Endonukleaasi vs eksonukleaasi
Endonukleaasi ja eksonukleaasi ovat nukleaasientsyymejä, jotka katalysoivat DNA-ketjussa olevien yksittäisten nukleotidien hydrolyysiä. Nukleaaseilla on tärkeä rooli DNA: n ja RNA: n nukleotidisekvenssien analysoinnissa.
eksonukleaasi
Eksonukleaasientsyymit ovat entsyymien luokka, jotka pilkkoutuvat DNA-molekyylin päissä oleviin nukleotideihin. Nämä kaksi DNA-juostet ovat komplementaarisia toistensa suhteen. Niitä edustaa 3 'ja 5' varret. DNA: n ja RNA: n fosfodiesterisiltoja hyökkäävät kaksi entsyymiluokkaa, jotka esitetään "a" ja "b". Ryhmän “a” entsyymit hydrolysoivat spesifisesti esterisidoksen 3 'hiilen välillä, ja fosforiryhmä ja ryhmän “b” entsyymit hydrolysoivat esterisidoksen 5' hiilen ja fosforiryhmän välillä..
Hyvä esimerkki ryhmän “a” eksonukleaasientsyymistä on kalkkarokäärmen ja Russellin viruksen myrkky. Tämä myrky hydrolysoi kaikki DNA: n tai RNA: n 3'-sidokset vapauttaen nukleotidiyksiköt nukleosidi-5'-fosfaateina.
Luokan b entsyymejä edustaa pernan fosfodiesteraasi, joka hydrolysoi sekä DNA: n että RNA: n kaikki b- tai 5-sidokset ja vapauttaa siten vain nukleosidi-3'-fosfaatit.
endonukleaasia
Endonukleaasientsyymit ovat entsyymejä, jotka hajoavat DNA: n sidoksille molekyylin sisällä. Ne eivät vaadi vapaata 3 'tai 5' hydroksyyliryhmää polynukleotidiketjun päässä. Endonukleaasit hyökkäävät spesifisiä 3 'tai 5' sidoksia, missä niitä esiintyy polynukleotidiketjussa.
Endonukleaasit luokitellaan myös ryhmiin “a” ja “b”. Naudan haiman deoksiribonukleaasi I luokitellaan luokan a -entsyymiksi, joka katalysoi joidenkin DNA: n 3'-sidosten hydrolyysiä tuottamaan oligonukleotideja, jotka sisältävät keskimäärin noin neljä nukleotiditähdettä.
Deoksiribonukleaasi II on toinen luokan b endonukleaasi. Se eristetään eri bakteerien pernasta ja kateenkorvasta ja aiheuttaa 5'-sidosten hydrolyysin tuloksena nukleotidiryhmään.
Yhteenveto:
1.Eksonukleaasi aiheuttaa nukleotidin hydrolyysin päissä, joissa polynukleotidiketjussa on vapaata 3 'tai 5' hydroksyyliryhmää, kun taas eksonukleaasi ei vaadi vapaata 3 'tai 5' hydroksyyliryhmää aiheuttamaan polynukleotidiketjun hydrolyysiä.
2.Eksonukleaasiaktiivisuus johtaa nukleosideihin, kun taas endonukleaasiaktiivisuus johtaa oligonukleotideihin.
3.Eksonukleaasin aktiivisuus johtaa polynukleotidiketjun pieniin yksiköihin melkein välittömästi, kun taas endonukleaasiaktiivisuus käy läpi viivevaiheen ennen oligonukleotidiryhmien vapauttamista.
4.Määränmyrky ja pernan fosfodiesteraasi ovat esimerkkejä eksonukleaaseista, kun taas deoksiribonukleaasit I ja II ovat esimerkkejä endonukleaaseista.