Virukset ovat pieniä tarttuvia hiukkasia, jotka replikoituvat vain elävän organismin sisällä. Ne kykenevät tartuttamaan melkein kaikki elävät organismit mukaan lukien eläimet, kasvit ja bakteerit. Ne ovat mikroskooppisia hiukkasia, jotka koostuvat proteiinikapsideista ja DNA- tai RNA-genomista. Viruksen genomi voi olla joko DNA tai RNA, yksijuosteinen tai kaksijuosteinen, pyöreä tai lineaarinen. Baltimore-luokittelujärjestelmän mukaan virukset voidaan luokitella seitsemään ryhmään hallussaan olevan genomityypin perusteella. Retrovirus ja bakteriofagi ovat tärkeitä virusryhmiä. Keskeinen ero retroviruksen ja bakteriofagin välillä on se retrovirus on virusryhmä, joka sisältää positiivisen aisti yksijuosteinen RNA-genomi ja pystyy replikoitumaan DNA: n välituotteen kautta sillä aikaa bakteriofagi on bakteereja tartuttava virus, joka sisältää joko DNA- tai RNA-genomia.
SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on retrovirus
3. Mikä on bakteriofagi
4. Vertailu rinnakkain - retrovirus vs. bakteriofagi
5. Yhteenveto
Retrovirus on virusryhmä, jolla on positiivisen mieleen yksijuosteinen RNA-genomi. Ne sisältävät entsyymin, nimeltään käänteistranskriptaasi, ja niiden replikaatio tapahtuu DNA-välituotteen kautta. Välituotteen DNA: n tuotanto replikaation aikana on ainutlaatuinen tälle virusryhmälle.
Infektion aikana retrovirukset kiinnittyvät isäntäsoluun spesifisten glykoproteiinien läpi, jotka sijaitsevat viruspartikkelin ulkopinnalla. Ne sulautuvat solukalvon kanssa ja tulevat isäntäsoluun. Isäntäsolun sytoplasmaan tunkeutumisen jälkeen retrovirus transkriptoi genomin kaksijuosteiseksi DNA: ksi käänteistranskriptaasientsyymiä käyttämällä. Uusi DNA sisällytetään isäntäsolun genomiin käyttämällä entsyymiä, jota kutsutaan integraasiksi. Vaikka infektio tapahtuu, isäntäsolu ei tunnista viruksen DNA: ta integraation jälkeen. Siksi isäntägenomin replikaation aikana virusgenomi replikoituu ja tuottaa tarvittavia proteiineja uusien kopioiden tekemiseksi viruspartikkeleista.
Ihmisen immuunikatovirus (HIV) ja ihmisen T-soluleukemiavirus (HTLV) ovat yleisiä ihmisen retroviruksia. HIV aiheuttaa taudin apuvälineitä ja HTLV aiheuttaa leukemiaa.
Retroviruksia käytetään luonnollisessa kyvyssään insertoida viruksen perimä isäntäorganismien sisään, ja niitä käytetään geeninjakelujärjestelmissä, ja niitä pidetään arvokkaina tutkimusvälineinä molekyylibiologiassa.
Kuvio 01: HIV-replikaatio
Bakteriofagi (faagi) on virus, joka tartuttaa ja leviää tietyn bakteerin sisällä. Niitä kutsutaan myös bakteerien syöviksi, koska ne toimivat bakteereja tappavina aineina. Frederick W. Twort löysi bakteriofagit vuonna 1915, ja Felix d'Herelle nimitti ne bakteriofaagiksi vuonna 1917. Ne ovat maapallon yleisimpiä viruksia. Ne koostuvat myös genomista ja proteiinikapsidista. Bakteriofagigenomi voi olla joko DNA tai RNA. Mutta suurin osa bakteriofaageista on kaksijuosteisia DNA-viruksia.
Bakteriofagit ovat spesifisiä yhdelle bakteerille tai tietylle bakteeriryhmälle. Ne nimetään bakteerikannalla tai tartuttamilla lajeilla. Esimerkiksi bakteriofaagit, jotka tartuttavat E coli kutsutaan kolifageiksi. Bakteriofageissa on erilaisia muotoja. Yleisin bakteriofaagien muoto on pään ja hännän muoto.
Bakteriofagien tulisi tartuttaa isäntäsolu lisääntymiseen. Ne kiinnittyvät tiiviisti bakteerisoluseinämään pintareseptoreidensa avulla ja injektoivat geneettisen materiaalin isäntäsoluun. Bakteriofaagit voivat läpikäydä kahden tyyppisiä infektioita, nimeltään lyyttinen ja lysogeeninen sykli. Se riippuu faagityypistä. Lyyttisessä syklissä bakteriofaagit infektoivat bakteerit ja tappavat isäntäbakteerisolun nopeasti hajottamalla. Lysogeenisessä jaksossa virusgeneettinen materiaali integroituu bakteerigenomiin tai plasmideihin ja esiintyy isäntäsolussa useita tuhansia sukupolvia tappamatta isäntäbakteeria.
Faageilla on erilaisia sovelluksia molekyylibiologiassa. Niitä käytetään patogeenisten bakteerikantojen hoitamiseen, jotka ovat resistenttejä antibiooteille. Niitä voidaan käyttää myös spesifisten bakteerien tunnistamiseen taudinmäärityksessä.
Kuvio 02: bakteriofagi-infektio
Retrovirus vs. bakteriofagi | |
Retrovirus on virusryhmä, joka sisältää yksijuosteisen RNA-genomin. | Bakteriofagi on virus, joka tartuttaa ja replikoituu bakteereihin. |
Käänteisen transkriptaasin läsnäolo | |
Retrovirus sisältää entsyymin nimeltä käänteistranskriptaasi. | Bakteriofagi ei sisällä käänteistranskriptaasia. |
Käänteisen transkription esiintyminen | |
Käänteistranskriptio tapahtuu viruksen replikaation aikana | Käänteistranskriptiota ei tapahdu viruksen replikaation aikana. |
DNA-välituotteen tuotanto | |
Retrovirukset tuottavat välimuodon DNA-kopion genomista. | Bakteriofagi ei tuota DNA-välituotetta. |
Retrovirus ja bakteriofagi ovat kahden tyyppisiä viruksia. Retrovirus on ryhmä viruksia, joilla on positiivisen mieleen yksijuosteinen RNA-genomi, joka replikoituu välituote-DNA: n kautta. Bakteriofagi on virus, joka hyökkää bakteereihin ja replikoituu käyttämällä bakteerien replikaatiomekanismeja. Bakteriofaagit ovat biosfäärissä yleisimpiä viruksia, ja niillä voi olla joko DNA- tai RNA-genomeja. Tämä on ero retroviruksen ja bakteriofagin välillä.
Viitteet:
1. Coffin, John M. “Retrovirusten paikka biologiassa”. Retroviruksista. Yhdysvaltain kansallinen lääketieteellinen kirjasto, 1. tammikuuta 1997. Web. 5. huhtikuuta 2017
2. Gelderblom, Hans R. “Virusten rakenne ja luokittelu.” Lääketieteellinen mikrobiologia. 4. painos. Yhdysvaltain kansallinen lääketieteellinen kirjasto, 1. tammikuuta 1996. Web. 5. huhtikuuta 2017
3. Hatfull, Graham F. ja Roger W. Hendrix. "Bakteriofaagit ja niiden genomit." Nykyinen mielipide virologiassa. Yhdysvaltain kansallinen lääketieteellinen kirjasto, 1. lokakuuta 2011. Verkko. 5. huhtikuuta 2017
4. Coffin, John M. “Immuunivaste retrovirusinfektioon.” Retroviruksista. Yhdysvaltain kansallinen lääketieteellinen kirjasto, 1. tammikuuta 1997. Web. 5. huhtikuuta 2017
Kuvan kohteliaisuus:
”Hiv gross” - Kääntäjä Raul654 - Alun perin GFDL-kuvasta Kuva: Hiv gross german.png, (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia -sivuston kautta
”Faagi injektoi genominsa bakteerisoluun” - kirjoittanut GrahamColm englanniksi Wikipediasta (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedia -sivuston kautta