avainero geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden välillä on sekvenssityyppi, jota käytetään analysoitaessa saman lajin kahden populaation välistä etäisyyttä. Geneettinen etäisyys mittaa geneettistä eroa lajien tai lajien populaatioiden välillä, kun taas fyysinen etäisyys mittaa nukleotidien lukumäärää kahden merkin välillä.
Geneettinen etäisyys ja fyysinen etäisyys antavat kuvan evoluutiosuhteista lajin kahden populaation välillä. Siksi etäisyyskartat tarjoavat populaatioiden yhdistämisen geneettisen tiedon perusteella. Genomisekvensoinnilla ja bioinformatiikan analyysillä on tärkeä merkitys sekä geneettisen että fyysisen etäisyyden määrittämisessä.
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on geneettinen etäisyys?
3. Mikä on fyysinen etäisyys
4. Geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - geneettinen etäisyys vs. fyysinen etäisyys taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Geneettinen etäisyys on lajien tai populaatioiden välisen geneettisen erottelun mitta. Tätä etäisyyttä mitataan esi-isäsuhteiden ja evoluutiokuvioiden avulla. Geenien samankaltaisuus on tärkeä geneettisen etäisyyden mittauksessa. Geneettinen etäisyys määrittelee myös lajin etäisyyden esivanhempaansa. Lisäksi geneettisten etäisyyksien pääasiallinen käyttö on arvioitaessa populaatioiden välisiä suhteita ympäri maailmaa. Siksi se kuvaa ihmislajien populaatioita ympäri maailmaa perimäkuvioidensa perusteella.
Geneettiset etäisyydet lasketaan etsimällä lajien ja populaatioiden geneettinen samankaltaisuus kokonaisuutena. Siksi bioinformatiikalla on tärkeä rooli geneettisen etäisyyden määrittämisessä eri lajien ja populaatioiden välillä.
Lisäksi on olemassa erilaisia malleja, jotka edustavat populaatioiden välistä geneettistä etäisyyttä. Ne sisältävät Nein geneettisen etäisyyden, Cavalli-Sforzan ja Edwardsin mitat sekä Reynoldsin, Weirin ja Cockerhamin geneettisen etäisyyden.
Fyysinen etäisyys on nukleotidien lukumäärän mittaaminen kahden lajin tai populaation välillä. Siten laskettaessa fyysistä etäisyyttä mittaustaso menee edelleen monomeeritasoille. Tähän sisältyy yksittäisten nukleotidisekvenssien tai kokonaisten genomien analysointi kokonaisuutena. Markerigeenien fyysisellä etäisyydellä on tärkeä rooli niiden välisten nukleotidien määrän määrittämisessä.
Siksi, jos fyysinen etäisyys kahden populaation välillä kasvaa, myös geneettinen etäisyys kasvaa. Tämä voi puolestaan lisätä myös organismien monimutkaisuutta. Sekä geneettinen etäisyys että fyysinen etäisyys rakentavat yhdessä evoluutiosuhteen kahden populaation välillä.
Keskeinen ero geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden välillä riippuu sekvenssityypistä, joita käytetään etäisyyskartan laatimiseen. Geneettinen etäisyys on kahden populaation välinen etäisyys suhteessa geneettiseen eroon, kun taas fyysinen etäisyys mittaa nukleotidietäisyyksiä kahden populaation välillä.
Alla oleva infografika edustaa lisätietoja geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden eroista.
Geneettinen etäisyys ja fyysinen etäisyys viittaavat molemmat lajien kahden populaation väliseen evoluutio- ja esi-isäsuhteeseen. Siksi molemmat ovat tärkeitä päätelmän tekemiseksi evoluutioetäisyyksistä. Geneettisellä etäisyydellä tarkoitetaan kahden populaation välistä etäisyyttä suhteessa tiettyihin geneettisiin markkereihin, kun taas fyysinen etäisyys tarkoittaa etäisyyttä nukleotidisekvenssien välillä, jotka reunustavat valittuja merkkigeenejä. Siksi tämä on avainero geneettisen etäisyyden ja fyysisen etäisyyden välillä.
1. Beaumont, Mark A., et ai. ”Geneettisen etäisyyden mittaaminen.” SpringerLink, Springer, Dordrecht, 1. tammikuuta 1998, saatavana täältä.
2. ”Fyysinen etäisyys genetiikassa.” Elibrary, saatavana täältä.
1. ”Ihmisgeenien historia ja maantieteellinen luigi Luca Cavalli-Sforza -kartan geneettisyys”. Kirjoittaja Blank_map_of_world_no_country_borders.png: Ephert (keskustelu) -johdannaisteos: Ephert (keskustelu) - (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia -palvelun kautta