Ero maksimaalisen parsimon ja suurimman todennäköisyyden välillä

avainero suurimman sukupolven ja suurimman todennäköisyyden välillä riippuu menetelmästä, jota käytetään fylogeneettisen puun kehittämiseen. Enimmäiskertomus keskittyy minimoimaan kokonaismerkkitilat fylogeneettisen puun rakentamisen aikana, kun taas suurin todennäköisyys on tilastollinen lähestymistapa fylogeneettisen puun piirtämiseen riippuen geneettisen tiedon todennäköisyydestä.

Fylogeny on uusi lähestymistapa organismien luokitteluun ja nimikkeistöön. Fylogeny luottaa geenitietoihin ja evoluutiosuhteisiin. Geneettinen tieto on DNA-sekvensoinnin tulosta. Fylogeniassa organismien luokittelu tapahtuu yhteisen esi-isän perusteella. Suurin sikiögeneettisen suhteen todistus ja todennäköisyys lisäävät fylogeneettisen puun tarkkuutta ja luotettavuutta.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on enimmäiskertomus 
3. Mikä on suurin todennäköisyys?
4. Suurimman salamäärän ja suurimman todennäköisyyden väliset yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - Suurin parsimoni vs. suurin todennäköisyys taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on enimmäiskertomus?

Suurimman parsimoniotekniikan yhteydessä koko merkin tilan muutosten minimointi tapahtuu fylogeneettisen analyysin aikana. Fylogeneettinen on biologian haara, joka käsittelee evoluutiosuhteiden tutkimista. Fylogeneettinen puu on puu, joka näyttää evoluutiosuhteet yhteisen esi-isänsä pohjalta. Niinpä piirrettäessä fylogeneettistä puuta käsitettä maksimaalinen pariimonio, rinnakkaiskehityksen määrä minimoidaan. Siksi enimmäiskertomus tuottaa puun paljon nopeammin kuin muut menetelmät. Se johtuu siitä, että vain tärkeimpiä erottavia ominaisuuksia otetaan huomioon maksimituloksessa.

Kuva 01: Suurin mahdollisuus

Piirrättäessä enimmäisarvoista puuta, puu on aina mahdollisimman lyhyt puu minimaalisen taksonimäärän kanssa. Suurimman mahdollisen surullisen puun luotettavuus on kuitenkin erittäin korkea. Suurimpaan sukupuoleen perustuva fylogeneettisen suhteen tilastollinen johdonmukaisuus ja tarkkuus vaihtelevat. Lisäksi on olemassa monimutkaisia ​​algoritmeja, jotka analysoivat fylogeneettisen suhteen suurimman mahdollisen todistuksen.

Mikä on suurin todennäköisyys?

Suurin todennäköisyys on yksi eniten käytetyistä tilastollisista menetelmistä, jotka analysoivat fylogeneettisiä suhteita. Menetelmällä analysoidaan fylogeenisuus todennäköisyysmallin perusteella. Lisäksi tämä menetelmä ottaa huomioon sekä keskiarvon että varianssin. Siksi fylogeeniassa saadaan suurin mahdollinen todennäköisyys tietyn organismin annetulle geneettiselle tiedolle.

Kuva 02: Suurin todennäköisyys

Suurimman todennäköisyyden tilastollisen menetelmän käyttämisellä on sekä etuja että haittoja. Menetelmä on erittäin sopiva, kun analysoidaan yksinkertaista geneettistä tietoa sisältävää tietojoukkoa. Kun geneettisen tiedon variaatioaste on alhaisempi, suurin todennäköisyyspistemäärä on luotettava. Maksimaalisen todennäköisyyden kautta tuotetut tulokset vahvistavat edelleen tietyn fylogeneettisen suhteen enimmäiskerroinpisteet. Siksi maksimaalisen todennäköisyyden analyysi toimii varmentavana testinä.

Edellä mainittuihin etuihin verrattuna tämä menetelmä on hidas ja intensiivinen prosessi. Lisäksi yhden ainoan tietojoukon puuttuessa virhetuotos on korkea. Siten se tekee tulosten toistettavuuden vaikeammaksi myös suurimman todennäköisyyden estimoinnilla.

Mitkä ovat samansuuruisuudet suurimman mahdollisuuden ja suurimman todennäköisyyden välillä?

• Suurin mahdollisuus ja suurin mahdollinen todennäköisyys ovat kaksi lähestymistapaa, joilla on tärkeä rooli fylogeniassa.
• Molemmat tekniikat kuvaavat organismin suhdetta esivanhempiinsa käytettävissä olevien geneettisten tietojen perusteella.
• Fylogeneettiset puut voidaan tulkita käyttämällä sekä enimmäismäärää että maksimaalista todennäköisyyttä.
• Molemmissa tekniikoissa geneettinen tieto perustuu DNA-sekvensointiin tai RNA-sekvensointiin.
• Molemmat menetelmät ovat tärkeitä fylogeneettisten puiden luomisessa.

Mikä on ero maksimituloksen ja suurimman todennäköisyyden välillä?

Sekä maksimipitoisuus että suurin todennäköisyys ovat kaksi erilaista lähestymistapaa tulkittaessa fylogeneettistä puuta. Enimmäiskertomus uskoo muutamien ominaisuuksien analysoimiseen ja luonteen muutosten minimoimiseen organismista toiseen. Sitä vastoin maksimaalisen todennäköisyyden menetelmässä otetaan huomioon sekä keskiarvo että varianssi ja saadaan suurin todennäköisyys tietyn organismin annetulle geneettiselle tiedolle. Joten, tämä on avainero maksimaalisen sukupolven ja suurimman todennäköisyyden välillä.

Lisäksi pelkän enimmäiskertomuksen luotettavuus ei riitä johtopäätöksen tekemiseen. Mutta maksimaalisen todennäköisyyden menetelmä toimii varmentavana testinä maksimaalisen virheen tuloksille. Siksi johtopäätökset olisi tehtävä käyttämällä sekä enimmäisjäsenyyttä että maksimaalista todennäköisyyttä.

Alla oleva infografia on yhteenveto erotuksen maksimipitoisuuden ja suurimman todennäköisyyden välillä.

Yhteenveto - Suurin parsimoni vs. suurin todennäköisyys

Fylogenyllä on tärkeä rooli evoluutiosuhteiden saamisessa rakentamalla fylogeneettisiä puita. Enimmäiskertomus on tekniikka puun rakentamiseksi, jossa merkkitilan muutos on vähimmäismäärä. Sitä vastoin fylogeneettisen puun suurin todennäköisyys perustuu geneettisen tiedon maksimaalisen samankaltaisuuden käyttämiseen. Kummankin analyysin tiedot tulevat DNA- tai RNA-sekvenssitiedoista. Luotettavuus ja tarkkuus ovat korkeat, kun puun rakentaminen tapahtuu molemmilla tekniikoilla. Siten tämä tiivistää eron maksimaalisen sukupolven ja suurimman todennäköisyyden välillä.

Viite:

1. Elliott. "Kilpailu Parsimonyn ja todennäköisyyden välillä." OUP Akateeminen, Oxford University Press, 1. elokuuta 2004, saatavana täältä.

Kuvan kohteliaisuus:

1. ”Haporyhmän B2b enimmäiskerrospuu”, kirjoittanut Taboada-Echalar P, Álvarez-Iglesias V, Heinz T, Vidal-Bralo L, Gómez-Carballa A, Catelli L, et ai. (2013) Esikoloniaalisen ajanjakson geneettinen perintö nykyajan bolivialaisilla. PLOS ONE 8 (3): e58980. doi: 10.1371 / journal.pone.0058980 (CC BY 2.5) Commons Wikimedian kautta
2. ”Lactarius blennius ja relativs -tekijöiden maksimaalinen todennäköisyyspuu” Käyttäjä: Thkgk - Oma työ (CC0) Commons Wikimedian kautta