Ero RNASE A n ja RNASE H n välillä

Avainero - RNASE A vs. RNASE H
 

Ribonukleaasit ovat nukleaaseja, jotka hajoavat spesifisesti RNA: ta pienemmiksi yksiköiksi. Ne voidaan jakaa kahteen luokkaan; endoribonukleaaseja ja eksoribonukleaaseja. Endoribonukleaasi on endonukleaasi, joka voi joko hajottaa yksijuosteista tai kaksijuosteista RNA: ta. Se pilkkoo fosfodiesterisidokset RNA-polynukleotidiketjussa. Esimerkkejä ovat RNaasi A, RNaasi III, RNaasi T1, RNaasi P ja RNaasi H. Eksoribonukleaasi on eksonukleaasi, joka hajotti RNA: ta poistamalla terminaaliset nukleotidit RNA-molekyylin joko 5'- tai 3'-päästä. Esimerkkejä ovat RNase R, RNase II, RNase D ja RNase PH. avainero välillä RNASE A ja RNASE H on, että RNaasi A on haiman ribonukleaasi, joka hajottaa spesifisesti yksijuosteista RNA: ta pienemmiksi komponenteiksi, kun taas RNaasi H on epäspesifinen entsyymi, joka pilkkoo RNA-DNA-hybridi-RNA: n pienemmiksi yksiköiksi hydrolyyttisen mekanismin kautta.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on RNASE A
3. Mikä on RNASE H
4. RNASE A: n ja RNASE H: n väliset yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - RNASE A vs. RNASE H taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on RNASE A?

RNaasi A on haiman ribonukleaasi, joka katkaisee spesifisesti parittumattomat sytosiini- ja urasiilitähteet yksijuosteisen RNA: n 3'-päässä. RNaasi H toimii korkeammassa suolakonsentraatiossa (0,3 M tai korkeampi NaCl-konsentraatio). Hydrolyyttinen reaktio on kaksi vaihetta. Se muodostaa 3 'fosforyloituneen tuotteen 2', 3 'syklisen monofosfaattivälituotteen välityksellä. Vaikka se on spesifinen yksijuosteiselle RNA: lle korkeammalla suolakonsentraatiolla, se voi myös hajottaa kaksijuosteista RNA: ta ja RNA: ta RNA-DNA-hybridiissä alhaisemmalla NaCl-konsentraatiolla (alle 0,3 M NaCl).

Bruce Merrifield syntetisoi ensin tämän entsyymin. RNaasi A on erittäin suosittu entsyymi molekyylitutkimuksessa. Naudan haiman RNaasi A on esimerkki RNaasista A. Ja se on yksi vaikeimmista laboratoriossa käytetyistä entsyymeistä. Tämä entsyymi ei tarvitse kofaktoria aktiivisuuteensa. Se on erittäin lämpöstabiili entsyymi. RNaasi A on ensimmäinen entsyymi ja kolmas proteiini, jolle havaittiin oikea aminohapposekvenssi. Tämä entsyymi on hyvin pieni ja sillä on 124 aminohappoa ja molekyylimassa on 1 60000. Ja siinä on neljä histidiinitähdettä (His 12 ja His 119, jotka liittyvät katalyyttiseen reaktioon).

Kuva 01: RNaasi A

RNaasi A voidaan eristää keittämällä raakaa näytettä. Kiehuessaan kaikki muut entsyymit hajoavat jäljellä olevan RNaasi A: n. RNaasi A on uskomattoman vakaa entsyymi. Tämä entsyymi inhiboi ribonukleaasin estäjäproteiini-, raskasmetalli- ja uridiinivanadaattikomplekseja.

Mikä on RNase H?

RNaasi H on epäspesifinen ribonukleaasientsyymi, joka voi hajottaa RNA: ta RNA-DNA-hybridissä hydrolyyttisen reaktion avulla. RNaasi H katkaisee RNA: n 3'-O-P-sidoksen RNA-DNA-hybridi. Viime kädessä se tuottaa 3'OH- ja 5'-fosfaattipääteisiä tuotteita. DNA-replikaatiossa sillä on keskeinen rooli poistamalla RNA-aluke uusien DNA-juosteiden muodostumisen jälkeen. Laboratorio-olosuhteissa se hajottaa spesifisesti RNA: ta RNA-DNA-hybridi, mutta ei DNA: ta ja hybridisoitumatonta RNA: ta. Ja tätä entsyymiä käytetään yleensä RNA-templaatin tuhoamiseen sen jälkeen, kun ensimmäinen komplementaarinen DNA-juoste on muodostettu cDNA-synteesin aikana.

Kuvio 02: RNaasi H

RNase H: ta käytetään myös nukleaasisuojausmäärityksissä. Se voidaan sisällyttää myös poly-A-häntäpoistoon mRNA: sta. RNaasi H: lla on kyky tuhota koodaamaton RNA solun sisällä ja ulkopuolella. Metalli-ioneja vaaditaan kofaktoreina tätä proteiiniaktiivisuutta varten. Kelaattoria (EDTA) voidaan käyttää inhiboimaan RNase H -entsyymiä.

Mitkä ovat samankaltaisuudet RNASE A: n ja RNASE H: n välillä??

• Molemmat ovat luonteeltaan proteiineja.
• Molemmat ovat endoribonukleaasia
• Molemmat voivat hajottaa RNA: ta.
• Molemmat suorittavat hydrolyyttisiä reaktioita.
• Molekyylilaboratoriot käyttävät näitä molempia.

Mikä on ero RNASE A: n ja RNASE H: n välillä??

RNASE A vs. RNASE H
RNaasi A on haiman ribonukleaasi, joka katkaisee spesifisesti yksijuosteisen RNA: n parittomien sytosiini- ja urasiilitähteiden 3'-pään korkeammalla suolakonsentraatiolla.	RNaasi H on epäspesifinen ribonukleaasientsyymi, joka voi hajottaa RNA: ta RNA-DNA-hybridissä hydrolyyttisen reaktion kautta.
RNA: n poistumisen luonne
RNaasi A katkaisee spesifisesti yksijuosteisen RNA: n korkeammalla suolakonsentraatiolla.	RNaasi H katkaisee RNA: n RNA-DNA-hybridi.
Aktiivisuuden rinnakkaistekijöiden tarve
RNaasi A ei tarvitse kofaktoreita toimintaansa.	RNase H tarvitsee metalli-ioneja kofaktoreiksi toiminnassaan.
Proteiiniaktiivisuuden estäjät
Ribonukleaasin estäjäproteiini, raskasmetalli- ja uridiinivanadaattikompleksit estävät RNAaasi A -aktiivisuutta.	Kelaattori (EDTA) estää RNaasi H -aktiivisuutta.
RNA-alukkeen poisto DNA-replikaatiossa
RNaasi A: ta ei käytetä RNA-alukkeen poistoon DNA-replikaatiossa.	RNaasi H: ta käytetään RNA-alukkeen poistamiseen DNA-replikaatiossa
DNA-mallineen poisto komplementaarisessa DNA (C-DNA) -synteesissä
RNaasi A: ta ei käytetä RNA-templaatin poistoon komplementaarisen DNA (C-DNA) synteesin aikana.	RNaasi H: ta käytetään RNA-templaatin poistoon komplementaarisen DNA (C-DNA) synteesin aikana.
Poly-A-hännän poistaminen mRNA: sta, joka on hybridisoitu Oligoon (dt)
RNaasi A: ta ei käytetä poistamaan ”poly-A-häntää” mRNA: sta, joka on hybridisoitunut oligoon (dt).	RNaasi H: ta käytetään poistamaan “poly-A-häntä” mRNA: sta, joka on hybridisoitunut oligoon (dt)

Yhteenveto - RNASE A vs. RNASE H

Ribonukleaasit ovat nukleaasientsyymejä, joilla on kyky pilkkoa RNA pienemmiksi yksiköiksi. Niitä on kahta tyyppiä; endoribonukleaaseja ja eksoribonukleaaseja. Endoribonukleaasi on endonukleaasi, jolla on kyky hajottaa yksijuosteista tai kaksijuosteista RNA: ta. Ja se katkaisee fosfodiesterisidoksen RNA-polynukleotidiketjussa. RNaasi A ja RNaasi H ovat kaksi endoribonukleaasia. RNaasi A on haiman ribonukleaasi, joka pilkkoa spesifisesti parittumattomia sytosiini- ja urasiilitähteitä yksijuosteisen RNA: n 3'-päässä korkeammalla suolakonsentraatiolla. RNaasi H on epäspesifinen ribonukleaasientsyymi, joka voi hajottaa RNA: ta RNA-DNA-hybridissä hydrolyyttisen reaktion avulla. Tämä on ero RNaasi A: n ja RNaasi H: n välillä.

Lataa PDF RNASE A vs. RNASE H

Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainaushuomautuksen mukaisesti. Lataa PDF-versio tästä. RNASE A: n ja RNASE H: n ero

Viite:

1.Karuturi, kirjoittaja Amrutha. "17 on tiedettävä tosiseikkoja RNase A: sta." AG-blogi, 22. helmikuuta 2017. Saatavilla täältä
2. ”Ribonukleaasin.” Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5. tammikuuta 2018. Saatavilla täältä  

Kuvan kohteliaisuus:

1.'RNase A'By Koneella luettavaa kirjailijaa ei toimitettu. Vossman oletti (tekijänoikeusvaatimusten perusteella)., (CC BY-SA 2.5) Commons Wikimedian kautta
2.'RNase H fix'By Koneella luettavaa kirjailijaa ei toimitettu. Vossman oletti (tekijänoikeusvaatimusten perusteella)., (CC BY-SA 2.5) Commons Wikimedian kautta