Ero proteomiikan ja transkriptiikan välillä

Avainero - proteomiikka vs. transkriptiikka
 

Omic-tekniikka on nykyinen suuntaus, jossa organismin eri biomolekyylejä tarkastellaan kokonaisuutena kokoelman ominaisuuksien ja toimintojen suhteen. Omic-tekniikalla on laaja valikoima sovelluksia. Biologisen näytteen erilaiset oomiikat sisältävät genomiikan, proteomiikan, transkriptiikan ja metabolomian. Proteomiikkaan sisältyy elävien organismien kaikkien proteiinien täydellinen tutkimus. Se määritellään kaikkien organismissa ekspressoitujen proteiinien joukona, sen rakenteellisina ja toiminnallisina ominaisuuksina. Tästä syystä koko proteiinikomplekti muodostaa proteomin. Transkriptiikka on täydellinen tutkimus kaikista elävässä organismissa läsnäolevista RNA (mRNA) -molekyyleistä. Siten transkriptiikka käsittelee geenejä, jotka ilmenevät aktiivisesti elävässä organismissa. MRNA: n kokonaismäärästä elävässä organismissa viitataan transkriptioon. avainero välillä Proteomics ja Transcriptomics perustuu biomolekyylin tyyppiin. Proteomiikassa tutkitaan elävän organismin ekspressoitujen proteiinien kokonaismäärää, kun taas transkriptiikassa tutkitaan elävän organismin kokonais-mRNA: ta.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on proteomiikka?
3. Mikä on transkriptiikkaa
4. Proteomiikan ja transkriptiikan väliset yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - Proteomiikka vs. transkriptiikka taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on proteomiikka?

Termi proteomiikka keksittiin vuonna 1995, ja se määriteltiin alun perin kokonaisproteiinikomplementiksi solussa, kudoksessa tai organismissa. Edistymisen myötä proteomisissa tutkimuksissa sitä muutettiin sitten pidettäväksi kattoterminä, johon sisältyivät monet tutkimusalat. Tällä hetkellä proteomiikan aihealueella tutkitaan proteiinien rakennetta, orientaatiota, toimintoja, vuorovaikutuksia, modifikaatioita, sovelluksia ja proteiinien merkitystä. Siksi proteomiikan alalla tehdään tällä hetkellä paljon tutkimusta.

Ensimmäiset proteomitutkimukset tehtiin proteiinipitoisuuden tunnistamiseksi Escherichia coli. Kokonaisproteiinipitoisuuden kartoitus tehtiin käyttämällä kaksiulotteisia (2D) geelejä. Tämän onnistumisen jälkeen tutkijat siirtyivät karakterisoimaan kokonaisproteiinipitoisuuksia eläimissä, kuten marsuissa ja hiirissä. Tällä hetkellä ihmisen proteiinikartoitus tehdään käyttämällä 2D-geelielektroforeesia.

Proteomiikan sovellukset

Proteomiikan tutkimisella on monia etuja, koska proteiinit ovat suurimman osan aktiivisuudesta hallitsevia molekyylejä proteiinien katalyyttiominaisuuden vuoksi. Täten kokonaisten proteiinien tutkimus voi antaa tietoa organismin terveydentilasta. Jotkut sovellukset ovat;

1. Genomimerkinnät: Tutkimalla organismin proteiinipitoisuutta, aktiivisesta proteiiniyhdisteestä vastaavat tarkat genomit voidaan määrittää. Tässä skenaariossa kaikkien genomiikan tulokset, transkriptiikka ja proteomiikka ovat tärkeitä.
2. Taudin tunnistaminen / diagnostiikka: Proteomiikkaa käytetään sairauden tunnistamiseen vertaamalla terveitä ja sairaita
3. Suorittaa proteiiniekspressio tutkittu kokeilun aikana.
4. Proteiinimodifikaatiot ja vuorovaikutustutkimukset: Jotta proteiineja voitaisiin käyttää vitro olosuhteet tai ja in vivo olosuhteissa, jotta voidaan päättää näiden uutettujen proteiinien varastointiolosuhteet ja tutkia proteiinin käyttäytymistä in vitro, in vivo ja in - silico - menetelmät.

Kuva 01: Proteomiikka

Proteomiikkaan liittyy erilaisia ​​tekniikoita

1. Kokonaisproteiinin uutto ja proteiinien erottaminen käyttämällä 2D-geelielektroforeesia. Proteiinit voidaan erottaa myös korkean suorituskyvyn nestekromatografialla (HPLC).
2. Uutettujen proteiinien sekvensointi käyttämällä menetelmiä, kuten Edmundin sekvensointimenetelmää tai massaspektrometriaa.
3. Kun sekvenssit on tunnistettu, proteiinipitoisuuden rakenteelliset ja toiminnalliset ominaisuudet analysoidaan tietokonepohjaisilla ohjelmistoilla ja bioinformatiikan työkaluilla.

Mikä on transkriptiikka?

Transkriptometrinen termi on keksitty äskettäin. Transkriptiikka on organismin kokonais-mRNA-pitoisuuden tutkimus. Kokonais-mRNA on ekspressoitunut DNA elävässä organismissa tai solussa. Täydelliseen mRNA-kokoelmaan viitataan transkriptona.

Vaiheet transkription analysointiin sisältävät,

1. RNA: n uutto, mRNA: n erottaminen käyttämällä pylväsgeelikromatografiaa poly DT-helmillä.
2. MRNA: n sekvensointi suoritetaan.

Microarray-tekniikka on yksi yleinen tapa tunnistaa organismin transkriptio. Mikromatriisitekniikka sisältää koetinlevyn, jolla on transkription komplementaariset juosteet. Hybridisaation yhteydessä organismissa tai soluissa esiintyvä mRNA voidaan karakterisoida.

Kuva 02: Transkriptiset tekniikat

Transkriptiikkaa käytetään nykyään laajalti lääketieteen alalla. Sairausdiagnostiikka ja sairauksien profilointi ovat pääaiheita, joilla transkriptiikkaa käytetään. Analysoimalla organismin transkriptio, vieraat mRNA: t voidaan tunnistaa, ja jos infektioita on, se voidaan tunnistaa. Ei-koodaava RNA voidaan erottaa käyttämällä transkriptisiä tekniikoita. Ja myös geenien ilmentymistä erilaisissa ympäristöstressissä voidaan seurata.

 Mitkä ovat proteomiikan ja transkriptiikan väliset yhtäläisyydet??

• Molemmat ovat osa omic-tekniikan käsitettä.
• Molempia käytetään taudin diagnostiikassa ja organismin sairauksien karakterisoinnissa.
• Molemmat tutkimusalueet sisälsivät biomolekyylin erottamisen, biomolekyylin erottamisen ja sekvensointivaiheet.

Mitä eroa on proteomiikan ja transkriptiikan välillä??

Protemics vs Transcriptomics
Proteomiikkaan sisältyy elävien organismien kaikkien proteiinien täydellinen tutkimus.	Transkriptiikka on täydellinen tutkimus kaikista elävässä organismissa läsnäolevista RNA (mRNA) -molekyyleistä.
Tutkittu biomolekyylityyppi
Proteiineja tutkitaan proteomiikassa.	mRNA: ta tutkitaan transkriptiikassa.
Tutkitut tekijät
Proteiineissa tutkitaan proteiinien rakennetta, toimintaa, vuorovaikutuksia, modifikaatioita ja sovelluksia.	Sekvenssirakennetta, vuorovaikutusta ympäristön kanssa ja mRNA: n sovelluksia tutkitaan transkriptiikassa.

Yhteenveto - Proteomiikka vs. transkriptiikka 

Omiikalla on tärkeä rooli biotieteiden alalla. Proteomiikalla tarkoitetaan proteiinin tutkimusta, joka muodostaa solun tai organismin täydelliset proteiinikokoelmat. Transkriptiikka viittaa transkription tutkimukseen, joka on mRNA: n muodossa olevan ekspressoidun DNA: n kokonainen sarja. Kaksi tutkimusaluetta, proteomiikka ja transkriptiikka, johdettiin genomiikan käyttöönoton jälkeen, ja niitä käytetään nykyisin laajalti lääketieteellisessä diagnostiikassa ja organismien karakterisoinnissa ja seulonnassa. Tämä on ero proteomiikan ja transkription välillä.

Lataa PDF Proteomics vs Transcriptomics -sovelluksesta

Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainauksen yhteydessä. Lataa PDF-versio täältä: Ero proteomiikan ja transkription välillä

Viite:

1.Horgan, Richard P ja Louise C Kenny. "Omic-tekniikat: genomiikka, transkriptiikka, proteomiikka ja metabolomiikka." Synnytyslääkäri ja gynekologi, Blackwell Publishing Inc, 18. heinäkuuta 2011. Saatavilla täältä  
2.Graves, Paul R. ja Timothy A. J. Haystead. "Molekyylibiologin opas proteomiikkaan." Mikrobiologian ja molekyylibiologian arvostelut, American Society for Microbiology, maaliskuu 2002. Saatavana täältä
3.Lowe, Rohan, et ai. "Transkriptiikkatekniikat." PLoS Computational Biology, Tiedekirjasto, toukokuu 2017. Saatavilla täältä  

Kuvan kohteliaisuus:

1.'Proteomics'By Xxl7441 englanninkielisessä Wikibooksissa - siirretty en.wikibooksista Commonsiin., (Public Domain) Commons Wikimediassa
2.'Mikromatriisi ja sekvensointivirtauskenno 'Thomas Shafee - Oma työ, (CC BY 4.0) Commons Wikimedian kautta