Ero lisäys- ja vaihtovektorien välillä

avainero insertio- ja korvaavien vektoreiden välillä on, että insertiovektorilla on kyky insertoida kohtuullisen pituisia vieraita DNA: ita, kun taas korvaavalla vektorilla on kyky sijoittaa suurempia pituuksia vieraita DNA: ta.

Faagivektorit ovat kloonaamiseen käytettyjä bakteriofageja. Faagivektoreita on kahta tyyppiä; ne ovat insertiovektori ja korvaava vektori. Lisäksi kaikki faagivektorit koostuvat ei-välttämättömistä geeneistä. Nämä geenit on kuitenkin poistettava faagista uusien vieraiden DNA-inserttien helpottamiseksi.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mitkä ovat lisäysvektorit
3. Mitkä ovat korvaavat vektorit
4. Yhdenmukaisuudet lisäys- ja vaihtovektorien välillä
5. Vertailu rinnakkain - lisäys vs. korvaavat vektorit taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on lisäysvektori?

Ensinnäkin insertiovektori on lambda-kloonausvektorien yksinkertaisin muoto. Itse asiassa se on tietyn tyyppinen faagivektori, jolla on ainutlaatuinen restriktiokohta, joka on viety vektorin genomiin valinnaisen DNA: n asemaan. Lisäksi faagi-DNA pysyy ilman poistoa. Tämä faagi-DNA: n poistumattomuus supistaa vektoriin kloonattavien inserttien (vieraan DNA: n) kokoa. Lisäksi nämä vektorit ovat käyttökelpoisia cDNA: n kloonauksessa ja ekspressiossa. GT10, GT11 ja Zap ovat esimerkkejä tästä vektorista.

Kuva 01: lambdafaagi

Lisäysvektori koostuu yhdestä tunnistuspaikasta. Tämän vektorin ensisijainen tehtävä on kehittää cDNA-kirjastoja, jotka on johdettu eukaryoottisista mRNA-sekvensseistä. Lisäksi se mahtuu vain vieraan DNA: n pituuksiin, jotka ovat välillä 5 - 11 kb. Sillä on myös ainutlaatuinen pilkkoutumiskohta vieraan DNA: n insertoimiseksi.

Mitkä ovat korvaavat vektorit?

Korvaava vektori tai korvausvektori "Faagi-vektori" on tyyppi faagivektori, joka on kehitetty poistamalla faagi-DNA: n keskimääräinen "täyteainefragmentti" -alue. Haluttu vieras DNA-insertti korvaa faagi-DNA: n.

Kuva 02: Korvaava vektori

Korvaavat vektorit ovat tärkeitä genomisten kirjastojen, kuten EMBL4 ja Charon40, luomisessa. Nämä vektorit mahtuvat suurempaan vieraan DNA: n pituuteen, joka vaihtelee välillä 08 - 24 kb. Täytealue koostuu myös geenistä, joka tekee faagivektorista elinkyvyttömän bakteeri-isännän sisällä.

Mitkä ovat samankaltaisuudet lisäys- ja vaihtovektorien välillä?

• Insertio- ja korvausvektorit ovat faagivektoreita.
• Molemmat vektorit mahtuvat vieraita DNA-inserttejä.
• He molemmat ovat hyödyllisiä luomalla DNA-kirjastoja.

Mikä on ero lisäys- ja korvaavien vektorien välillä?

Lisäys vs. korvaavat vektorit
Insertiovektori on tyyppi faagi-vektori, jossa on restriktiokohta viety faagin genomiin valinnaisen DNA: n kohtaan.	Korvaava vektori on tyyppi faagivektori, joka on kehitetty poistamalla faagi-DNA: n keskimääräinen "täytefragmentti" -alue.
Lisäosien koko
Pituus 05-11 kb	Pituus 08-24 kb
Täytefragmentti
Ei täyteainetta	Täytefragmentti korvataan vieraalla insertillä
Toimia
Tärkeää cDNA-kirjastojen luominen	Tärkeää perimäkirjastojen luomisessa
esimerkit
GT10, GT11 ja Zap ovat esimerkkejä	EMBL4 ja Charon40 ovat esimerkkejä
Raivauspaikka
Läsnä on ainutlaatuinen pilkkoutumiskohta	Halkaisupaikka sisältää geenejä, jotka eivät ole välttämättömiä lyyttisen syklin kannalta

Yhteenveto - Lisäys vs. korvaavat vektorit

Sekä insertio- että korvaavat vektorit ovat kahden tyyppisiä faagivektoreita. Molemmilla vektoreilla on restriktiopaikkoja, jotka helpottavat uusien vieraiden DNA-inserttien sijoittamista. Lisäysvektorit ovat tärkeitä luomalla cDNA-kirjastoja, kun taas korvaavat vektorit ovat tärkeitä luomalla genomisia kirjastoja. Lisäksi insertiovektorit mahtuvat DNA-insertteihin, joilla on kohtalainen pituus. Mutta korvaavat vektorit voivat mahtua pidempiä vieraita DNA-inserttejä. Kaiken kaikkiaan tämä on avainero insertio- ja korvausvektorien välillä.

Viite:

1. Hasty, P, et ai. "Lisäyksen tehokkuus vaihtosuuntautuneisiin vektoreihin kohdistamisen suhteen vaihtelee eri kromosomaalisilla alueilla." Molecular and Cellular Biology, US National Library of Medicine, joulukuu 1994, saatavana täältä.
2. ”Lambda-lisäysvektorit.” Biology 335 Luennot - Lambda-vektorit, saatavana täältä.
3. ”Korvaava vektori”. Korvaava vektori - Vaihtovektorin - GenScript-molekyylibiologian terminologia, saatavana täältä.

Kuvan kohteliaisuus:

1. ”Lambda-faagi” Lizanne Koch - oma työ ChemBioDraw (Public Domain) kanssa Commons Wikimedian kautta