Geelielektroforeesin ja SDS n välinen ero

Avainero - geelielektroforeesi vs. SDS - sivu
 

Geelielektroforeesi on tekniikka, joka erottaa makromolekyylit sähkökentässä. Se on molekyylibiologiassa yleinen menetelmä erottaa DNA, RNA ja proteiinit seoksista molekyylikokojensa mukaan. SDS-sivu on eräänlainen geelielektroforeesi, jota käytetään erottamaan proteiinit proteiiniseoksesta niiden koon perusteella. Geelielektroforeesi on termi, jota käytetään viittaamaan normaaliin tekniikkaan, jota käytetään DNA: n, RNA: n ja proteiinien erottamiseen sillä aikaa SDS-sivu on yhden tyyppinen geelielektroforeesi. Tämä on avainero geelielektroforeesin ja SDS-sivun välillä.

SISÄLLYS
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on geelielektroforeesi
3. Mikä on SDS-sivu
4. Vertailu rinnakkain - geelielektroforeesi vs. SDS-sivu
5. Yhteenveto

Mikä on geelielektroforeesi?

Geelielektroforeesi on yleinen tekniikka, jota käytetään laboratorioissa varautuneiden molekyylien, kuten DNA: n, RNA: n, proteiinien jne. Erottamiseksi niiden seoksista. Geeliä käytetään geelielektroforeesissa. Se toimii molekyyliseulana. Geelielektroforeesissa käytetään kahta tyyppiä geelejä, nimittäin agaroosia ja polyakryyliamidia. Geelin valinta ja geelivalmiste ovat tärkeitä tekijöitä, jotka on otettava huomioon geelielektroforeesissa, koska geelin huokoskokoa tulisi manipuloida huolellisesti molekyylien hyvään erottamiseen geelielektroforeesin avulla. Geelielektroforeesissa on sähkökenttä kytketty geelin kahteen päähän. Geelin toisessa päässä on positiivinen varaus, kun taas toisessa päässä on negatiivinen varaus.

DNA ja RNA ovat negatiivisesti varautuneita molekyylejä. Kun ne on ladattu geeliin geelin negatiivisesta päästä ja levitetty sähkökenttään, ne vaeltavat geelipoikien läpi kohti geelin positiivisesti varautunutta päätä. Siirtymisen nopeus riippuu varauksesta ja molekyylin koosta. Pienemmät molekyylit kulkeutuvat helposti geelihuokosten läpi kuin suurempien molekyylien. Siksi pienemmät molekyylit kulkevat pitkän matkan geelin läpi ja suuret molekyylit kulkevat lyhyen matkan. Molekyylien kulkeutumisen tarkkailemiseksi geelillä käytetään erityyppisiä väriaineita. Sähkökenttää käytetään tietyn ajanjakson ajan ja se pysäytetään estämään molekyylien menetykset ja pitämään molekyylit kuljettuissa asemissa. Geelissä voidaan havaita erilaisia ​​juovia. Nämä nauhat edustavat erikokoisia molekyylejä. Siksi geelielektroforeesi on hyödyllinen molekyylien erottamiseksi niiden koon mukaan.

Geelielektroforeesi sisällytetään monenlaisiin tekniikoihin preparatiivisena tekniikkana molekyylibiologiassa, kuten PCR, RFLP, kloonaus, DNA-sekvensointi, eteläinen blottaus, genomikartoitus jne..

Kuvio 01: Agaroosigeelielektroforeesi

Mikä on SDS-sivu?

Natriumdodekyylisulfaatti-polyakryyliamidigeelielektroforeesi (SDS-sivu) on eräänlainen geelielektroforeesi, jota käytetään proteiinien erottamiseen. Kun geelielektroforeesia käytetään proteiinien erottamiseen, tarvitaan erityishoitoja, koska proteiinit eivät ole negatiivisesti varautuneita, kuten DNA ja RNA, eivätkä siirry kohti positiivista päätä tai negatiivista päätä. Siksi proteiinit denaturoidaan ja päällystetään negatiivisella varauksella ennen geelielektroforeesia. Se tehdään käyttämällä pesuainetta, jota kutsutaan natriumdodekyylisulfaatiksi (SDS). Geelielektroforeesi, joka käyttää SDS: ää ja polyakryyliamidigeeli tukiväliaineelle, tunnetaan SDS-sivuna. Tätä tekniikkaa käytetään yleisesti biokemiassa, genetiikassa, oikeuslääketieteessä ja molekyylibiologiassa.

SDS-sivun aikana proteiinit sekoitetaan SDS: n kanssa. SDS taittaa proteiinit lineaariseen muotoon ja päällystää ne negatiivisella varauksella, joka on verrannollinen niiden molekyylimassiin. Negatiivisen varauksen takia proteiinimolekyylit siirtyvät kohti geelin positiivisen varauksen päätä ja erottuvat molekyylimassiensa mukaan. SDS-sivulla polyakryyliamidia käytetään geelin kiinteänä tukena. Proteiinien todellinen erottelu riippuu pääasiassa geelin ominaisuuksista. Siksi polyakryyliamidigeelivalmistus on tehtävä huolellisesti ja polyakryyliamidipitoisuuksia on käytettävä oikein. Polyakryyliamidigeelit osoittavat korkeaa resoluutiota kuin agaroosigeelit. Siksi SDS-sivua pidetään korkearesoluutioisena tekniikkana proteiinien erotteluun.

SDS-sivu on eräänlainen denaturoiva geelielektroforeesi. Sillä on merkittävä rajoitus proteiinianalyysissä. Koska SDS denaturoi proteiinit ennen erottelua, se ei salli entsymaattisen aktiivisuuden, proteiineja sitovien vuorovaikutusten, proteiini kofaktorien jne. Havaitsemista..

Kuva 02: SDS-sivu

Mitä eroa geelielektroforeesilla ja SDS-sivulla on??

Geelielektroforeesi vs. SDS
Geelielektroforeesi on menetelmä, joka suoritetaan makromolekyylien erottamiseksi sähkökenttää käyttämällä.	SDS-sivu on korkearesoluutioinen geelielektroforeesitekniikka, jota käytetään proteiinien erottamiseen niiden massan perusteella.
Geeli Run
Se voidaan suorittaa vaaka- tai pystysuunnassa.	SDS-sivu toimii aina pystysuunnassa.
Erottelun perusteet
Erottelu tapahtuu varauksen ja koon mukaan.	Proteiinierottelu tapahtuu massan ja varauksen mukaan.
päätöslauselma
Agaroosigeelielektroforeesilla on alhainen resoluutio ja polyakryyliamidigeelielektroforeesilla suurempi resoluutio	SDS-sivulla on parempi resoluutio.
denaturointi
Geelielektroforeesi sisältää sekä denaturoivat että denaturoimattomat tekniikat.	SDS-sivu denaturoi proteiinit ennen erotusta.

Yhteenveto - geelielektroforeesi vs. SDS-sivu

Geelielektroforeesi on yleinen tekniikka, jota käytetään DNA: n, RNA: n ja proteiinien erottamiseen ja analysointiin niiden koon ja varauksen perusteella. Geelielektroforeesia on kahta päätyyppiä, nimittäin agaroosigeelielektroforeesi ja polyakryyliamidigeelielektroforeesi. Agaroosigeelejä käytetään pääasiassa nukleiinihappoerotukseen; kun tarvitaan suurempi resoluutio, käytetään polyakryyliamidigeelejä. SDS-sivu on eräänlainen geelielektroforeesi, jota käytetään yleisesti proteiinien monimutkaisten seosten erottamiseen. Sitä pidetään korkearesoluutioisena proteiinien erotustekniikkana. Tämä on ero geelielektroforeesin ja SDS-sivun välillä.

Viitteet:
1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig ja David H. Petering. Natiivi SDS-PAGE: Proteiinien erottelukykyinen elektrolyyttinen erottelu alkuperäisominaisuuksien säilyttämiseksi sisältäen sidotut metalli-ionit. www.nc-bi.nlm.nih.gov. N.p., toukokuu 2014. Web. 7. huhtikuuta 2017
2. Stellwagen, Nancy C. "DNA: n elektroforeesi agaroosigeeleissä, polyakryyliamidigeeleissä ja vapaassa liuoksessa." Elektroforeesi. Yhdysvaltain lääketieteellinen kirjasto, kesäkuu 2009. Web. 7. huhtikuuta 2017

Kuvan kohteliaisuus:
1. ”Gelelektrophoreseapparatur” (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta
2. ”DNA agaroosigeelielektroforeesi” Ann Arborin luonnonvarojen koulun toimesta - DNA-laboratorio (CC BY 2.0) Commons Wikimedian kautta