Ero kohdistetun ja kohdistamattoman proteomiikan välillä

Keskeinen ero kohdennetun ja kohdentamattoman proteomiikan välillä on, että kohdennetun proteomiikan tavoitteena on mitata tietyn proteiinin runsaus, kun taas kohdistamaton proteomiikka ei kohdista tiettyyn proteiiniin.

Proteomiikka on laajamittainen tutkimus proteiineista, niiden rakenteista ja toiminnoista. Se tutkii solun, kudoksen tai organismin koko proteiinikomplementtia tietyissä olosuhteissa. Proteomiikkaa on kahta tyyppiä kohdennettuna proteomikana ja kohdentamattomana.

SISÄLTÖ

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on kohdennettu proteomiikka
3. Mikä on kohdistamaton proteomiikka
4. Kohdennetun ja kohdistamattoman proteomiikan väliset yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - Kohdennettu vs. kohdistamaton proteomiikka taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on kohdistettu proteomiikka?

Kuten nimensä osoittaa, kohdennettu proteomiikka kohdistuu tiettyyn proteiiniin tai peptidiin monimutkaisessa proteiiniseoksessa analyysiä varten. Sitten se analysoi kyseisen esivalitun spesifisen proteiinin läsnäolon ja määrän. Tämä menetelmä on mahdollista vain yhdelle näytteelle tai useille näytteille. Tämä menetelmä sopii jopa tietylle proteiiniryhmälle. Tuloksena on tarkempi, määrällinen ja arkaluonteinen tieto. Lisäksi massaspektrometria yhdistettynä kohdennettuun proteomiikkaan tuottaa tarkempia luotettavia mittauksia. Menetelmässä käytetään kolminkertaista kvadrupolimassaspektrometriä (QQQ) analyysiinsä.

Kuva 01: Proteomiikka

Kohdennettu proteomiikka on sopiva menetelmä, jos haluat tarkistaa, onko törmäystavoite todella kaatunut tai haluatko kvantifioida tietyn proteiinin / peptidin veren seerumissa, aivoesteessä tai solulysaatissa jne. Voit myös käyttää sitä, jos haluat tarkistaa, ekspressoituko tietty proteiini eri tavoin näytteissä tai ajanjakson kokeessa.

Mikä on kohdistamaton proteomiikka?

Kohdistamaton proteomiikka, kuten nimessä mainitaan, ei ole kohdistettu tiettyyn proteiiniin tai peptidiin sen analyysiä varten. Löytöproteomiikka on toinen nimi kohdistamattomalle proteomiikalle. Itse asiassa se on "globaalimpi" analyysi. Kohdentamattoman proteomiikan suorittaminen on yleensä vastaus kysymykseen "mitä proteiineja tai proteiineja on tässä näytteessä tai useammassa näytteessä?" Tämä menetelmä ei ole herkkä kohdennettuna proteomiikana. Mutta se voi tunnistaa ja mitata monia proteiineja, mukaan lukien uudet proteiinit. Kohdistamaton proteomiikka voi tuottaa sekä kvantitatiivisia että laadullisia mittauksia.

Mitkä ovat samankaltaisuudet kohdennetun ja kohdistamattoman proteomiikan välillä?

• Sekä kohdennettu että kohdistamaton proteomiikka mittaa proteiineja näytteissä.
• Ne ovat tärkeitä proteomianalyysissä.
• Nämä menetelmät käyttävät massaspektrometriaa.

Mikä on ero kohdennetun ja kohdistamattoman proteomiikan välillä?

Ensinnäkin kohdennettu proteomiikka on tietyn proteiinin tai peptidin läsnäolon ja määrän määrittäminen monimutkaisissa proteiiniseoksissa. Sitä vastoin kohdentamattomat proteomiikat ovat näytteessä tai näytteissä olevien proteiinien kvantitatiivinen ja laadullinen tutkimus kohdistamatta tiettyyn proteiiniin. Kohdennettu proteomiikka suoritetaan ennalta valituilla tai kohdennetuilla proteiineilla, kun taas kohdistamaton proteomiikka suoritetaan tämän näytteen proteiinityyppien selvittämiseksi. Lisäksi kohdennettu proteomiikka on herkempi kuin kohdistamaton proteomiikka.

Yhteenveto - Kohdennettu vs. kohdistamaton proteomiikka

Yhteenvetona voidaan todeta, että kohdennettu ja kohdistamaton proteomiikka on kahden tyyppisiä proteiinitutkimuksia. Kuten heidän nimensä viittaavat, kohdennettu proteomiikka kohdistuu tiettyyn proteiiniin, kun taas kohdistamaton proteomiikka ei kohdistu tiettyyn proteiiniin. Tämä on ero kohdennetun ja kohdistamattoman proteomiikan välillä.

Viite:

1. ”Kohdennettu proteomiikka”. UC Davis Proteomics Core, saatavana täältä.
2. ”Proteomics / Johdatus proteomikiin.” Musiikkiteoria / Moodit - Wikikirjat, avoimet kirjat avoimelle maailmalle, saatavana täältä.

Kuvan kohteliaisuus:

1. ”Proteomics” kirjoittanut Xxl7441 englanniksi Wikibooks - Siirtynyt en.wikibooksista Commonsiin (Public Domain) Commons Wikimedian kautta