Ero motiivin ja verkkotunnuksen välillä

avainero motiivin ja verkkotunnuksen välillä on, että motiivi ei ole itsenäisesti vakaa, kun taas domeeni on itsenäisesti vakaa.

Proteiinit ovat tärkeitä biologisia makromolekyylejä, joita läsnä kehossa. Toisaalta geenin geneettinen koodi päättää proteiinin aminohapposekvenssin. Lisäksi proteiineilla on primaarinen, sekundaarinen ja tertiäärinen rakenne. Ensisijainen rakenne on polypeptidiketjun aminohapposekvenssi. Kun polypeptidiketjut taittuvat keskenään, se muodostaa proteiinin sekundäärisen rakenteen. Alfaheeliksit, beetalevyt ja super-sekundaariset rakenteet kuuluvat sekundaarisiin rakenteisiin. Tietyt super-sekundaaristen alkuaineiden ryhmät tunnetaan proteiinimotiiveina. Proteiinin tertiäärinen rakenne viittaa sen kolmiulotteiseen rakenteeseen, joka päättää proteiinin toiminnasta. Domeeni on proteiinimolekyylin taitettu osa, joka on pallomainen ja jolla on erillinen tehtävä. Se on proteiinin perustavanlaatuinen funktionaalinen ja kolmiulotteinen rakenne.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on motiivi?
3. Mikä on verkkotunnus
4. Samankaltaisuudet motiivin ja verkkotunnuksen välillä
5. Vertailu rinnakkain - motiivi vs. verkkotunnus taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on motiivi?

Aihe on tietty ryhmä proteiinien super sekundaarisia elementtejä, kuten alfaheliksiä ja beetarakenteita. Ne ovat jonkinlaisia ​​malleja, joita esiintyy erilaisissa proteiineissa. Kuviot kuvaavat toissijaisten rakenneosien taittokuvioita ja niiden vuorovaikutusta. Nämä taittokuviot vakautuvat samanlaisilla sidoksilla, joita on läsnä tertiäärisissä rakenteissa. Ne eivät kuitenkaan ole niin monimutkaisia ​​kuin tertiääriset rakenteet.

Kuva 01: Aihe

Ne ovat proteiinien sekundaarirakenteiden yksinkertaisia ​​yhdistelmiä. Aihe ei sinänsä ole vakaa. Lisäksi motiivit selittävät proteiinin rakenteen, mutta eivät ennusta proteiinin toimintaa. Esimerkkejä proteiini-aiheista ovat beeta-alfa-beeta-aihe, kreikkalainen avainmalli, beetatynnyri, beeta-mutkimuskuvio jne..

Mikä on Domain?

Domeeni on proteiinin perustava, toiminnallinen ja kolmiulotteinen yksikkö. Se suorittaa tietyn toiminnon. Yhdessä proteiinissa voi olla useita erillisiä domeeneja. Jokainen verkkotunnus on itsenäinen yksikkö. Se on pallorakenne. Se vastaa tietystä toiminnosta tai vuorovaikutuksesta. Verkkotunnuksia voidaan käyttää hypoteesiin luonteenomaisen proteiinin toiminnasta. Proteiinia analysoitaessa on välttämätöntä ottaa huomioon, koska domeenit ovat proteiinin funktionaalisia yksiköitä.

Kuvio 02: Pyruvate-kinaasin kolme erilaista aluetta

Verkkotunnukset ovat erittäin vakaita ja kompakteja rakenteita. Ne voidaan helposti erottaa muista alueista. Pyruvaattikinaasilla on kolme erottavaa domeenia, kuten kuviossa 02. Domeenin pituus voi vaihdella, ja keskimääräinen pituus on 100 aminohappoa. Jokainen domeeni sisältää hydrofobisen ytimen, joka on rakennettu sekundaarisista rakenneyksiköistä. Useat domeenit yhdessä muodostavat proteiinin tertiäärisen rakenteen.

Mitkä ovat motiivin ja verkkotunnuksen väliset yhtäläisyydet??

• Aihe ja domeeni ovat yksiköitä, jotka ovat läsnä proteiinimolekyyleissä.
• Ne ovat hyödyllisiä luokiteltaessa proteiiniperheitä.

Mikä on ero motiivin ja verkkotunnuksen välillä?

Aihe on tietty proteiinien super sekundaaristen elementtien ryhmittely, kuten alfa-heelikaalit ja beetarakenteet, kun taas domeeni on proteiinin toiminnallinen yksikkö. Lisäksi motiivi on toissijainen rakenne, kun taas domeeni on vastuussa proteiinin tertiäärisestä rakenteesta. Lisäksi verkkotunnus on itsenäinen yksikkö, toisin kuin aihe. Lisäksi domeeni kuvaa proteiinin toimintaa, kun taas motiivi ei ole. Nämä ovat tärkeimmät erot aiheen ja verkkotunnuksen välillä. Alla oleva infografia esittää motiivin ja verkkotunnuksen välisen eron taulukkomuodossa.

Yhteenveto - Motif vs Domain

Aihe on proteiinimolekyylin sekundaarirakenteiden järjestely. Se ei yleensä ole itsessään vakaa, toisin kuin verkkotunnus. Domeeni on proteiinin itsenäisesti vakaa rakenne. Siksi se voi olla osa tai koko proteiinimolekyyli. Se on proteiinin kolmiulotteinen perustavanlaatuinen funktionaalinen yksikkö. Lisäksi sillä on toiminto ja se on itsenäinen yksikkö. Aihe voi olla osa verkkotunnusta. Mutta verkkotunnus ei voi olla osa motiivia. Tämä on ero motiivin ja verkkotunnuksen välillä.

Viite:

1. ”Proteiinidomeeni”. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31. heinäkuuta 2018. Saatavilla täältä

Kuvan kohteliaisuus:

1. ”Antraraksiini -proteiiniavainmotiivi” Natelewis-johdannaisteoksen (CC BY-SA 3.0) kautta Commons Wikimedia
2. ”Pyruvaattikinaasiproteiinidomeenit” kirjoittanut Thomas Splettstoesser - Oma työ, (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta