Ero genotyypin ja sekvensoinnin välillä

Keskeinen ero - genotyypin määrittäminen vs. sekvensointi
 

Genotyyppien määritys ja sekvensointi ovat kaksi tekniikkaa, jotka suoritetaan tiedon saamiseksi nukleiinihapoista, pääasiassa organismin DNA: sta. Keskeinen ero genotyypin ja sekvensoinnin välillä on se genotyypitys on prosessi sen määrittämiseksi, mikä yksilöllä on geneettinen variantti merkkien avulla, kun taas sekvensointi on nukleotidisekvenssin oikean järjestyksen määrittäminen annetussa DNA-fragmentissa.

SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on genotyyppi?
3. Mikä on sekvensointi
4. Vertailu rinnakkain - genotyyppien tekeminen vs. sekvensointi
5. Yhteenveto

Mikä on genotyypin määrittäminen??

Genotyypin määrittäminen on yksilön geneettisen rakenteen määrittäminen käyttämällä DNA-sekvenssejä ja markkereita ja vertailemalla ja tunnistamalla sen perintöä. Genotyypin määrittäminen on tärkeää evoluutiobiologiassa, populaatiobiologiassa, taksonomiassa, ekologiassa ja organismien genetiikassa. Se voidaan suorittaa erilaisilla tekniikoilla, mukaan lukien DNA-sekvensointi, polymeraasiketjureaktio, restriktiofragmenttien pituuden polymorfismi (RFLP), satunnaisesti monistettu polymorfinen havaitseminen, monistetun fragmentinpituuden polymorfismi (AFLP), DNA-mikromatriisit jne..

Genotyyppityöhön sisältyy tiettyjen pienten DNA-sekvenssien fragmenttien sekvensointi ja geneettisen koostumuksen sukulaisuuden löytäminen muihin yksilöihin käyttämällä geneettisiä merkkejä. Se määrittelee yksilöllisten nukleotidien polymorfismit (SNP: t) tai spesifiset alleelit. Genotyypin määritys on sovellettavissa moniin organismeihin, mukaan lukien ihmiset. Sitä voidaan käyttää myös mikro-organismeihin, kuten viruksiin, sieniin jne., Ja sitä voidaan käyttää määrittämään niiden geneettiset variantit vertailuprofiileilla. Molekyyliepidemiologiassa ja oikeuslääketieteellisessä mikrobiologiassa patogeenien, erityisesti mikro-organismien, hallinta tapahtuu genotyyppien avulla saatujen tietojen avulla. Genotyypin määrittäminen on erittäin tärkeä sukupuun analysoinnissa. Ihmisillä genotyyppi vahvistetaan äitiys ja isyys. Genotyyppi paljastaa geenien hallitsevat ja recessiiviset alleelit, jotka päättävät tietyistä piirteistä.

Kuvio_1: RFLP-genotyypin määrittäminen

Mikä on sekvensointi?

Sekvensointi on prosessi nukleotidin oikean järjestyksen määrittämiseksi tietyssä DNA- tai RNA-fragmentissa. Lähes kaikki organismin kasvuun ja kehitykseen tarvittava tieto koodataan sen genomiin. Tekniikoiden saatavuus muutaman sadan nukleotidimäärän pitkien nukleiinihappofragmenttien tuottamiseksi ja erottamiseksi johti kehittämiseen menetelmiä, joilla määritetään tietyn DNA- tai RNA-fragmentin tarkka nukleotidisekvenssi. Erilaisia ​​sekvensointimenetelmiä on saatavana tänään. Nämä sekvensointimenetelmät yhdessä organismin koko genomia edustavien genomikirjaston rakentamistekniikoiden kanssa helpottavat kyseisen organismin koko genomin sekvensointia tekemällä perusteellinen analyysi geenirakenteista, geenitoiminnoista, geenien sijainneista, geeniekspressioista, geenikartoitus, geenisäätelyalueet jne.

Monien virusten, useiden bakteerien, arkebakteerien, hiivan ja useiden muiden organismien kokonaisgenomit on sekvensoitu ja kartoitettu. Ihmisen genomiprojekti on mahdollistanut koko ihmisen genomin sekvensoinnin ja kartoittamisen sekä ensimmäisen luonnoksen julkaisemisen vuonna 2003. Se on merkittävä virstanpylväs biologian kehityksessä. Ihmisen genomisekvenssejä käytetään nyt lääketieteen alalla harvinaisten sairauksien geneettisten syiden tunnistamiseen, vastasyntyneiden tautien riskin seulomiseen, erilaisten syöpien geneettisten yksityiskohtien tunnistamiseen, uusien terapeuttisten lääkkeiden kehittämiseen ja uusien diagnoosityökalujen kehittämiseen jne..

Kasvien maailmassa riisin genomi ja Arabidopsis-genomit on sekvensoitu. Tieto näistä sekvensseistä epäilemättä mullistaa ymmärrystämme siitä, kuinka solut ja organismit toimivat.

Kuva_2: Sangerin sekvensoinnin autoradiograafi

Mikä on ero genotyypin ja sekvensoinnin välillä??

Genotyyppien määritys vs. sekvensointi
Genotyypin määrittäminen on prosessi, jolla määritetään yksilön geneettinen koostumus ja tarkistetaan kyseisen organismin ryhmä tai taksonomia.	Sekvensointi on prosessi, jolla määritetään tietyn DNA- tai RNA-fragmentin nukleotidien tarkka järjestys.
Tekniikat
RFLP, geenisekvensointi, PCR, DNA - mikromatriisit, AFLP jne.	Sanger-sekvensointi, Gilbert-sekvensointi, pyrosekvensointi, seuraavan sukupolven sekvensointi, haulikko-sekvensointi jne..
Suurimmat huolenaiheet
Tämä on enemmän huolissaan siitä, antavatko genotyyppierot todelliset fenotyyppierot.	Tämä on enemmän huolissaan nukleotidien järjestyksestä ja sen eroista ja muutoksista muiden organismien kanssa.

Yhteenveto - genotyypin määrittäminen vs. sekvensointi

Genotyypin määrittäminen ja sekvensointi ovat hyödyllisiä organismien geenitietojen tutkimisessa. Genotyyppien määrittäminen on prosessi, jolla määritetään yksilöiden genotyyppimuutokset ja löydetään heidän kategoriat. Sekvensointi on prosessi, jolla määritetään nukleotidien oikea järjestys kiinnostuneessa fragmentissa tai DNA-alueella. Molemmat tekniikat tarjoavat tärkeää tietoa geeneistä ja genomista.

Viite:
1. ”Genotyyppimenetelmät.” Menetelmät molekyylibiologiassa (Clifton, N.J.). Yhdysvaltain kansallinen lääketieteellinen kirjasto, n.d. Web. 20. helmikuuta 2017.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin ja M. D. Shriver. "SNP: ien sulamiskäyräanalyysi (McSNP ): Geelivapaa ja edullinen menetelmä SNP-genotyyppien määrittämiseen." BioTechniques 30.2 (2001): 358-67. verkko.

Kuvan kohteliaisuus:
1. ”RFLP-genotyypitys” (tuntematon) - Kansalliset terveysinstituutit (Public Domain) Commons Wikimedian kautta
2. Abizarin ”Radioaktiivinen fluoresoiva” englanninkielinen Wikipedia (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta