Ero plasmidin ja kosmidin välillä

avainero plasmidin ja kosmidin välillä on se plasmidi on kaksijuosteinen, pyöreä ja suljettu ekstrakromosomaalinen DNA, joka on läsnä bakteereissa ja arhaassa, kun taas kosmidi on hybridivektorijärjestelmä, joka muodostuu johtuen cos bakteerien lambdafaagi- ja plasmidi-DNA-sekvenssi.

Geenitekniikka on pitkälle edennyt tutkimus bioteknologian alalta. Geenitekniikka voi muuttaa tai muuttaa elävien organismien perimää. Lisäksi geenitekniikka on hyödyllistä geeniterapiassa ja geneettisten häiriöiden hoidossa. Ennen geenien lisäämistä toisen organismin genomiin on välttämätöntä valmistaa rekombinantti-DNA-molekyyli, joka voi kantaa haluttua DNA-fragmenttia ja toimittaa isäntäorganismiin. Siksi rekombinantti-DNA-tekniikan aikana se tehdään vektorijärjestelmällä. Siksi vektori toimii kuljettimena tai välittäjänä luovuttajan ja isäntäorganismin välillä. Plasmidi ja kosmidi ovat kahta tyyppiä vektoreita, joita käytetään yleisesti yhdistelmä-DNA-tekniikassa ja geenitekniikassa. Jotkut ovat luonnollisia vektoreita, kun taas toiset ovat keinotekoisia vektoreita. Plasmidi on luonnollinen vektori, kun taas kosmidi on keinotekoisesti rakennettu vektori. Molemmilla tyypeillä on etuja ja haittoja.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on plasmidi
3. Mikä on Cosmid
4. Plasmidin ja Cosmidin väliset yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - Plasmid vs Cosmid taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on Plasmid?

Plasmidi on pieni, pyöreä, kaksijuosteinen DNA, jota esiintyy prokaryoottisissa organismeissa pääasiassa bakteereissa ja arhaassa. Ne esiintyvät suljettuina piireinä bakteerien sisällä. Plasmidit eivät myöskään ole genomisia DNA: ta. Siksi plasmidien läsnäolo tai puuttuminen prokaryoottisoluissa ei vaikuta näiden solujen eloonjäämiseen. Plasmidit ovat kromosomivälistä DNA: ta. Plasmidit tarjoavat kuitenkin lisäetuja bakteereille ja arhaalle. Ne sisältävät erityisiä geenejä, kuten antibioottiresistenssi, resistenssi useille raskasmetalleille, makromolekyylien hajoaminen jne.

Lisäksi plasmidit kykenevät replikoitumaan itsensä muodostamatta yhteyttä kromosomeihin. Se kuljettaa geenejä tai tietoa, joka on tarpeen sen omaa replikaatiota ja ylläpitoa varten. Lisäksi ne ovat itsenäisiä DNA: ta. Näiden erityispiirteiden takia plasmideilla on valtava käyttö molekyylibiologiassa vektoreina.

Kuva 01: Plasmidit

DNA: n kaksijuosteinen luonne, antibioottiresistenssigeenit, itsensä replikoituva kyky ja erityiset restriktiokohdat ovat tärkeitä ominaisuuksia, jotka tekevät plasmideista sopivampia vektorimolekyyleiksi rekombinantti-DNA-tekniikassa. Ja myös plasmideja on helppo eristää ja muuntaa isäntäbakteereiksi.

Mikä on Cosmid?

Kosmidi on hybridivektorijärjestelmä. Se on keinotekoinen vektori, joka on rakennettu yhdistämällä cos Lambda-faagihiukkasten sekvenssit ja plasmidi. Nämä cos kohdat tai sekvenssit ovat pitkiä DNA-fragmentteja, jotka käsittävät 200 emäsparia. Niillä on kohesiiviset tai tahmeat päät, joiden avulla plasmidi mahtuu virus-DNA: hon. Siksi cos-paikat ovat elintärkeitä DNA: n pakkaamiselle. Cos-sivustoja on kolme, nimittäin cosN-sivusto, cosB-sivusto ja cosQ-sivusto. Nämä kohdat sisältävät DNA-juosteen nikkelimisen terminaasiaktiivisuuden avulla, terminaasin pitämisessä ja DNA: n hajoamisen estämisessä vastaavasti DNaaseilla.

Kuvio 02: Cosmid

Kosmidit voivat joko replikoida yksijuosteisen DNA: n tai kaksijuosteisen DNA: n käyttämällä sopivaa replikaation aloituskohtaa. Ne sisältävät myös antibioottiresistenssigeenejä, jotka voivat olla käyttökelpoisia markkereina transformoitujen solujen valinnassa. Siten, kuten plasmidit, myös kosmidit ovat hyviä vektoreita yhdistelmä-DNA-tekniikassa.

Mitkä ovat samankaltaisuudet plasmidin ja kosmidin välillä?

• Plasmidi ja kosmidi ovat vektoreita, joita käytetään yleisesti rekombinantti-DNA-tekniikassa.
• Molemmat pystyvät toistumaan itse.
• Niiden alkuperä on replikaatio.
• Lisäksi niillä on useita kloonauskohtia.
• Ne sisältävät myös antibioottiresistenttejä geenejä, jotka ovat käyttökelpoisia markkereina.
• Vieras DNA voidaan insertoida molempiin tyyppeihin ja niistä voidaan valmistaa yhdistelmämolekyylejä.
• Molemmille vektoreille on saatavana helppoja seulontamenetelmiä.
• Molemmat ovat hyödyllisiä genomisten kirjastojen rakentamiseksi.

Mikä on ero plasmidin ja kosmidin välillä?

Plasmidi ja kosmidi ovat kahta tyyppiä kloonausvektoreita, joita käytetään geenitekniikassa. Plasmidit ovat pieniä, pyöreitä kaksijuosteisia kromosomivälisiä DNA-molekyylejä, joita esiintyy bakteereissa ja arhaassa. Toisaalta kosmidi on hybridivektori, joka on muodostettu lambda-faagi-DNA: n ja plasmidi-DNA: n cos-sekvensseistä. Tämä on avainero plasmidin ja kosmidin välillä. Lisäksi plasmidit voivat kantaa jopa 25 kb DNA-fragmentteja, kun taas komsidit pystyvät sisältämään jopa 45 kb fragmentteja. Siten tämä on toinen ero plasmidin ja kosmidin välillä.

Lisätietoja plasmidin ja kosmidin välisestä erotuksesta annetaan infografiassa.

Yhteenveto - Plasmid vs Cosmid

Plasmidi on luonnossa esiintyvä kromosomivälinen DNA, kun taas kosmidi on faagi-DNA: n ja plasmidi-DNA: n hybridivektori. Molemmat ovat kloonausvektoreita, joita käytetään yhdistelmä-DNA-tekniikassa. Kosmiidit sisältävät erityisiä tarttuvia päitä, joita kutsutaan cos-sivustoiksi in vitro pakkaus. Toisaalta plasmidit sisältävät useita piirteitä, jotka tekevät niistä ihanteellisia vektoreita geenitekniikassa. Molemmat voivat suorittaa itsenäisen toisinnuksen tai in vitro pakkaaminen bakteerisoluihin. Plasmidit kykenevät sisältämään vieraan DNA-fragmentin, jonka pituus on 25 kb, kun taas kosmidit pystyvät sisältämään vieraan DNA-fragmentin, joka on 45 kb. Siksi kosmidit ovat käyttökelpoisia kloonaustarkoituksissa suurempien DNA-fragmenttien kloonaamiseen, koska plasmidivektorit eivät voi kloonata suurempia fragmentteja. Siten tämä yhteenveto eroa plasmidin ja kosmidin välillä.

Viite:

1.Luontouutisia, Nature Publishing Group. Saatavilla täältä  
2. ”Kosmidia.” NeuroImage, Academic Press. Saatavilla täältä  

Kuvan kohteliaisuus:

1. ”Plasmid (englanti)” kirjoittanut Spaully - Oma työ, (CC BY-SA 2.5) Commons Wikimedian kautta 
2. ”Cosmid (englanti)” kirjoittanut Zlir'a (CC0) Commons Wikimedian kautta