Ero ylä- ja alavirran DNA n välillä

Avainero - Upstream vs Downstream DNA
 

On tärkeää, että sinulla on yleinen tieto DNA: n koostumuksesta ja rakenteesta ymmärtää eroa ylä- ja alavirran DNA: n välillä. DNA koostuu polynukleotidiketjuista. Nukleotidit ovat rakennuspalikoita, jotka luovat polynukleotidiketjuja, ja jokainen nukleotidi on valmistettu kolmesta komponentista: viiden hiilen sokeri, typpipitoinen emäs ja fosfaattiryhmä. Fosfaattiryhmä ja OH-ryhmä ovat kiinnittyneet nukleotidin sokerimolekyylin 5'-aseman hiileen ja 3'-aseman hiileen. Nukleotidit yhdistetään fosfodiesterisidoksilla, jotka muodostuvat yhden nukleotidin 5 'fosfaattiryhmän ja viereisen nukleotidin 3' OH-ryhmän väliin. Jos polynukleotidiketjulla on vapaa 5'-fosfaattiryhmä, sille osoitetaan 5'-pää; jos siinä on vapaa 3 'OH-ryhmä, se osoitetaan 3'-pääksi. Siksi DNA-juosteilla on yleensä 5'- ja 3'-päät polynukleotidiketjujen pääteasemien mukaisesti. DNA esiintyy myös kaksijuosteisena muotona. Kaksi säiettä ovat vastakkaisia ​​toisiinsa nähden. Siksi DNA: lla on kaksi juostetta, jotka kulkevat suuntaan 5 '- 3' ja 3 '- 5'. Ylä- ja alavirran DNA: han viitataan viitaten 5 '- 3' mRNA-juosteen transkriptioon ja synteesiin. Jos DNA: ta tarkastellaan koodaavan juosteen 5 päätä kohti transkription aloituskohdasta, se tunnetaan ylävirran DNA: na. Jos DNA: ta tarkastellaan transkription aloituskohdan koodaavan juosteen 3'-päätä kohti, kutsutaan alavirran DNA: ksi. Tämä on avainero ylä- ja alavirran DNA: n välillä.

SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on ylävirran DNA
3. Mikä on alavirran DNA
4. Vertailu rinnakkain - Upstream vs Downstream DNA
5. Yhteenveto

Mikä on ylävirran DNA?

Geeni on rakenteellinen ja toiminnallinen yksikköperinnöllisyys, joka sijaitsee organismin DNA: ssa. Se varastoidaan ohjeiden kanssa proteiinin rakentamiseksi. Geenillä on tietty DNA-molekyylin alue. Tarvittaessa se transkriboi ja transloi proteiiniksi mRNA-juosteen synteesin avulla. Normaalisti geenin koodaava juoste kulkee suunnasta 5 '- 3'. Kun se transkriptoidaan, se tuottaa mRNA-juosteen samaan suuntaan 5 '- 3'. Transkription aikana 3 '- 5' antisense-juostea käytetään templaattilangana ja se aloittaa mRNA-synteesin. Geenissä on transkription aloituskohta. Viitaten transkription aloituskohtaan, DNA-alue, joka kohti koodaavan juosteen 5'-päätä, tunnetaan ylävirran DNA: na. Geenin promoottori sijaitsee normaalisti DNA: n ylävirran alueella. Eukaryoottisissa geeneissä on TATA-laatikoita, promoottorin proksimaalisia elementtejä ja tehostajaita geenin ylävirtaan nähden. Geenin ylävirran alueelle viitataan negatiivisilla numeroilla. Geenin ylävirran DNA on erittäin tärkeä transkriptiolle.

Mikä on alavirran DNA?

Transkription aloituskohta tunnetaan geenin +1-pisteenä. DNA-alue +1-pisteestä kohti koodaavan juosteen 3'-päätä tunnetaan alavirran DNA: na. Toisin sanoen geenin alavirtaan on transkription aloituskohdasta kohti templaattiketjun 5'-päätä. Siksi geenialueen alavirran DNA sisältää transkriptioyksikön ja muut sekvenssit, kuten terminaattorisekvenssin. Promoottori voi vaikuttaa geenin alavirran sekvenssiin. Geenin alavirran osaan viitataan positiivisilla numeroilla. Geenin alavirran DNA on todellinen alue, joka antaa proteiinituotteen.

Kuvio 01: ylä- ja alavirran DNA

Mikä on ero ylävirran ja alavirran DNA: n välillä?

Upstream vs Downstream DNA
DNA-alue kohti koodaavan sekvenssin 5'-päätä transkription aloituskohdasta tunnetaan ylävirran DNA: na.	DNA-alue kohti koodaavan juosteen 3'-päätä transkription aloituskohdasta tunnetaan alavirran DNA: na.
elementit
Promoottorit ja tehostajat sijaitsevat ylävirran DNA: ssa	Transkriptioyksikkö ja terminaattorisekvenssit sijaitsevat alavirran DNA: ssa.
numerointi
Ylävirran alueen nukleotideille viitataan negatiivisilla lukuilla	Nukleotideille viitataan positiivisilla lukuilla.
Toimia
Tämä alue sisältää elementit, jotka ovat tarpeen transkription säätelemiseksi ja aloittamiseksi	Tämä alue sisältää ohjeet proteiinin tuottamiseksi ja transkription lopettamiseksi

Yhteenveto - Upstream vs Downstream DNA

RNA-juosteen ylä- ja alavirtaan on helppo tunnistaa. Vertailukohdan suhteen alue RNA-juosteen 5'-päätä kohti tunnetaan ylävirran RNA: na, kun taas alue 3'-päätä kohti tunnetaan alavirran RNA: na. DNA: ssa on kuitenkin kaksi säiettä, jotka kulkevat molemmissa suunnissa 5 '- 3' ja 3 '- 5'. Siksi ero ylävirran ja alavirran DNA: n välillä on monimutkainen. Siksi se erotetaan geenin transkriptiosta. Transkription aloituskohdasta kohti sense-juosteen 5 päätä DNA-alue tunnetaan ylävirran DNA: na, kun taas transkription aloituskohdasta kohti sense-juosteen 3'-päätä tunnetaan alavirran DNA: na. Tämä on ero DNA: n ylävirran ja alavirran välillä.

Viitteet:
1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi ja Jonatha M. Gott. "Erotetut roolit sekvensseille, jotka sijaitsevat ylä- ja alavirtaan Physarumediting-kohdista." RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, syyskuu 2009. Verkko. 18. maaliskuuta 2017

Kuvan kohteliaisuus:
1. Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro ja Luísa Romão. "Geeniekspression sääntely ylävirtaan avoimissa lukukehyksissä ja ihmisen sairauksissa." PLOS-genetiikka. Tieteen julkinen kirjasto, n.d. Web. 18. maaliskuuta 2017.