Toistuva DNA on nukleotidisekvenssit, jotka toistuvat uudestaan ja uudestaan organismien genomissa. Toistuva DNA muodostaa merkittävän osan genomisesta DNA: sta, ja siellä on kolme päätyyppiä, joita kutsutaan tandemtoistoiksi, terminaalitoistoiksi ja välituotetoistoiksi. Tandemtoistot ovat erittäin toistuvia sekvenssejä, jotka sijaitsevat vierekkäin keskeytyksettä. Selkärankaisten genomissa on kolme päätyyppiä tandemtoistoja. Ne ovat satelliitti-DNA: ta, mikrosatelliitti-DNA: ta ja minisatelliitti-DNA: ta. Minisatelliitti on osa erittäin toistuvaa DNA: ta, joka koostuu toistuvan sekvenssin sarjasta, joka koostuu 10 - 100 emäsparista. Mikrosatelliitti on toistuvan DNA: n osa, joka koostuu lyhyistä toistuvista sekvensseistä, jotka koostuvat 1-9 emäsparista. Siksi keskeinen ero minisatelliitin ja mikrosatelliitin välillä on toistuvan sekvenssin koko tai pituus.
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on minisatelliitti
3. Mikä on mikrosatelliitti
4. Samankaltaisuudet minisatelliitin ja mikrosatelliitin välillä
5. Vertailu rinnakkain - minisatelliitti vs. mikrosatelliitti taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Minisatelliitti-DNA on DNA-osa, joka käsittää sarjan lyhyitä DNA-toistuvia sekvenssejä, jotka ovat 10 - 60 emäsparia. Minisatelliiteille viitataan myös nimellä muuttuvan määrän tandemtoistoja (VNTR). Minisatelliitit sekoitetaan usein mikrosatelliittien kanssa. Minisatellitit ja mikrosatellitit erotetaan kuitenkin nyt tutkijoiden toistuvan sekvenssin koon perusteella.
Minisatelliitit voidaan nähdä yli 1000 paikassa ihmisen perimässä. Nämä lyhyet sekvenssit ovat rikkaita G: llä ja C: llä. Toistojen lukumäärä annetussa minisatelliitissa vaihtelee suuresti yksilöiden välillä.
Ensimmäisen ihmisen minisatelliitin tunnistivat A. R. Wyman ja R. White vuonna 1980. Myöhemmin Alec Jeffreys löysi äärimmäisen polymorfismin kopioiden lukumäärän minisatelliiteissa organismeista. Nämä löytöt tekivät minisatelliiteista ihanteellisia markkereita DNA-sormenjälkien tekemiseen, linkkien analysointiin ja väestötutkimuksiin. Minisatelliitit edistävät myös geenien ilmentymistä, transkriptiota, vaihtoehtoista silmukointia jne.
Mikrosatelliitti on osa DNA: ta, jolla on yksinkertaisia sekvenssitoistoja 1-10 emäsparia pitkiä. Mikrosatellitejä kutsutaan myös lyhyet sekvenssitoistot (SSR) tai yksinkertainen tandemtoisto (STR). On olemassa kahden tyyppisiä mikrosatelliitteja, joita kutsutaan yksinkertaisiksi mikrosatelliiteiksi ja komposiitti mikrosatelliiteiksi. Yksinkertaiset mikrosatelliitit koostuvat vain yhden tyyppisistä toistosekvensseistä. Yhdistelmämikrosatelliitit koostuvat useammasta kuin yhdestä toistotyypistä. Mikrosatelliiteilla on yleisimmin poly A / T-alueita. Mikrosatelliitit ovat kodominantteja ja runsaasti eukaryoottisissa genomeissa.
Samoin kuin minisatelliitit, myös mikrosatelliitit osoittavat polymorfismia yksilöiden keskuudessa. Toistojen määrä tietylle mikrosatelliitille vaihtelee yksilöiden välillä. Siksi mikrosatelliitteja voidaan käyttää myös geneettisinä markkereina DNA: n sormenjäljissä. Mikrosatelliittien polymorfismi voidaan tunnistaa helposti PCR: llä ja geelielektroforeesilla. Mikrosatelliitin reunustava alue on hyvin säilynyt sukulaislajeissa.
Minisatelliitti vs. mikrosatelliitti | |
Minisatelliitit ovat tandemtoistoja monomeeritoistopituudella 10 - 100 emäsparia. | Mikrosatelliitit ovat lyhyitä tandemtoistoja, jotka koostuvat 1 - 9 emäsparista monomeeria toistavia sekvenssejä. |
Toistuvan sekvenssin koko | |
Minisatelliitissa on toistuvia sekvenssejä 10 - 100 emäsparia. | Mikrosatelliitilla on lyhyitä sekvenssejä, jotka ovat 1 - 9 emäsparia. |
Yleiset emäkset | |
Minisatelliitit sisältävät runsaasti G- ja C-emäksiä. | Mikrosatelliitit sisältävät runsaasti A- ja T-emäksiä. |
Muut nimet | |
Minisatelliitit tunnetaan myös muuttuvien määrien tandemtoistoina (VNTR). | Mikrosatelliitit tunnetaan myös lyhyinä sekvenssitoistoina (SSR) tai yksinkertaisina tandemtoistoina (STR). |
Minisatelliitti ja mikrosatelliitti ovat kahden tyyppisiä tandemtoistoja. Ne erotetaan toistuvan sekvenssin emästen lukumäärän tai sekvenssin koon perusteella. Minisatelliitissa on 10 - 100 emäsparin pituista toistuvaa sekvenssiä, kun taas mikrosatelliitissa on 1-9 emäsparin pituutta toistavaa sekvenssiä. Tämä on tärkein ero minisatelliitin ja mikrosatelliitin välillä. Toistuvien sekvenssien kopiomäärä minisatelliiteissa ja mikrosatelliteissa vaihtelee suuresti yksilöiden välillä. Sekä minisatelliitit että mikrosatellitit ovat tehokkaita DNA-markkereita geneettisen variaation analysoimiseksi lajien populaatioiden sisällä ja niiden välillä.
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainaushuomautusten mukaisesti. Lataa PDF-versio täältä Ero minisatelliitin ja mikrosatellitin välillä.
1.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. "Suuret erot." Ero minisatelliitin ja mikrosatelliitin välillä. N.p., n.d. Web. Saatavilla täältä. 6. heinäkuuta 2017.
2.Vieira, Maria Lucia Carneiro, Luciane Santini, Augusto Lima Diniz ja Carla De Freitas Munhoz. "Mikrosatelliittimarkkerit: mitä ne tarkoittavat ja miksi ne ovat niin hyödyllisiä." Genetiikka ja molekyylibiologia. Sociedade Brasileira de Genética, 2016. Verkko. Saatavilla täältä. 7. heinäkuuta 2017.
1. Madelyndotson “VNTRexample” - Oma työ (CC BY-SA 4.0) Commons Wikimedian kautta