Ero endonukleaasin ja eksonukleaasin välillä

Avainero - endonukleaasi vs eksonukleaasi
 

Ennen kuin tarkastellaan eroa endonukleaasin ja eksonukleaasin välillä, on tärkeää tietää, mikä tarkalleen on nukleaasi. Nukleaasi on entsyymi, joka kykenee pilkkomaan fosfodiesterisidoksia nukleiinihappojen nukleotidien välillä. Endonukleaasi ja eksonukleaasi ovat kaksi nukleaasiluokitusta. Keskeinen ero endonukleaasin ja eksonukleaasin välillä on se endonukleaasit katkaisevat nukleotidien väliset sidokset nukleiinihappomolekyylissä, kun taas eksonukleaasit katkaisevat sidoksen nukleotidien välillä nukleiinihappomolekyylin 3 'tai 5' päissä.

SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on nukleaasi
3. Mikä on endonukleaasi
4. Mikä on eksonukleaasi
5. Vertailu rinnakkain - endonukleaasi vs eksonukleaasi
6. Yhteenveto

Mikä on nukleaasi?

Nukleaasi on entsyymi, jolla on kyky katkaista fosfodiesterisidokset nukleiinihappojen nukleotidien välillä. Se kuuluu hydrolaasientsyymiryhmään, koska hydrolysoi nukleotidien välisiä kemiallisia sidoksia. Tämä entsyymi on välttämätön soluissa ja bioteknologisissa prosesseissa, kuten geenien kloonauksessa, yhdistelmä-DNA-tekniikassa, RFLP, AFLP, geenisekvensointi, geeniterapia, genomikartoitus jne. Tapahtuvissa luonnollisissa DNA: n korjausmekanismeissa..

Nukleaaseja on kahta päätyyppiä: ribonukleaasi ja deoksiribonukleaasi, jotka toimivat ja rikkovat kemialliset siteet RNA: n ja vastaavasti DNA: n monomeerien välillä. Nukleaasien vaikutuskohdan mukaan ne luokitellaan edelleen kahteen ryhmään, nimittäin endonukleaasi ja eksonukleaasi. Endonukleaasit tunnistavat nukleiinihappojen spesifiset sekvenssialueet ja katkaisevat fosfodiesterisidokset nukleiinihappojen keskellä sijaitsevien nukleotidien välillä. Eksonukleaasit pilkkovat fosfodiesterisidoksia nukleotidien välillä, jotka sijaitsevat nukleiinihappojen päissä.

Kuvio 1: nukleaasiaktiivisuus

Mikä on endonukleaasi?

Endonukleaasi on nukleaasityyppi, joka katkaisee nukleiinihapot keskeltä. Se tunnistaa nukleiinihappojen spesifiset nukleotidisekvenssit ja katkaisee nukleotidien väliset kemialliset siteet. Ne tunnetaan myös nimellä restriktioendonukleaasit koska ne etsivät spesifisiä restriktiokohtia ja katkaisevat sidoksen ja tuottavat restriktiofragmentteja. Yli 100 restriktioendonukleaasia tunnistetaan bakteereissa ja arhaassa ja niitä saadaan kaupallisiin tarkoituksiin.

Restriktioendonukleaaseja käytetään laajasti biotekniikassa. Niillä on tärkeä rooli molekyylikloonauksessa. Suurin osa niistä on dimeerisiä entsyymejä, jotka koostuvat kahdesta proteiini-alayksiköstä. Kaksi proteiini-alayksikköä kääri kaksijuosteisen DNA: n ja lohkoivat molemmat juosteet erikseen molemmilta puolilta. Bakteereissa on satoja tyyppejä restriktioendonukleaaseja, joilla on ainutlaatuiset tunnistuskohdat. Koska restriktiossa on suuri spesifisyys, ne pilkkoutuvat vain spesifisissä sekvensseissä. Siksi niitä pidetään erittäin hyödyllisinä molekyylin työkaluina yhdistelmä-DNA-tekniikassa. Ilman restriktioendonukleaaseja rekombinantti-DNA-molekyylin tuotanto ei ole mahdollista. Rekombinantti-DNA-molekyylin luominen on perusvaihe useimmissa molekyylisissä biologisissa tekniikoissa.

Seuraava esimerkki auttaa lukijoita ymmärtämään restriktioendonukleaasien yksilöllisen sekvenssin tunnistamisen.

BamHI on restriktioendonukleaasi, joka etsii seuraavaa restriktiopaikkaa DNA-molekyylissä (kohta näytetään punaisilla kirjaimilla).Kun BamHI katkaisee nukleiinihapon restriktiokohdasta, se tuottaa seuraavat kaksi fragmenttia.EcoRI on toinen restriktioendonukleaasi, joka on erittäin hyödyllinen yhdistelmä-DNA-tekniikassa, joka vaikuttaa sen spesifiseen restriktiotunnistuspaikkaan ja katkaisee DNA: n kuten kuvassa 2 esitetään..

Kuvio 2: EcoRI

Mikä on eksonukleaasi?

Eksonukleaasi on nukleaasientsyymi, joka katkaisee kemialliset sidokset nukleotidien välillä nukleiinihappoketjujen 3'- tai 5'-päissä. Se hajottaa yksittäiset nukleotidit ketjun päässä ja tuottaa nukleosideja siirtämällä fosfaattiryhmiä veteen. Eksonukleaaseja löytyy arhaasta, bakteereista ja eukaryooteista. E-colissa on läsnä 17 erilaista eksonukleaasia, mukaan lukien DNA-polymeerit 1, 2 ja 3. Useilla DNA-polymeraaseilla on 3 '- 5' eksonukleaasinkestävä vaikutus.

Eksonukleaasit ovat tärkeitä DNA: n korjaamisessa, geneettisessä rekombinaatiossa, mutaatioiden esiintymisen estämisessä, genomien stabiloinnissa jne..

Kuvio 3: E Colin RecBCD: n eksonukleaasiaktiivisuus

Mitä eroa on endonukleaasilla ja eksonukleaasilla??

Endonukleaasi vs eksonukleaasi
Endonukleaasi on eräänlainen nukleaasientsyymit, joka katkaisee nukleotidien väliset sidokset nukleiinihappomolekyylissä.	Eksonukleaasi on nukleaasientsyymityyppi, joka katkaisee nukleotidien välisen sidoksen nukleiinihappomolekyylin 3'- tai 5'-päissä.
Lopputuotteet
Endonukleaasit tuottavat oligonukleotidirekription fragmentteja	Eksonukleotidit tuottavat nukleosideja
Toimia
Ne rikkovat fosfodiesterisidoksia ja tuottavat restriktiofragmentteja. Mutta ne poistavat nukleotidit yksitellen.	Ne poistavat nukleotidit yksi kerrallaan nukleiinihappojen päistä.
esimerkit
Esimerkkejä ovat BamHI, EcoRI, Hind III, Hpa I, Sma I,	Esimerkkejä ovat eksonukleaasi I, eksonukleaasi III, RecBCD (eksonukleaasi V), RecJ-eksonukleaasi, eksonukleaasi VIII / RecE, eksonukleaasi IX, eksonukleaasi T, eksonukleaasi X jne..

Yhteenveto - endonukleaasi vs eksonukleaasi

Nukleaasit vastaavat fosfodiesterien kemiallisten sidosten katkeamisesta nukleiinihappojen nukleotidien välillä. Nukleaasit voivat toimia nukleiinihappoketjun sisällä tai sen päissä. Vaikutuskohdan mukaan organismeista löytyy kahta päätyyppiä nukleaaseja. Ne ovat endonukleaasia ja eksonukleaasia. Endonukleaasit leikkaavat nukleotidejä ketjun keskeltä, kun taas eksonukleaasit pilkkovat nukleotidejä nukleiinihappoketjun päistä. Endonukleaasit ovat erittäin tärkeitä rekombinantti-DNA-tekniikassa, koska ne tunnistavat spesifiset emässekvenssit nukleiinihappoketjussa ja katkaisevat sidokset nukleotidien välillä.

Viite:
1. "Restriktioentsyymi." Restriktioentsyymi | Open Access -artikkelit | Open Access -lehdet | Konferenssijulkaisut | Toimittajat | Tekijät | Arvioijat | tieteelliset tapahtumat. N.p., n.d. Web. 11. maaliskuuta 2017
2.Pingoud, Alfred ja Albert Jeltsch. "Tyypin II restriktioendonukleaasien rakenne ja toiminta." Nukleiinihappojen tutkimus. Oxford University Press, 15. syyskuuta 2001. Web. 11. maaliskuuta 2017
3.Lovett, Susan T. "Escherichia colin DNA-eksonukleaasit." EcoSal Plus. Yhdysvaltain kansallinen lääketieteellinen kirjasto, joulukuu 2011. Web. 11. maaliskuuta 2017

Kuvan kohteliaisuus:
1. ”Rajoittava entsyymi Eco RI” kirjoittanut Tinastella - Oma työ (Public Domain) Commons Wikimedian kautta
2. ”HR RecBCD RecA” kirjoittanut Emw2012 - Oma työ (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta