Aivotärki on hyvin organisoitu välittäjärakenne, joka toiminnallisesti yhdistää aivokuoren selkäytimeen. Se käsittää vain 2,5% koko aivoista, mutta sillä on tärkeä tehtävä, joka on välttämätön ihmisen selviytymiselle. Sen tärkeimmät elintoiminnot ovat hengityksen, verenpaineen ja pulssin hallinta. Se on myös osa tietoisuudesta vastuussa olevaa järjestelmää. Se on aistien ja motoristen hermokuitujen kulkuväli, joka hengittää ruumiin eri osia. Se koostuu kolmesta rakenteesta, nimittäin keskiaivo, pons ja medulla. Keskiaivo on nimetty ylemmäksi aivorungiksi. Pons ja medulla muodostavat alemman aivorungon. Tärkeät sensori-, motoriset ja sekalaiset hermot syntyvät aivorinnasta, joka lopulta kulkee kalloon päästäkseen kohdeelimeensä.
Pons tulee latinan kielestä, mikä tarkoittaa kirjaimellisesti ”siltaa”. Se sisältää useita hermojohtamiskuituja, jotka on suunnattu pituussuunnassa, poikittain ja taaksepäin hermoimpulssien toimittamiseksi ympäröiviin rakenteisiin. Pongit sijaitsevat keskiaivojen ja nivelhampaan välissä. Sen takana on pikkuaivo. Sille on tunnusomaista kaksi sipulista rakennetta, joita kutsutaan ylemmäksi ja keskimmäiseksi pikkuaivoiksi. Nämä jalat yhdistävät aivorungon pontiiniosan pikkuaivoihin, mikä on hermorakenne, joka on välttämätön normaalin kävelyn ja tasapainon kannalta.
Poneista syntyy neljä tärkeää kallon hermoa, nimittäin vestibulokokolaarinen hermo (kahdeksas kallon hermo), kasvohermo (seitsemäs kallon hermo), abducens-hermo (6. kallon hermo) ja kolmoishermo (5. kallon hermo). Vestibulokokolaarinen hermo välittää hermoimpulssit korvalle kuulotoimintoa varten. Se on tärkeää myös tasapainoajuuden saavuttamiseksi. Pons sisältää myös hermorakenteen, nimeltään “olivary kompleksi”, joka mahdollistaa äänen lokalisoinnin avaruudessa ja melun vähentämisen. Se on erityinen hermorakenne kuulolle. Kasvohermo lähettää motorisia impulsseja kasvojen lihaksiin, mikä antaa ihmisille mahdollisuuden käyttää ilmeitä. Se tarjoaa myös makuelämyksen kielen etuosan kahdelle kolmasosalle, helpottaa repimistä ja suolistumista. Abducens-hermo hallitsee silmän lihaksia, jotka vastaavat sivuttain etsimisestä. Kolmikkohermo välittää aistitoiminnot kasvoille. Se tarjoaa myös mastikkaat lihaksille motorisen toiminnan, joka mahdollistaa pureskelun.
Medulla oblongata on aivorungon alin osa. Se sijaitsee foramen magnum -tasolla, joka on kallon takaaukko. Kaiken kaikkiaan se näyttää selkäytimen ylimmän osan hienoisesta suurennuksesta, jonka halkaisija on 1 cm ja pituus 2,5 cm. Sille on ominaista kaksi erillistä korkeutta. Ensimmäistä näkyvää rakennetta kutsutaan medullaarisiksi pyramidiksi. Nämä ovat hermosäikeitä, jotka tarjoavat motorista toimintaa, joka laskeutuu aivokuoresta alas selkäytimeen. Mielenkiintoista on, että aivorungossa nämä hermokuidut kulkevat toiselle puolelle olkarenkaan tasolla. Siksi medullaariset pyramidit tunnetaan myös nimellä pyramidaalinen poisto. Tällä on tärkeitä kliinisiä vaikutuksia, koska se selittää, miksi aivohalvauksen oikealla puolella oleva aivohalvaus ilmenee kehon vasemman puolen heikkoudesta tai halvaantumisesta. Kaiken kaikkiaan toinen näkyvä pullistuma on alempi olivaryytte, joka yhdistää nivelrintaan pikkuaivoihin.
Päinvastoin kuin pongit, kallosta nousevat kallon hermoja ovat glossopharyngeal hermo (yhdeksäs kallon hermo), emättimen hermo (10. kallon hermo), selkärangan lisähermo (11. kallon hermo) ja hypoglossal hermo (12. kallon hermo). Glossofaryngeal-hermo toimii makuuntumisen aikaansaamiseksi kielen takaosassa ja aktivoi nielen lihakset nielemisen helpottamiseksi. Emättimen hermo on autonominen hermo, jolla on pisin kulku. Se kulkee nielusta alaspäin paksusuolen pernan taipumiseen. Se auttaa aktivoimaan lihaksia nielemistä ja soittoa varten. Se mahdollistaa rintakehän ja vatsan elinten toiminnan normaalisti. Emättimen hermo on vastuussa myös gag-refleksistä, joka voidaan saada aikaan silittämällä kielen takaosaa tai nielun seinämiä. Selkärangan lisähermo tarjoaa lisää hermokuituja emättimen hermoon. Se auttaa pään kääntämisessä ja hartioiden hartioissa aktivoimalla sopivat lihakset. Hypoglossal hermo helpottaa nielemistä sallimalla kielen vapaaehtoisen liikkumisen. Moottorin hermot, jotka innervoivat elintärkeitä elimiä, ovat peräisin nivelpinnasta. Esimerkki on sydänkeskus, joka vastaa sydänlihaksen supistumisesta, mikä antaa meille mahdollisuuden olla vakaa verenpaine ja pulssi. Vasomotorinen keskus toimii verisuonten seinämien leviämisen säätelemiseksi. Hengityskeskus on vastuussa useiden hengityksen näkökohtien, kuten syvyyden, nopeuden ja rytmin, hallitsemisesta myös medulla. Muut refleksikeskukset, jotka välittävät oksentamisesta, yskästä, aivastuksesta, nielemisestä ja hikkaista, kulkevat myös medulan läpi.
Alemman aivorungon osana sekä pons että obullagata ovat tärkeitä hermostorakenteita, joilla on selkeät anatomiset piirteet ja fysiologiset toiminnot. Pongit sijaitsevat paremmin, juuri nipun yläpuolella. Se sisältää hermoja, jotka ovat tärkeitä kuulolle, tasapainolle, kasvojen lihaksen liikuttamiselle, pureskelulle ja sivuttain näyttämiselle. Medulla sijaitsee alapuolella, selkäytimen yläpuolella. Se sisältää hermorakenteita, jotka ovat elintärkeitä ihmisen elämän ylläpitämiselle. Se helpottaa nielemistä, puhumista, pään kääntämistä ja hartioi hartioita.