avainero välillä Watson ja Crick ja Hoogsteen base pari on, että Watsonin ja Crickin emäspariutuminen on tavanomainen tapa, joka kuvaa emäsparien muodostumista puriinien ja pyrimidiinien välillä. Samaan aikaan Hoogsteen-emäsparien muodostuminen on vaihtoehtoinen tapa muodostaa emäspareja, joissa puriini muodostaa erilaisen muodonmuutoksen pyrimidiiniin nähden.
Nukleotidilla on kolme komponenttia: typpipitoinen emäs, pentoosisokeri ja fosfaattiryhmä. DNA: n ja RNA: n rakenteessa on viisi erilaista typpipitoista emästä ja kaksi pentoosisokeria. Kun nämä nukleotidit muodostavat nukleotidisekvenssin, komplementaariset emäkset, joko puriinit tai pyrimidiinit, muodostavat vetysidoksia niiden välillä. Tätä kutsutaan emäpariksi. Siksi muodostetaan emäspari yhdistämällä kaksi typpipitoista emästä vety sidoksilla. Watsonin ja Crickin emäsparit ovat klassinen tai vakiomenetelmä, kun taas Hoogsteenin emäparien muodostaminen on vaihtoehtoinen tapa muodostaa emäsparia.
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on Watsonin ja Crickin base-pariliitos
3. Mikä on Hoogsteen Base-pariliitos
4. Watsonin ja Crickin sekä Hoogsteenin tukikohtaparien samankaltaisuudet
5. Vertailu rinnakkain - Watson ja Crick vs Hoogsteen -pohjaparit taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Watsonin ja Crickin emäsparien muodostuminen on standardimenetelmä, joka selittää typpipitoisten emästen emäsparien muodostumisen nukleotideissa. James Watson ja Francis Crick, vuonna 1953, selittivät tämän emäsparimismenetelmän, joka stabiloi DNA: n kaksoisstandardin heliksiä. Watsonin ja Crickin emäsparien mukaan adeniini muodostaa vedysidoksia tymiinin kanssa DNA: ssa ja urasiilin kanssa RNA: ssa. Lisäksi guaniini muodostaa vedysidoksia sytosiinin kanssa sekä DNA: ssa että RNA: ssa.
Kuva 01: Watsonin ja Crick-tukikohta
G: n ja C: n välillä on kolme vety sidosta, kun taas A: n ja T: n välillä on kaksi vety sidosta. Nämä emäsparit antavat DNA-heliksin ylläpitää säännöllistä kierteistä rakennettaan. Suurimmalla osalla nukleotidisekvensseistä (60%) on Watson- ja Crick-emäsparit, jotka ovat stabiileja neutraalissa pH: ssa.
Hoogsteen-emäsparit ovat vaihtoehtoinen tapa muodostaa emäspareja nukleiinihapoihin. Tämän kuvasi ensimmäisen kerran amerikkalainen biokemisti Karst Hoogsteen vuonna 1963. Hoogsteen-emäsparit ovat samanlaisia kuin Watson- ja Crick-emäsparit. Niitä esiintyy adeniinin (A) ja tymiinin (T) ja guaniinin (G) ja sytosiinin (C) välillä. Mutta puriini saa erilaisen muodonmuutoksen pyrimidiiniin nähden. A- ja T-emäsparissa adeniini pyörii 180 astetta0 noin glykosidisidosta, mahdollistaen vaihtoehtoisen vety-sidosjärjestelmän. Samoin G- ja C-parissa guaniini pyörii 180 ° glykosidisidoksen ympäri. Lisäksi glykosidisidosten kulma on suurempi Hoogsteenin emäsparissa. Lisäksi Hoogsteen-emäsparien muodostuminen ei ole stabiili neutraalissa pH: ssa.
Kuva 02: Watsonin ja Crickin tukikohtaparit vs. Hoogsteenin emäsparit
Hoogsteen-emäsparit ovat ei-kanoonisia emäspareja, jotka tekevät nukleotidisekvensseistä vähemmän vakaita kuin tavanomaiset emäsparit. Lisäksi ne voivat johtaa DNA-kaksoiskierukan häiriöihin. Hoogsteen-emäsparit esiintyvät luonnossa, mutta ne ovat hyvin harvinaisia.
Watsonin ja Crickin emäsparien muodostuminen on tavanomainen tapa, joka kuvaa emäsparien muodostumista puriinien ja pyrimidiinien välillä. Toisaalta Hoogsteen-emäsparien muodostuminen on vaihtoehtoinen tapa muodostaa emäspareja, joissa puriinilla on erilainen konformaatio pyrimidiiniin nähden. Joten, tämä on avainero Watsonin ja Crickin sekä Hoogsteenin tukiparitusparien välillä. Watsonin ja Crickin emäspariutumista kuvasivat James Watson ja Francis Crick vuonna 1953, kun taas Hoogsteenin emäsparit kuvasi Karst Hoogsteen vuonna 1963. Lisäksi Watsonin ja Crickin emäsparit ovat vakaita, kun taas Hoogsteenin emäparit ovat tyypillisesti vähemmän vakaita..
Alla oleva infografia esittää yhteenvedon Watsonin ja Crickin sekä Hoogsteenin emäsparien välillä.
Watson- ja Crick-emäsparit ja Hoogsteen-emäsparit ovat kahden tyyppisiä tapoja, jotka kuvaavat typpipitoisten emästen muodostumista nukleotidisekvensseihin. Hoogsteen-emäsparien muodostumisessa puriiniemäksellä on erilainen konformaatio pyrimidiiniemäksen suhteen. Joten, tämä on avainero Watsonin ja Crickin sekä Hoogsteenin tukiparitusparien välillä. Lisäksi Watson- ja Crick-emäsparit stabiloivat DNA-kaksoiskierrettä, kun taas Hoogsteen-emäsparit tekevät heliksistä epävakaan. Molemmat tyyppiset emäsparit esiintyvät kuitenkin luonnollisesti ja ne ovat tasapainossa toistensa kanssa.
1. ”Hoogsteen Base Pair.” Wikipedia, Wikimedia Foundation, 9. tammikuuta 2020, saatavana täältä.
2. "DNA: n rakenteen ja toiminnan löytö: Watson ja Crick." Luontouutisia, Nature Publishing Group, saatavana täältä.
1. ”GC Watson Crick basepair” Alkuperäinen lähettäjä oli WillowW Englannin Wikipediassa. - Siirtynyt en.wikipediasta Commonsiin (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta
2. “Hoogsteen Watson Crick pairing-en” Ian Furst - Oma työ (CC BY-SA 4.0) Commons Wikimedian kautta