Ero VNTR n ja STR n välillä

Avainero - VNTR vs STR
 

DNA-tutkimuksilla on valtava hyöty fylogeneettisten suhteiden ymmärtämisessä ja määrittämisessä, geneettisten sairauksien diagnosoinnissa ja organismin genomien kartoittamisessa. Useita DNA-analyysiin liittyviä tekniikoita käytetään tietyn geenin tai DNA-sekvenssin tunnistamiseen tuntemattoman DNA-poolin joukossa. Ne tunnetaan geneettisinä markkereina. Geneettisiä markkereita käytetään molekyylibiologiassa yksilöiden ja lajien välisen geneettisen variaation tunnistamiseen. Vaihtelevan määrän tandemtoisto (VNTR) ja lyhyt tandemtoisto (STR) ovat kahden tyyppisiä geneettisiä markkereita, jotka osoittavat polymorfismia yksilöiden keskuudessa. Molemmat tyypit ovat koodaamattomia toistuvia DNA: ta, jotka ovat tandemtoistoja. Ne on järjestetty päästä häntään kromosomeihin. VNTR on genomin osa, jossa lyhyt nukleotidisekvenssi toistetaan useita kertoja. STR on toinen genomin osa DNA: sta, joka on järjestetty toistuvina yksiköinä, jotka koostuvat kahdesta -toista nukleotidista sata kertaa. Avainero VNTR: n ja STR: n välillä on nukleotidien lukumäärä toistuvassa sekvenssissä. VNTR: n toistuvat yksiköt koostuvat 10 - 100 nukleotidistä, kun taas STR: n toistuvat yksiköt koostuvat 2 - 13 nukleotidista. VNTR: tä ja STR: tä käytetään laajasti rikosteknisissä tutkimuksissa.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on VNTR 
3. Mikä on STR
4. VNTR: n ja STR: n samankaltaisuudet
5. Vertailu rinnakkain - VNTR vs STR taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on VNTR?

Tandem-toisto on lyhyt DNA-sekvenssi, joka toistuu päästä häntään tietyssä kromosomaalisessa lokuksessa. Tandem-toistossa ei ole muuta sekvenssiä tai nukleotidia. Genomissa on monen tyyppisiä tandemtoistoja. VNTR on tyyppinen tandemtoisto, jonka joukossa on toistuvia yksiköitä, jotka koostuvat 10 - 100 nukleotidistä. VNTR on tyyppi minisatelliittia. Näitä tandemtoistoja löytyy monista kromosomeista. Ne ovat välissä ihmisen genomissa ja sijaitsevat pääasiassa kromosomien subtelomeerisillä alueilla.

 VNTR: t osoittavat tandem-toistuvan polymorfismin yksilöiden keskuudessa. VNTR: n pituus kromosomin tietyssä paikassa on suuresti muuttuva yksilöiden keskuudessa, koska kyseisessä DNA-osassa järjestettyjen toistuvien yksiköiden lukumäärä vaihtelee. Siksi VNTR: ää voidaan käyttää tehokkaana työkaluna yksilöiden tunnistamisessa ja VNTR-analyysiä hyödynnetään monilla aloilla, mukaan lukien genetiikka, biologian tutkimus, oikeuslääketiede ja DNA-sormenjäljet. VNTR: t olivat ensimmäisiä geneettisiä markkereita, joita käytettiin luuytimensiirtojen siirteen kvantifiointiin. VNTR: t olivat myös ensimmäisiä polymorfisia markkereita, joita käytettiin DNA: n profiloinnissa oikeuslääketieteessä.

Kuvio 01: VNTR: ien variaatio kuudessa yksilössä

VNTR-analyysi suoritetaan restriktiofragmenttien pituuden polymorfismin avulla, jota seuraa eteläinen hybridisaatio. Siksi se tarvitsee suhteellisen suuren DNA-näytteen. VNTR-profiilin tulkinta on myös ongelmallista. Näiden rajoitusten takia VNTR: n käyttöä rikosteknisessä genetiikassa on rajoitettu ja se korvataan STR-analyysillä.

Mikä on STR?

STR on erittäin toistuva DNA-osa, joka koostuu kahdesta -toista nukleotidi-toistoyksiköstä, jotka on järjestetty tandem-tavalla. STR on samanlainen kuin VNTR. Mutta se vaihtelee VNTR: stä toistuvan sekvenssin nukleotidien lukumäärästä ja toistojen lukumäärästä. STR on eräänlainen mikrosatelliitti.

Toistuvien yksiköiden tarkan määrän mittaamiseen liittyvä STR-analyysi. STR: t ovat hyvin vaihtelevia yksilöiden välillä, samanlaisia ​​kuin VNT: t. STR-profiilit eroavat henkilöittäin. Siksi STR-analyysiä käytetään molekyylibiologiassa kahden tai useamman näytteen DNA: n spesifisten lokusten vertaamiseen. Siksi STR-molekyylien katsotaan olevan voimakkaita geenimarkereita molekyylibiologiassa. Se on erinomainen työkalu yksilöiden tunnistamiseen, koska heillä on suuri polymorfismi ja suhteellisen lyhyt pituus.

Tällä hetkellä STR: t ovat rikosteknisessä genetiikassa yleisimmin käytetty analysoitu geneettisen polymorfismin väline. Suurimpaan osaan rikosteknisistä tapauksista liittyy STR-polymorfinen analyysi. STR-lokukset ovat levinneet koko genomiin. Kromosomeissa on tuhansia STR: iä, joita voidaan käyttää rikosteknisissä analyyseissä. STR-analyysi ei sisällä restriktiopituuden polymorfismia, kuten VNTR-analyysi. STR-analyysi ei katkaise DNA: ta restriktioentsyymeillä. Spesifisiä koettimia käytetään kiinnittämään halutut alueet DNA: han ja käyttämällä PCR-tekniikkaa, STR: n pituudet määritetään.

Kuva 02: STR-variaatio näytteiden välillä

Mitkä ovat samankaltaisuudet VNTR: n ja STR: n välillä??

• VNTR ja STR ovat koodaamaton DNA.
• Molemmat ovat tandemtoistoja.
• Molemmat osoittavat polymorfismia yksilöiden keskuudessa johtuen DNA-osan pituuserosta.
• Molempia käytetään vahvoina geneettisinä markkereina DNA-sormenjälkeissä ja rikosteknisissä tutkimuksissa.

Mikä on ero VNTR: n ja STR: n välillä?

VNTR vs. STR
VNTR on koodaamaton toistuva DNA, jolla on lyhyt nukleotidisekvenssi toistettu tandem-tavalla.	STR on erittäin toistuva DNA-osa, joka koostuu kahdesta -toista nukleotiditoistoyksiköstä, jotka on järjestetty tandem-tavalla.
Koko
VNTR: t ovat suurempia kuin STR: t.	STR: t ovat pienempiä kuin VNTR: t.
Nukleotidien lukumäärä toistuvassa sekvenssissä
VNTR: n toistuva yksikkö koostuu 10 - 100 nukleotidistä.	STR: n toistuva yksikkö koostuu 2 - 13 nukleotidistä.

Yhteenveto - VNTR vs STR

VNTR ja STR ovat kaksi voimakasta geenimarkeria, joita käytetään molekyylibiologiassa, etenkin rikosteknisen genetiikan alalla. VNTR on tyyppi minisatelliittia ja STR on mikrosatelliitti. VNTR ja STR ovat koodaamaton, erittäin toistuva DNA. Ne ovat tandemtoistoja. VNTR: n ja STR: n yleinen rakenne ovat samat. Nukleotidien lukumäärä toistuvassa sekvenssissä ja pituus ovat kuitenkin erilaisia. VNTR: llä on toistuvia sekvenssejä, jotka koostuvat 10 - 100 nukleotidistä. STR: llä on toistuvia sekvenssejä, jotka koostuvat 2 - 13 nukleotidistä. Tämä on ero VNTR: n ja STR: n välillä.

Lataa PDF-versio VNTR vs. STR-versiosta

Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainaushuomautusten mukaisesti. Lataa PDF-versio tästä VNTR: n ja STR: n ero.

Viitteet:

1. ”Oikeuslääketieteen tiede.” CRG - Vastuullisen genetiikan neuvosto. N.p., n.d. Web. Saatavilla täältä. 10. heinäkuuta 2017.
2. “STR-analyysi.” Wikipedia. Wikimedia-säätiö, 22. maaliskuuta 2017. Web. Saatavilla täältä. 10. heinäkuuta 2017.

Kuvan kohteliaisuus:

1. “D1S80Demo” kirjoittanut PaleWhaleGail englanniksi Wikipediassa (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta