Ero proteomiikan ja aineenvaihdunnan välillä

avainero välillä proteomics ja metabolomics on se proteomiikka on organismin kaikkien proteiinien tutkimusta, kun taas metabolomiikka on kaikkien organismin metaboliittien tutkimusta.

Genomiikka on organismin geneettisen muodon tutkimus. Proteomics ja metabolomics ovat kaksi genomiikkaan liittyvää omitiedettä. Proteomi viittaa kaikkiin solun tai organismin proteiineihin. Metabolomi viittaa toisaalta kaikkiin organismin metaboliitteihin. Siten proteomitutkimus on proteomiikkaa, kun taas metabolomien tutkimus on metabomiaa. Sekä proteomiikka että meta-metiikka ovat tärkeitä sairauksien diagnosoinnissa sekä organismien karakterisoinnissa ja seulonnassa. Lisäksi molemmat ovat yhteydessä moniin solubiologian näkökohtiin, erityisesti solujen signalointiin, proteiinien hajoamiseen ja luomiseen sekä translaation jälkeiseen modifikaatioon.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on proteomiikka?
3. Mikä on aineenvaihdunta
4. Proteomiikan ja aineenvaihdunnan väliset yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - proteomiikka vs. aineenvaihdunta taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on proteomiikka?

Proteomi on solun, kudoksen tai organismin kokonaisproteiinikomplementti. Siksi proteomiikka on organismin proteomin tutkimus. Proteomiikassa analysoidaan proteiinien erilaisia ​​ominaisuuksia. Siksi proteomiikka keskittyy pääasiassa proteiinien rakenteeseen, orientaatioon, toimintoihin, proteiinien vuorovaikutuksiin, muunnoksiin, sovelluksiin ja tärkeyteen. Siksi monia proteomiikan tutkimusprojekteja toteutetaan tällä hetkellä.

Ensimmäiset proteomitutkimukset tehtiin proteiinipitoisuuden tunnistamiseksi Escherichia colissa. Kokonaisproteiinipitoisuuden kartoitus tehtiin käyttämällä kaksiulotteisia (2D) geelejä. Projektin onnistumisen jälkeen tutkijat siirtyivät karakterisoimaan kokonaisproteiinipitoisuus eläimissä, kuten marsuissa ja hiirissä. Tällä hetkellä ihmisen proteiinikartoitus tehdään käyttämällä 2D-geelielektroforeesia.

Proteomiikan tutkimisella on monia etuja, koska proteiinit ovat suurimman aktiivisuuden hallitsevat molekyylit johtuen proteiinien katalyyttiominaisuudesta. Täten kokonaisten proteiinien tutkimus voi antaa tietoa organismin terveydentilasta. Lisäksi proteomiikalla on monia sovelluksia genomien merkinnöissä, sairauksien tunnistamisessa ja diagnostiikassa, proteiiniekspressiotutkimusten suorittamisessa kokeiden aikana sekä proteiinimodifikaatioissa ja vuorovaikutustutkimuksissa jne..

Kuva 01: Proteomiikka

Proteomiikkaan liittyy erilaisia ​​tekniikoita, mukaan lukien kokonaisproteiinin uuttaminen, niiden erottaminen 2D-geelielektroforeesilla, uutettujen proteiinien sekvensointi käyttämällä menetelmiä, kuten Edmundin sekvensointimenetelmä tai massaspektrometria, ja proteiinin rakenne- ja toiminnallisten ominaisuuksien analysointi käyttämällä tietokonepohjaiset ohjelmistot ja bioinformatiikan työkalut.

Mikä on aineenvaihdunta?

Metabolomiikka on kaikkien solussa, kudoksessa tai organismissa olevien metaboliittien tutkimus. Se sisältää solun metaboliittien tunnistamisen ja kvantifioinnin käyttämällä erilaisia ​​edistyneitä analyyttisiä ja tilastollisia välineitä. Metabolomiikka on tärkeä tutkimus, koska se paljastaa tietoa organismin aineenvaihdunnasta.

Kuva 02: Metabolomiikka

Metabolisten reaktioiden substraattien ja tuotteiden tutkimiseksi metabolia käyttää massaspektrometriaa analyyttisenä alustana. Massaspektrometria johtaa metaboliiteihin ja niiden pitoisuuksiin, mikä heijastaa solujen tai kudosten todellista biokemiallista tilaa. Siksi metaboliikkaa voidaan pitää parhaana esityksenä organismin molekyylifenotyypistä. Näiden lisäksi metaboliitiaa voidaan pitää proteomiikan jatkeena, koska suurin osa metaboliiteista syntyy proteiineja sisältävien entsyymien toiminnan takia.

Mitkä ovat proteomiikan ja aineenvaihdunnan väliset yhtäläisyydet??

• Proteomics ja metabolomics ovat kaksi genomiikkaan liittyvää omitiedettä.
• Metabolomiaa voidaan pitää proteomiikan jatkeena.
• Proteomeja ja metabolomeja ovat tiiviisti sidoksissa moniin tutkimuksiin.

Mikä on ero proteomiikan ja aineenvaihdunnan välillä?

Proteomiikka on laajamittainen tutkimus proteiineista, mukaan lukien niiden rakenne ja toiminta solussa tai organismissa. Samaan aikaan metaboliikka on solujen, kudosten tai organismien metaboliittiprofiilien tutkimusta tietyissä olosuhteissa. Joten, tämä on keskeinen ero proteomiikan ja metaboliikan välillä. Lisäksi proteomiikka koskee pääasiassa koko proteiinikokonaisuutta, kun taas metabolomiikka koskee pääasiassa koko metaboliittisarjaa, mukaan lukien monipuolinen joukko pieniä molekyylejä, kuten peptidit, hiilihydraatit, lipidit, nukleosidit ja eksogeenisten yhdisteiden kataboliset tuotteet jne. Siksi tämä on toinen ero proteomiikan ja metaboliikan välillä.

Alla oleva infografia esittää yhteenvedon proteomiikan ja metaboliikan välillä.

Yhteenveto - Proteomics vs Metabolomics

Eläviä organismeja voidaan tutkia niiden genomin, proteiinien ja metaboliittien avulla. Genomiikka, proteomiikka ja metabolomiikka ovat kolme alaa, jotka tutkivat solun tai organismin geneettistä rakennetta, proteiineja ja metaboliitteja. Proteomiikka on tärkeää, koska se on sekä geenien että ympäristön dynaaminen heijastus. Metabolomiikka on erittäin tärkeää, koska se heijastaa suoraan solujen biokemiallisen reaktion nykyistä tilaa tai organismin metabolista tilaa. Siten tämä yhteenveto eroa proteomiikan ja metaboliikan välillä.

Viite:

1. P, Surat. "Kuinka aineenvaihdunta ja proteomeet liittyvät toisiinsa?" Uutiset, 26. helmikuuta 2019, saatavana täältä.
2. Horgan, Richard P ja Louise C Kenny. ”SAC Review 'Omic' Technologies: genomiikka, transkriptiikka, proteomiikka ja aineenvaihdunta." Synnytyslääketiede ja gynekologia, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18. heinäkuuta 2011, saatavana täältä.

Kuvan kohteliaisuus:

1. “Proteomics” kirjoittanut Xxl7441 englanniksi Wikibooks - siirretty en.wikibooksista Commonsiin. (Public Domain) Commons-Wikimedian kautta
2. “Metabolomics schema” Lmaps (keskustelu) - Loin tämän teoksen kokonaan itse (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta