Ero transposonin ja retrotransposonin välillä

Transposon vs Retrotransposon

Transposonit ja retrotransposonit ovat DNA: n geneettisiä komponentteja, ja niiden välillä on suuria eroja. Näiden geenimateriaalien prosentuaalinen läsnäolo vaihtelee lajeittain, ja niiden toiminnot määräävät organismin kohtalot mutaatioilla ja muilla fenotyyppisesti tärkeillä muutoksilla. Transposonit ja retrotransposonit ovat geenejä tai tiettyjen geenien kokoelmia, jotka sijaitsevat DNA-juosteissa, ja niiden sijainnin muutokset ovat olleet pääasialliset syyt näille seurauksille. Tämän artikkelin tarkoituksena on kuitenkin keskustella lyhyesti näiden geenien toiminnoista ja esittää vertailu transposonien ja retrotransposonien välillä.

Mikä on Transposon?

Transposonit ovat mielenkiintoisia fragmentteja tai DNA-segmenttejä, joilla on kyky muuttaa DNA-juosteen sijainti leikatun ja liitetyn mekanismin muodossa. Tämän transposonien liikkuvan luonteen vuoksi näitä kutsutaan hyppygeeneiksi. Transposoneja on kahta päätyyppiä, jotka tunnetaan luokan I transposoneina ja II luokan transposoneina. Yleensä luokan II tyypille viitataan transposoneina ja luokan I tyyppiin viitataan retrotransposoneiksi. Liikkuvien DNA-segmenttien leikkaus- ja liittämisprosesseja säätelee entsyymi transposaasi. Entsyymi sitoutuu transposonin molempiin päihin ja leikkaa DNA-juosteen fosfodiesterisidokset, eristää transposonin, siirtää sen kohdekohtaan ja sitoutuu uuteen sijaintiin. Tämä prosessi on kuitenkin mielenkiintoinen ymmärtää, koska jotkut transposonit voivat siirtyä vain tiettyihin paikkoihin vain johtuen emässekvenssien yhteensopimattomuudesta kohdekohdan kanssa. Geeneillä, joissa on yhden juosteen toinen pää, on sama emässekvenssi toisen yhden juosteen toisessa päässä, ovat transposoneja, joilla on tahmeat reunat, koska ne voivat sitoutua kohde-DNA-juosteen kohtiin samalla emässekvenssillä kuin tahmeissa päissä . Tämä geenien liikkuvuus voi kuitenkin aiheuttaa muutoksia genotyypissä sekä organismin fenotyypissä. Sitten tutkijat keksivät transposoneista ja geneettisesti muunnetut elintarvikkeet ja organismit edullisten räätälöintien mukaisesti annettiin sitten käyttöön. Erittäin tuottavat maatalouskasvit, lääkkeellisillä ominaisuuksilla varustetut antibiootit, karjaeläimet olivat joitain edullisesti kehitettyjä tuotteita sen jälkeen, kun Barbara McClintock keksi 1940-luvulla transposonit..

Mikä on Retrotransposon?

Retrotransposonit ovat luokan I transposoneja, ja ne liikkuvat genomin läpi kopioinnin ja liittämisen mekanismin kautta. Retrotransposonien liikkuvuusmekanismiin sisältyy muutama päävaihe, kuten DNA-juosteen geenisegmentin kopiointi RNA: hon, RNA-kopion siirtäminen kohdekohtaan, RNA-sekvenssin transkriptio takaisin DNA: han käänteistranskriptaasia käyttämällä ja insertio geenin geenin DNA-juosteen uuteen sijaintiin. Näiden retrotransposonien molemmissa päissä on yleensä pitkät päätetoistot, joissa on noin 1000 emäsparia, ja niitä käytetään näiden geenien tunnistusominaisuuksina. Nämä geenit monistuvat helposti genomin sisällä, ja retrotransposonien osuus ihmisen genomissa on noin 50%. Ne voivat olla varsin vaarallisia, koska AIDS: n, HIV: n ja T-soluleukemiaviruksen aiheuttavassa viruksessa on retrotransposoneja RNA-genomissaan. Itse asiassa nämä virukset voivat sitoa retrotransposonit mihin tahansa ihmisen DNA-juosteiden kohtaan käyttämällä käänteistranskriptaasia ja integraasia. Integraasientsyymi toimii samalla tavalla kuin luokan II transposonien transposaasi.