avainero geneettisen kartan ja fyysisen kartan välillä on genomikartoituksessa käytetyissä tekniikoissa. Geneettisen kartan luomisessa geenimarkereita ja geenilokkoja käytetään tutkimaan geenin kytkentämalleja, kun taas fyysisessä kartoituksessa käytetään molekyylibiologisia tekniikoita, kuten Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) ja hybridisaatiotekniikoita..
Geneettiset kartat ja fyysiset kartat sisältävät kahden tyyppisiä karttoja, jotka rakentuvat osoittamaan kromosomeissa sijaitsevat geenit. He osallistuvat geenidiagnostiikkaan ja genomianalyysin kehityksen ennustamiseen. Lisäksi he analysoivat geenilokusten välisiä etäisyyksiä ja analysoivat geenipolymorfismeja.
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on geneettinen kartta
3. Mikä on fyysinen kartta
4. Geneettisen kartan ja fyysisen kartan yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - geneettinen kartta vs. fyysinen kartta taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Geneettinen kartta perustuu geenilokkojen sijaintiin ja geenimarkkereihin, jotka on tunnistettu linkkien analyysillä ja geenien assosiaatiotutkimuksilla. Mendelian genetiikka selittää geenikartat ja Gregor Mendel on henkilö, joka esitteli tämän käsitteen. Geneettinen kartta on hyödyllinen tutkittaessa kromosomien sijainteja ja geenejä, jotka liittyvät tiettyjen piirteiden syntymiseen. Nämä tytär- sukupolvien perimät geenit tunnistetaan sitten tietyn sairauden tai merkin geneettisiksi markkereiksi.
Kuva 01: Geneettinen kartta
Useita jalostustekniikoita useiden sukupolvien ajan ja sitten jalostustapojen analysointi tietyn ominaisuuden tai ominaisuuden suhteen ovat välttämättömiä ennen geneettisen kartan rakentamista. Ja myös geeniyhdistystutkimukset tukevat edelleen erilaisten alleelien tunnistamista, jotka ovat vastuussa tietyistä perintökuvioista geneettisessä kartoituksessa. Alleelitaajuudet ja geenitaajuudet auttavat ennustamaan tietyn geenin geenikartan kromosomissa.
Geenien fysikaaliset kartat rakentuvat käyttämällä molekyylibiologisia tekniikoita, kuten restriktioentsyymidigestiota jne., rajoituskartta on toinen nimi tälle kartalle. Kun fyysistä karttaa luodaan, aluksi restriktioentsyymit leikkaavat DNA: n fragmenteiksi. Nämä fragmentit erottuvat sitten geelielektroforeesilla. Seuraava vaihe on DNA: n fyysisen kartan luominen. Lisävaiheena heille voidaan suorittaa blottaustekniikat hybridisaation jälkeen. Tällä hetkellä ovat käytössä korkean suorituskyvyn tekniikat, kuten fluoresenssi-in situ -hybridisaatio, fyysisten karttojen luomisessa käytettäväksi geneettisinä markkereina.
Kuva 02: Fyysinen kartta
Fysikaaliset kartat ovat tarkempia ja nopeampia verrattuna geneettisiin karttoihin. Siksi niiden käyttö geenipolymorfismin analysoinnissa on korkea verrattuna geenikarttoihin. Fyysinen kartoitus ei myöskään ota huomioon Mendelian geneettisiä malleja.
Geneettinen kartta on geenikartta, joka perustuu geenin kytkentä- ja geenin assosiaatiotutkimuksiin, jotka tehdään kromosomin geenimarkerilla tai geenilokuksilla. Fysikaalinen kartta on geenikartta, jossa geenikartta saadaan fyysisesti eristämällä DNA ja saamalla tarkka geneettinen merkki käyttämällä molekyylibiologisia tekniikoita. Näissä kahdessa kartassa käytettyjen tekniikoiden osalta ero geneettisen kartan ja fysikaalisen kartan välillä on se, että geenikartassa käytetään geenin kytkentä- ja geeniyhdistysanalyysimenetelmiä, kun taas fyysisessä kartassa käytetään restriktiokartoitusta ja hybridisaatiotekniikoita. Siksi geneettisen kartan tarkkuus on alhainen, kun taas fyysisen kartan tarkkuus.
Kun verrataan näissä kahdessa kartassa käytettyjen tekniikoiden nopeutta, geenikartassa on vähemmän nopeita, aikaa vieviä tekniikoita. Fyysisessä kartassa on kuitenkin erittäin nopea tekniikka. Näin ollen geneettinen kartta on vähemmän tehokasta, kun taas fyysinen kartta on erittäin tehokas. Lisäksi geneettiset kartat perustuvat Mendelian perintökuvioihin, kun taas fyysiset kartat eivät ole suoraan Mendelian perintökuvioita.
Genomitutkimuksissa käytetään kromosomeissa olevia geenimarkkereita. Näiden markkereiden tutkimiseksi ne on kartoitettava eri tekniikoilla. Mendelien genetiikka on perintökarttojen perusta. Geneettisen kartoituksen aikana tutkitaan erilaisia piirteitä useille sukupolville ja geenejä analysoidaan geenin kytkentä- ja geeniyhdistystutkimuksilla. Sitä vastoin fyysisiin geenikarttoihin sisältyy geenimerkkien eristäminen ja karakterisointi fyysisesti erottamalla ne. Tämä on tärkein ero geneettisen kartan ja fyysisen kartan välillä.
1.O'Rourke, Jamie A. “Geneettisen ja fyysisen kartan korrelaatio.” Biotieteiden tietosanakirja, marraskuu 2014. Saatavilla täältä
2. ”Geneettiset kartoitustiedot”. Kansallinen ihmisen perimän tutkimuslaitos (NHGRI). Saatavilla täältä
1.Tiedosto: NHGRI-tietolehti - geneettinen kartoitus (27058469495). Lähettäjä National Human Genome Research Institute (NHGRI), Bethesda, MD, USA
2.'Human kromosomi Y - 400 550 850 bphs'By National Center for Biotechnology Information, Yhdysvaltain kansallinen lääketieteellinen kirjasto (julkinen alue) Commons Wikimedia -sivuston kautta