Vaikka antigeeni-vasta-ainevuorovaikutusten teoreettinen termodynamiikka tunnetaan hyvin, niiden käytännöllistä käyttöä autovasta-aineiden havaitsemiseen tai määrittämiseen on vähän. Funktionaalisten vasta-aineiden optimaalisen affiniteetin määrittäminen mahdollistaa maksimaalisen terapeuttisen hyödyn saavuttamisen. Vasta-aineiden affiniteettia on tutkittu melkein puoli vuosisataa, ja affiniteettikromatografian aloittamisesta kolme vuosikymmentä sitten, se on kehittynyt tehokkaaksi työkaluksi. Affiniteetti kuvaa vuorovaikutusta yksittäisessä sitoutumiskohdassa. Affiniteetin sekä rakenteen ja antigeenin ominaisuuksien tuntemus on välttämätöntä afiniteetin ja tehokkuuden välisen yhteyden arvioimiseksi toiminnalliselle vasta-aineelle. Affiniteetin lisäksi on kuitenkin myös toinen sitoutumiskonsepti, nimeltään avidity, joka on moniarvoisen antigeenin ja moniarvoisen vasta-aineen välisen vuorovaikutuksen kokonais sitomisvoima. Huolimatta selkeistä eroista näiden kahden välillä, affiniteettia ja aviditeettiä käytetään usein erottamattomasti. Katsotaanpa näitä kahta.
Affiniteetti on yhden vasta-ainemolekyylin paratopen sitoutumisvoima sen vastaavan epitoopin kanssa antigeenimolekyyliin. Se kuvaa vuorovaikutusta yksittäisessä sitoutumiskohdassa. Affiniteetin sekä rakenteen ja antigeenin ominaisuuksien tuntemus on välttämätöntä afiniteetin ja tehokkuuden välisen yhteyden arvioimiseksi toiminnalliselle vasta-aineelle. Se perustuu samoihin termodynaamisiin periaatteisiin, jotka säätelevät kaikkia palautuvia biomolekyylisiä vuorovaikutuksia, samaan sitomisvahvuuteen, jonka avulla immuunijärjestelmäsi voi torjua infektioita. Ja lujuus viittaa vasta-aineen ja sen antigeenin välisen spesifisen sidoksen lujuuteen. Tarkka ja tarkka affiniteetin arviointi antigeeni-vasta-ainevuorovaikutukselle on tärkeä mittaus afiniteettirajojen ja tehon ylärajan määrittämiseksi terapeuttiselle vasta-aineelle. Termodynaamisesti ilmaistuna affiniteetti ilmaistaan kaikkien houkuttelevien voimien summaamisena, mikä johtaa lisääntyneeseen sitoutumislujuuteen ja heijastusvoimiin, mikä johtaa vähentyneeseen sitoutumislujuuteen.
Avidity on jälleen yksi sitova käsite, joka sekoitetaan usein affiniteettiin; itse asiassa molemmat termit viittaavat sitoutumisvahvuuden käsitteeseen, paitsi aviditeetti viittaa polyklonaalisten vasta-aineiden seoksen antigeenisitomiskyvyn kokonaisvahvuuteen. Aviditeetti tulee kuvaan, kun moniarvoinen antigeeni sitoutuu liuoksessa olevaan kaksiarvoiseen vasta-aineeseen tai kun vasta-aine sitoutuu kahteen pinnalla olevaan monovalenssiin antigeenimolekyyliin. Toisin kuin affiniteetti, aviditeetti kuvaa vastaavasti moniarvoista sitoutumista ligandin ja ligaatin useiden sitoutumiskohtien välillä. Yksinkertaisesti sanottuna, aviditeetti on sitova voima moniarvoisen vasta-aineen ja moniarvoisen antigeenin välillä. Ilmavyyttä ei voida kuvata termodynaamisilla termeillä, ja se saadaan kineettisin mittauksin. Vasta-aineen aviditeetti riippuu yksittäisten vasta-aineiden sitoutumiskohtien affiniteeteista, mutta on suurempi kuin sitoutumisaffiniteetti, koska kaikki vasta-aine-antigeeni-vuorovaikutukset on hajotettava samanaikaisesti, jotta vasta-aine dissosioituu kokonaan..
Termejä affiniteetti ja aviditeetti käytetään joskus väärin synonyymeinä. Itse asiassa molemmat termit viittaavat sidontavoiman käsitteeseen. Affiniteettia määritellään termodynaamisella tavalla vasta-aineen ja antigeenin assosiaation asteen mittaamiseksi, kun taas moniarvoisen vasta-aineen moniarvoiseen antigeeniin sitoutumisen kokonaisvahvuuteen viitataan aviditeettinä tai muuten nimellä "funktionaalinen affiniteetti". Affiniteettia on vasta-aineen yhdistämispaikan sitoutumisen voimakkuus yhteen vastaavaan antigeeniepitooppiin, kun taas aviditeetti on polyklonaalisten vasta-aineiden seoksen antigeenisitomiskyvyn kokonaisvahvuus. Avidityksi kutsutaan myös funktionaalista affiniteettia.
Termi affiniteetti merkitsee vasta-aineen ja samanarvoisen ligandin, kuten hapteenin, sisäistä assosiaatiovakioita, kun taas termiä aviditeetti käytetään kuvaamaan vasta-aineiden ja moniarvoisen antigeenin välistä kokonais sitomisenergiaa. Assosiaatiovakio on vasta-aineen affiniteetin epitooppiin mitta. Ilmavyyttä ei voida kuvata termodynaamisilla termeillä, ja se saadaan kineettisin mittauksin. Termodynaamisesti ilmaistuna affiniteetti ilmaistaan läheisen etäisyyden molekyylien välisten houkuttelevien ja vastenmielisten voimien summana antigeenisen determinantin ja sen sitoutumiskohdan välillä..
Vasta-aineiden affiniteetilla voi olla kriittinen rooli vasta-aineiden biologisten aktiivisuuksien määrittämisessä. Joten on välttämätöntä kyetä karakterisoimaan vasta-ainevaste affiniteetin ja suuruuden suhteen, ja myös ymmärtämään, kuinka vasta-aineiden affiniteetti voi vaikuttaa tiettyyn määritykseen. Termiä aviditeetti käytetään joskus synonyymissä affiniteetin kanssa, mutta useimmiten sitä käytetään kuvaamaan vasta-aineiden kykyä muodostaa stabiileja komplekseja antigeenin kanssa. Aviditeetti on yksittäisten vasta-aineiden sitoutumiskohtien monien affiniteettien kertynyt vahvuus.
Termeistä affiniteetti ja aviditeetti käytetään eroistaan huolimatta usein erottamattomasti. Affiniteetti on yhden vasta-ainemolekyylin paratopen ja sen vastaavan epitoopin sitoutumisvoima antigeenimolekyyliin ja se voidaan määrittää vain yhdellä monovalenttisella Fab-fragmentilla. Se on kaikkien houkuttelevien voimien summaus, mikä johtaa lisääntyneeseen sitoutumislujuuteen ja heijastusvoimiin, mikä johtaa vähentyneeseen sitoutumislujuuteen. Aviditeetti sitä vastoin on sitova voima moniarvoisen vasta-aineen ja moniarvoisen antigeenin välillä, ja siihen viitataan myös toiminnallisena affiniteettina. Vasta-aineiden ja niitä vastaavien antigeenien välinen mitattu sitoutumisenergia heijastaa vasta-aineiden aviditeettiä. Toisin kuin affiniteetti, aviditeettiä ei voida kuvata termodynaamisilla termeillä, ja se saadaan kineettisin mittauksin.