, moraalisesti vastenmielisenä oikeutena, mutta kuitenkin.
Orjuus ei ollut ainoa ero, joka aiheutti katkeamisen edellä mainitussa sopimuksessa. Kuten edellä mainittiin, eteläiset baptistit toivoivat edelleen vahvempaa uskonnollista yhtenäisyyttä ilman keinoja tämän tahdon toteuttamiseksi aiheuttaneet paljon keskustelua (Baker n.d.). Nämä erot aiheuttivat lopulta eteläisen baptistikokouksen muodostumisen 10. toukokuuta 1845. Eteläinen baptistiyleissopimus on edelleen olemassa tänäkin päivänä. Itse asiassa se on eteläisen baptistikokouksen äskettäisen tutkimuksen mukaan planeetan suurin baptistijärjestö ja Yhdysvaltain suurin protestanttinen järjestö, jolla on yli 15 miljoonaa jäsentä. On tärkeää huomata, että organisaatio ei enää tue orjuutta ja on hiljattain sitoutunut suhtautumaan rasisminvastaisuuteen koko kirkossaan. Tämä näkyy vuonna 1995 annetussa päätöslauselmassa, jonka otsikkona oli rotujen välinen sovinto eteläisen baptistikokouksen 150. vuosipäivänä. Organisaatio tunnusti historiansa ja ryhtyi toimenpiteisiin aiemman epäoikeudenmukaisuuden muuttamiseksi ja estämiseksi (SBC 1995). Lisäkonferensseja on tapahtunut, kun organisaatioiden vaikeassa menneisyydessä on edessään, ja rasismia, seksuaalisuutta ja uskonnonvapautta koskevaa keskustelua on jatkettu pyrkiessä torjumaan etenkin nuorten aikuisten jäsenmäärän vähentämistä (Graham 2015).
Pohjoisen baptistit tulivat nimellä Yhdysvaltain baptistikirkot USA ja vaikka heillä on edelleen monia perustavia uskomuksia eteläisen baptistikokouksen ja yleensä baptistien kanssa. Eroja kuitenkin esiintyy, ja yleisesti ottaen eteläisen baptistikokouksen näkökulmat ja lähestymistapa ovat konservatiivisemmat. Seuraava on luettelo tärkeimmistä eroista kahden elimen välillä:
Tämä luettelo ei ole mitenkään tyhjentävä, ja saman organisaation eri kirkoilla on erilaisia mielipiteitä. Yllä olevasta artikkelista voidaan nähdä, kuinka tiiviisti baptistikirkko liittyy Yhdysvaltojen historiaan ja arvoihin, joita se kerran hallitsi, ja arvoihin, joita sillä on nykyään.