Peptidi vs. proteiini
Aminohapoihin, peptideihin ja proteiineihin viitataan usein toisiinsa liittyvinä termeinä, mutta niiden ominaisuudet eroavat toisistaan. Aminohapot ovat sekä peptidien että proteiinien rakennuspalikoita. Aminohappo on pieni molekyyli, joka sisältää aminoryhmän (-NH2) ja karboksyylihapporyhmä (-COOH), jotka ovat sitoutuneet keskushiiliatomiin, ylimääräisellä vedyllä ja sivuketjulla (R-ryhmä). Tämä sivuketju vaihtelee kaikkien aminohappojen välillä; joten se määrittelee kunkin aminohapon ainutlaatuiset merkit ja kemia. Erityistä geenisekvenssiä käytetään määrittämään aminohapposekvenssi sekä peptideissä että proteiineissa.
peptidi
Peptidit koostuvat kahdesta tai useammasta aminohaposta, jotka on kytketty peptidisidoksilla ja jotka ovat läsnä lineaarisina ketjuina. Peptidin pituus määräytyy siinä olevien aminohappojen määrän mukaan. Yleensä peptidin pituus on alle noin 100 aminohappoa.
Etuliitteitä käytetään kuvaamaan peptidien tyyppiä yleisessä terminologiassa. Esimerkiksi, kun peptidi on valmistettu kahdesta aminohaposta, sitä kutsutaan dipeptidiksi. Samoin kolme aminohappoa yhdistetään tuottamaan tripeptidejä, neljä aminohappoa yhdistetään tuottamaan tetrapeptidejä jne. Näiden tyyppien lisäksi on olemassa oligopeptidejä (koostuvat 2-20 aminohaposta) ja polypeptidejä, joissa on paljon peptidejä (vähemmän kuin 100). Peptidien tärkeimmät ominaisuudet määritetään aminohappojen määrän ja sekvenssin avulla.
Useimpien peptidien ensisijainen tehtävä on sallia tehokas viestintä kuljettamalla biokemiallisia viestejä kehosta paikasta toiseen.
proteiini
Proteiinit ovat biologisten makromolekyylien monimuotoisin ryhmä. Proteiini koostuu yhdestä tai useammasta pitkästä haarautumattomasta ketjusta, jota kutsutaan polypeptideiksi, ja silti proteiinien rakennuspalikat ovat aminohappoja. Aminohapposekvenssi määrää proteiinin pääominaisuudet, kun taas tämä aminohapposekvenssi määritetään tietyllä geenisekvenssillä.
Yleensä proteiineilla on vakaa kolmiulotteinen rakenne. Näistä rakenteista voidaan keskustella neljän tason hierarkian avulla; ensisijainen, toissijainen, tertiäärinen ja kvaternäärinen. Ensisijainen rakenne on proteiinin aminohapposekvenssi. Sekundäärinen rakenne tuotetaan muodostamalla vety sidoksia kahden lähellä olevan aminohapon välillä, jolloin tuloksena ovat rakenteet, joita kutsutaan p-päällystetyiksi levyiksi, ja kelat, joita kutsutaan a-helikteiksi. Toissijaisen rakenteen alueet taitetaan sitten edelleen avaruuteen proteiinin viimeisten kolmiulotteisten rakenteiden muodostamiseksi. Useiden polypeptidien järjestely avaruudessa johtaa proteiinin kvaternääriseen rakenteeseen.
Proteiinien päätoiminnot ovat entsyymikatalyysi, puolustus, kuljetus, tuki, liike, säätely ja varastointi.
Mikä on ero peptidin ja proteiinin välillä??
• Peptidit ovat aminohappojen lyhyitä lineaarisia ketjuja, kun taas proteiinit ovat aminohappojen erittäin pitkiä ketjuja.
• Useat aminohapot on kytketty toisiinsa peptidisidoksilla peptidin muodostamiseksi, kun taas useat peptidit on kytketty toisiinsa proteiinimolekyylien muodostamiseksi.
• Tavallisesti proteiineilla on vakaa kolmiulotteinen rakenne. Sitä vastoin peptidejä ei ole järjestetty vakaaseen kolmiulotteiseen rakenteeseen.
• Peptidin pituus on alle noin 100 aminohappoa, kun taas proteiinin pituus on yli 100 aminohappoa. (Poikkeuksia on; siten erot riippuvat enemmän molekyylien toiminnasta kuin niiden kokoista)
• Toisin kuin peptidejä, proteiineja pidetään makromolekyyleinä.
• Peptideissä vain aminohappojen sivuketjut muodostavat vety sidoksia. Kun taas proteiineissa sivuketjut, mutta myös peptidiryhmät, muodostavat vety sidoksia. Nämä vety sidokset voivat olla veden tai muiden peptidiryhmien kanssa.
• Kaikki peptidit esiintyvät lineaarisina ketjuina, kun taas proteiinit voivat esiintyä primaarisina, sekundaarisina, tertiäärisinä ja kvaternäärisinä.