Genomiikka ja proteomiikka ovat kaksi tärkeää molekyylibiologian osa-aluetta. Genomi on organismin geneettinen materiaali. Se sisältää geenejä, jotka on kirjoitettu organismien geneettisillä tiedoilla (geneettiset koodit). Genomitietojen löytämiseksi tehdyt tutkimukset tunnetaan genomiksi. Geenin nukleotidisekvenssi määrittelee proteiinin aminohapposekvenssin geneettisen koodin kautta. Geenit transkriptoidaan mRNA: ksi ja mRNA transloidaan tarvittavien proteiinien tuottamiseksi. Proteomi edustaa organismin ekspressoituneita kokonaisproteiineja. Solun koko proteiinijoukon ominaisuuksien, rakenteiden, toimintojen ja ekspressioiden löytämiseksi suoritetut tutkimukset tunnetaan proteomiikana. Siten keskeinen ero genomiikan ja proteomiikan välillä on genomiikka on molekyylibiologian haara, joka tutkii organismin geenejä sillä aikaa proteomiikka on molekyylibiologian haara, joka tutkii solun kokonaisproteiineja. Genomiset tutkimukset ovat tärkeitä organismin geenien rakenteen, toiminnan, sijainnin ja säätelyn ymmärtämiseksi. Proteomitutkimukset ovat hyödyllisempiä, koska proteiinit ovat todellisia funktionaalisia molekyylejä soluissa ja edustavat todellisia fysiologisia olosuhteita.
SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on genomiikka?
3. Mikä on proteomiikka?
4. Vertailu rinnakkain - genomiikka vs. proteomiikka
5. Yhteenveto
Genomiikka on organismin koko genomin tutkimus. Se on tärkeä molekyylibiologian haara, joka käsittelee yhdistelmä-DNA-tekniikkaa, DNA-sekvensointia ja bioinformatiikkaa genomin (organismien täydellinen DNA-sarja) rakenteen ja toiminnan tutkimiseksi. DNA koostuu neljästä emäksestä, ja geenin geenitiedot on kirjoitettu neljällä emäksisellä kielellä, joita tarvitaan organismin muodostamiseen. Geenit ovat vastuussa proteiinien valmistuksesta, ja ne ovat DNA-yksiköitä, jotka sisältävät ohjeet tietyn proteiinin tai proteiinijoukon valmistamiseksi solussa. Siksi geeneistä tehdyt tutkimukset ovat todella tärkeitä monimutkaisten sairauksien, geneettisten häiriöiden, mutaatioiden, tärkeiden geenisääntöjen, geenien ja ympäristötekijöiden vuorovaikutuksen, sairauksien diagnosoinnin, hoitomuotojen ja hoitomuotojen ymmärtämiseksi jne. Siksi genomiset tutkimukset ovat erittäin tärkeitä tärkeää, koska se käsittelee kaikkia geenejä ja niiden vuorovaikutusta ja käyttäytymistä.
Kuva 01: Genomiikan käyttö
Proteiinit ovat välttämättömiä makromolekyylejä, joita löytyy soluista. Ne ovat tärkeitä monille organismissa esiintyville fysiologisille toiminnoille. Soluissa olevat proteiinit katalysoivat melkein kaikkia biokemiallisia reaktioita. Geeneihin tallennetaan geneettiset ohjeet proteiinien tuottamiseksi. Geneettinen koodi muunnetaan aminohapposekvenssiksi, joka määrittää tietyn proteiinin. Tämä prosessi on tunnettu geeniekspressio. Tarvittaessa geenit ekspressoidaan ja syntetisoidaan proteiineina. Solun koko proteiinijoukko tunnetaan proteomina. Solujen proteomien tutkimusta kutsutaan proteomiksi. Proteiinien rakenteet, ominaisuudet, vuorovaikutukset ja toiminnot tutkitaan proteomiikan alla tutkiakseen kuinka proteiinit vaikuttavat soluprosesseihin.
Organismit sisältävät tuhansia erilaisia proteiineja, jotka palvelevat erilaisia toimintoja soluissa. Genomitutkimukset tarjoavat avaintietoja proteomisten tutkimusten suorittamiseksi, koska geenit koodaavat mRNA-molekyylejä ja mRNA koodaavat proteiineja. Proteomiikan tutkimukset ovat tärkeitä monilla aloilla; tämä on erityisen hyödyllistä syöpäbiologiassa, jossa sitä voidaan käyttää epänormaalien proteiinien paljastamiseen, jotka johtavat syöpään.
Kuvio 02: Proteiinisynteesi
Genomiikka vs. proteomiikka | |
Genomiikka on organismin genomin tutkimus. Geenejä tutkitaan genomiikan alla. | Proteomiikka on solun kokonaisten proteiinien tutkimus. Proteiineja tutkitaan proteomiikan alla. |
Opintoalueet | |
Genomitutkimus kattaa genomikartoituksen, sekvensoinnin, ekspressioanalyysin, geenirakenneanalyysin jne. | Proteomiikka kattaa proteiinien karakterisoinnin, proteiinien rakenteen ja toiminnan tutkimuksen jne. |
Luokittelu | |
Kaksi päätyyppiä nimettiin rakennegenomiksi ja funktionaaliseksi genomiksi. | Kolme pääkategoriaa nimeltään rakenteellinen proteomiikka, funktionaalinen proteomiikka ja ekspressioproteomiikka. |
Oppimateriaalin luonne | |
Genomi on vakio. Jokaisella organismin solulla on samat geenit. | Proteome on dynaaminen ja vaihtelee. Eri kudoksissa tuotettujen proteiinien joukko vaihtelee geeniekspression mukaan. |
Genomiikka on organismin täydellisen genomin tutkimus. Proteomiikka on molekyylibiologian haara, joka tutkii solussa ekspressoitunutta kokonaista proteiinisarjaa ymmärtääkseen proteiinien rakennetta ja toimintaa ja miten proteiinit vaikuttavat soluprosesseihin. Genomiikka ei voi selittää solujen todellisia olosuhteita johtuen proteiinisynteesin aikana tapahtuneista translaation jälkeisistä modifikaatioista. Siksi proteomiikka on tärkeää ymmärtää solujen todelliset olosuhteet ja toiminnot. Tämä on ero genomiikan ja proteomiikan välillä.
Viitteet:
1. Rang, Jie, Hao He, Ting Wang, Xuezhi Ding, Mingxing Zuo, Meifang Quan, Yunjun Sun, Ziquan Yu, Shengbiao Hu ja Liqiu Xia. "Genomiikan ja proteomiikan vertaileva analyysi Bacillus thuringiensis 4.0718: ssa." YKSI. Tieteen julkinen kirjasto, n.d. Web. 1. huhtikuuta 2017.
2. Macaulay, Iain C., Philippa Carr, Arief Gusnanto, Willem H. Ouwehand, Des Fitzgerald ja Nicholas A. Watkins. "Verihiutaleiden genomiikka ja proteomiikka ihmisten terveydessä ja sairauksissa." Lehti kliinisestä tutkimuksesta. American Society for Clinical Research, 1. joulukuuta 2005. Web. 1. huhtikuuta 2017
Kuvan kohteliaisuus:
1. William Genchot - "Genome-en" - (Public Domain) Commons Wikimedian kautta
2. ”Genomian käyttäminen lääkeresistenssin syiden tunnistamiseen”, NHS: n kansallinen genetiikan ja genomin koulutuskeskus - Flickr (CC BY 2.0) Commons Wikimedian kautta