Ero plasmidin ja transposonin välillä

Avainero - Plasmidi vs Transposon
 

Bakteerit sisältävät kromosomaalisen ja ei-kromosomaalisen DNA: n. Kromosomaalisella DNA: lla on tärkeä rooli bakteerien kasvussa. Ei-kromosomaalinen DNA ei kooda bakteerien selviytymisen kannalta välttämättömiä geenejä. Plasmidi on tyyppi prokaryoottisesta ei-kromosomaalisesta DNA: sta. Ne ovat pieniä, pyöreitä kaksijuosteisia DNA: ta, jotka tarjoavat lisägeenejä bakteereille. Transposoni on DNA-sekvenssi, joka voi siirtyä uusiin positioihin genomissa. Ne tunnetaan myös bakteerien liikkuvana geneettisenä materiaalina. Avainero plasmidin ja transposonin välillä on se plasmidi on ei-kromosomaalinen DNA, joka replikoituu itsenäisesti bakteerissa sillä aikaa transposoni on osa kromosomaalista DNA: ta, joka siirtyy bakteerien genomiin ja muuttaa kromosomin geneettistä sekvenssiä.

SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on plasmidi
3. Mikä on Transposon
4. Vertailu rinnakkain - Plasmid vs Transposon
5. Yhteenveto

Mikä on plasmidi?

Plasmidi on prokaryoottien ekstrakromosomaalinen DNA. Se voi replikoitua itsenäisesti bakteerikromosomista. Yhdessä bakteerissa voi olla useita plasmideja sisällä. Plasmidit ovat suljettuja pyöreitä DNA-bittejä ja ne ovat kooltaan pieniä. Plasmidi-DNA: ssa on muutama geeni, jotka eivät ole välttämättömiä bakteerin selviytymiselle. Plasmidien nuo geenit tarjoavat kuitenkin bakteereille lisää geneettisiä etuja, kuten antibioottiresistenssi, rikkakasvien torjunta, raskasmetallien sietokyky jne. Erityiset F-tekijäplasmidit, nimeltään F-tekijäplasmidit, osallistuvat bakteerikonjugaatioon, joka on seksuaalinen lisääntymismenetelmä..

Plasmideja käytetään vektoreina yhdistelmä-DNA-tekniikassa ja geenikloonauksessa. Plasmideilla on erityispiirteitä, jotka tekevät niistä sopivia käytettäviksi yhdistelmävektoreina geenitekniikassa. Ne sisältävät replikaation aloituskohdan, valittavissa olevat geenit, kaksijuosteisen luonteen, pienen koon ja useita kloonauskohtia. Tutkijat voivat avata plasmidi-DNA: n helposti ja insertoida halutut DNA-fragmentit tai geenit plasmideihin rekombinantti-DNA: n valmistamiseksi. Lisäksi rekombinanttiplasmidin transformaatio isäntäbakteereiksi on helpompaa kuin muut vektorit.

Kuva 01: Plasmidit

Mikä on Transposon?

Transposoni on fragmentti tai DNA-sekvenssi, joka voi siirtyä bakteerin perimään. Ne ovat liikkuvia DNA-sekvenssejä. He siirtyvät genomin uusiin paikkoihin. Nämä liikkeet tekevät muutoksia bakteerigenomin sekvenssissä aiheuttaen merkittäviä muutoksia geneettisessä informaatiossa. Ne ovat siirrettäviä geenielementtejä, jotka vastaavat uusien geneettisten sekvenssien muodostamisesta bakteereihin. Barbara McClintock löysi transposonit ensimmäistä kertaa 1940-luvulla maissilla tehdyillä kokeilla ja hän sai Nobel-palkinnon työstään.

Transposoneihin viitataan joskus hyppygeeneinä, koska nämä hyppysekvenssit voivat estää geenien transkription ja järjestää uudelleen bakteerin geneettisen materiaalin. Ne vastaavat myös lääkeresistenssin, antibioottiresistenssigeenien liikkeistä plasmidien ja kromosomien välillä.

On kahden tyyppisiä transposoneja perustuen mekanismiin, jota he käyttävät liikkuakseen ja työntääkseen. He ovat luokan I transposon (retrotransposons) ja luokan II transposoni (DNA-transposonit). Luokan I transposonit käyttävät ”kopioi ja liitä” -mekanismia, kun taas luokan II transposonit käyttävät ”leikkaa ja liitä -mekanismia”..

Transposoni voi siirtyä plasmidista kromosomiin tai kahden plasmidin välillä. Näiden liikkeiden takia geenit sekoittuvat bakteerilajien välillä. Siksi transposoneja käytetään vektoreina geenitekniikassa geenisekvenssien poistamiseksi ja integroimiseksi organismeihin.

Kuvio 02: Bakteerin DNA-transposoni

Mikä on ero plasmidin ja Transposonin välillä??

Plasmidi vs. Transposon
Plasmidi on pieni pyöreä kaksijuosteinen ei-kromosomaalinen bakteerien DNA.	Transposon on DNA-segmentti, joka pystyy siirtymään genomin uusiin paikkoihin.
Itsereplikaation
Plasmidit pystyvät replikoitumaan riippumattomasti kromosomaalisesta DNA: sta.	Transposonit eivät pysty replikoitumaan itsenäisesti.
Erityisominaisuudet koodattu
Plasmideilla on useita ominaisuuksia, kuten antibioottiresistenssi ja virulenssi.	Transposonit eivät kooda erityisiä piirteitä.
Käytä vektorina
Plasmideja käytetään vektoreina geenitekniikassa rekombinantti-DNA: n valmistamiseksi.	Transposoneja käytetään myös vektoreina geenitekniikassa insertion mutageneesiin.
Mutaatiot ja muutokset sekvenssissä
Plasmidit eivät pysty aiheuttamaan merkittäviä mutaatioita ja muuttamaan genomisekvenssiä ja kokoa.	Transponointi voi luoda merkittäviä mutaatioita ja muuttaa genomisekvenssiä ja kokoa.

Yhteenveto - Plasmid vs Transposon

Plasmidi on kromosomivälinen DNA, jota esiintyy yleisesti bakteereissa. Sillä on kyky replikoitua riippumattomasti bakteerien kromosomaalisesta DNA: sta. Plasmidit sisältävät geenejä, jotka lisäävät geneettisiä etuja bakteereille. Plasmidi-DNA ei kuitenkaan ole välttämätön bakteerien selviytymiselle. Transposonit ovat liikkuvia geenielementtejä, jotka siirtyvät yhdestä sijainnista uuteen sijaintiin genomin sisällä. He kykenevät aiheuttamaan mutaatioita ja muuttamaan genomin kokoa ja järjestystä. Tämä on ero plasmidin ja transposonin välillä.

Viite:
1. Griffiths, Anthony JF. "Prokaryoottiset transposonit." Johdanto geneettiseen analyysiin. 7. painos. Yhdysvaltain kansallinen lääketieteellinen kirjasto, 1. tammikuuta 1970. Web. 26. huhtikuuta 2017
2. ”Jaksot, plasmidit, lisäyssekvenssit ja transposonit.” Mikrobiologian ja immunologian maailma. Encyclopedia.com, n.d. Web. 27. huhtikuuta 2017

Kuvan kohteliaisuus:
1. Käyttäjä “Plasmid (englanti)”: Spaully englanninkielisessä wikipediassa - Oma työ (CC BY-SA 2.5) Commons Wikimedia -sivuston kautta
2. Jacek FH “Composite transposon” - itsetehty, perustuu kuvaan: Composite transposon.jpg (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta