Atomi on pienin hiukkanen elementissä, jolla on elementin ominaisuudet. Atomia ei ole mahdollista hajottaa edelleen, jolloin elementin ominaisuudet säilyvät. Atomit eivät ole näkyvissä paljaalla silmällä ja ovat perusrakenteita. Esimerkiksi elementtikulta-atomeja ei voida hajottaa edelleen ja jokaisella atomilla on kullan ominaisuudet.
Molekyylit muodostetaan kahden tai useamman atomin yhdistelmällä. Toisin kuin atomit, molekyylit voidaan jakaa yksittäisiin atomiin. Atomit ovat sitoutuneet toisiinsa molekyylissä. Molekyylit eivät myöskään näy paljaalla silmällä, kun taas ne voidaan nähdä voimakkaasti suurentavilla mikroskoopeilla ja muilla tieteellisillä laitteilla. Vesi koostuu lukuisista vesimolekyyleistä. Jokainen vesimolekyyli koostuu yhdestä happiatomista ja kahdesta vetyatomista. Joten vesimolekyyli voidaan edelleen jakaa happi- ja vetyatomeihin. Mutta näitä atomeja ei voida jakaa alaryhmiin. Molekyylissä atomit ovat sitoutuneet toisiinsa yksin-, kaksois- tai kolmoissidoksilla.
Atomilla on ydin, jota ympäröivät elektronit. Elektronit ovat negatiivisesti varautuneita hiukkasia. Ydin sisältää neutroneja ja positiivisesti varautuneita protoneja. Suurimmasta osasta hiukkasia riippuen atomi voi olla positiivisesti tai negatiivisesti varautunut. Kun nämä varautuneet atomit sitoutuvat toisiinsa molekyylien muodostamiseksi, sidokset muodostuvat elektronien avulla, jotka täyttävät atomien ulkoradat. Koska atomit ovat itsenäisesti, atomissa ei ole sitoutumista.
Kun atomit yhdistyvät eri lukuina molekyylin muodostamiseksi, lopputulos voi vaihdella. Esimerkiksi, kun kaksi happiatomia yhdistyvät muodostaen molekyylin, siitä tulee O2, joka on happi, johon hengitämme. Mutta kun kolme happiatomia yhdistyvät muodostaen O3-molekyylin, siitä tulee otsoni. Joten toinen ero atomien ja molekyylien välillä on se, että kun samanlaiset atomit yhdistyvät toisistaan vaihtelevalla lukumäärällä, voidaan muodostaa molekyylejä, joilla on erilaisia ominaisuuksia. Mutta kun samanlaiset molekyylit yhdistyvät toisiinsa lukuisina lukuina, muodostuu yksinkertainen tuote.
Molekyyli on yleensä vakaa olemassa olemaan itsessään, mutta atomi ei ole itsessään stabiili. Tämä johtuu elektronien läsnäolosta atomeissa. Vain kun atomissa on riittävä määrä elektroneja, siitä tulee vakaa. Riittävä määrä elektroneja vastaanotetaan atomissa, kun kaksi atomia sitoutuvat toisiinsa ja jakavat elektroneja. Siksi siitä tulee stabiili ja muodostuu molekyyli. Kaikki atomit eivät voi sitoutua toisiinsa. Sidos riippuu atomien varauksesta ja kemiallisista ominaisuuksista.
Atomeja ja molekyylejä on läsnä kaikissa esineissä ja elävissä asioissa. Koostumus ja tiheys vaihtelevat esineiden paksuuden ja muodon mukaan. Kaasuissa molekyylit pakataan erittäin löysästi, jotta molekyylit voivat virtata helposti ympäri törmämättä. Nesteissä pakkaus on hiukan pienempi ja partikkelit ovat aina yhdessä. Kiinteissä aineissa pakkaus on kuitenkin hyvin kompakti ja tuskin mitään liikettä molekyyleihin sallitaan, mikä antaa esineelle kiinteän muodon.
Lisätietoja atomista ja molekyyleistä.