Ero kalan ja CGH n välillä

avainero välillä FISH ja CGH on se FISH on molekyylitekniikka, joka havaitsee spesifisen DNA-sekvenssin kromosomissa käyttämällä fluoresoivasti leimattuja koettimia, kun taas CGH on toinen molekyylisytogeneettinen tekniikka, joka havaitsee genomisen DNA: n muutokset.

Sytogeneettisellä analyysillä on tärkeä rooli lääketieteessä havaittaessa kromosomaalisia poikkeavuuksia, kuten aneuploidioita, deleetioita, duplikaatioita ja uudelleenjärjestelyjä jne. Kromosomaaliset poikkeavuudet johtavat lopulta geneettisiin sairauksiin, kuten syöpään, hedelmättömyyteen, Downin oireyhtymään, Klinefelterin oireyhtymään, Turnerin oireyhtymään, leukemiaan jne. Edellä mainittujen vikojen ja sairauksien havaitsemiseksi on olemassa erilaisia ​​molekyylisytogeneettisiä menetelmiä. Niistä FISH (fluoresoiva in situ -hybridisaatio) ja CGH (vertaileva genominen hybridisaatio) ovat kaksi voimakasta hybridisaatiotekniikkaa. Molemmilla menetelmillä on kuitenkin etuja ja haittoja.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on KALA 
3. Mikä on CGH
4. FISH: n ja CGH: n samankaltaisuudet
5. Vertailu rinnakkain - FISH vs. CGH taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on KALA?

FISH on nukleiinihappohybridisaatiotekniikka, joka suoritetaan kudoksen osalle tai osalle, koko kudoksessa tai soluissa. Se on koetinpohjainen menetelmä. Tekniikka riippuu Watson Crick-komplementaarisen emäsparin teoriasta, mikä johtaa joko DNA-DNA-hybrideihin tai DNA-RNA-hybrideihin, jotka voivat siten havaita mutatoituneet geenit tai tunnistaa mielenkiinnon kohteena olevan geenin. Lisäksi tämä tekniikka käyttää yksijuosteisia DNA-sekvenssejä, kaksijuosteisia DNA-sekvenssejä, yksisäikeisiä RNA-sekvenssejä tai synteettistä oligonukleotidia, joka on valmistettu käyttämällä nick-translaatiota koettimina, jotka ovat komplementaarisia kiinnostaville geenisekvensseille. Lisäksi tämän tekniikan tärkein piirre on koettimien merkitseminen fluoresoivilla väriaineilla. Siten koettimet sitoutuvat kromosomin komplementaarisiin osiin ja tekevät siitä helpon havaitsemisen.

Lisäksi FISH on erittäin herkkä ja erityinen menetelmä. Siksi se on yleinen tekniikka sekä hematologisten pahanlaatuisten kasvainten että kiinteiden kasvaimien tutkimuksessa ja diagnosoinnissa. Mutta FISH näyttää alhaisen resoluution. Koetinsekvenssien suunnitteluun tarvitaan myös ennakkotietoa kohteen epänormaalisuudesta.

Kuva 01: KALAT

FISH: lla on monia sovelluksia, pääasiassa tartuntatautien molekyylidiagnostiikassa patogeenien esiintymisen tunnistamiseksi ja patogeenin varmistamiseksi molekyylidiagnostiikan avulla. Lisäksi FISH on yleisesti käytetty tekniikka kehitysbiologian, karyotyyppien määrittämisen ja fylogeneettisen analyysin sekä kromosomien fyysisen kartoituksen aloilla..

Mikä on CGH?

Vertaileva genomihybridisaatio (CGH) on toinen DNA-pohjainen molekyylisytogeneettinen tekniikka, jolla voidaan havaita genomisten DNA-sekvenssien muutokset. Menetelmä on edistyksellinen menetelmä, jolla voidaan analysoida kromosomi- ja geenimuunnelmia genomisten DNA-sekvenssien muutosten tai muutosten havaitsemiseksi. Lisäksi CGH vaatii DNA: n eristämisen ja fragmentoinnin kokeellisesta näytteestä ja vertailunäytteestä. Sitten näytteet tulisi merkitä kahdella eri fluoresoivalla väriaineella (yleensä punaisella ja vihreällä). Myöhemmin molemmat näytteet sekoitetaan ja annetaan kilpailukykyiseen hybridisaatioon. Viimeinen vaihe on näytteiden analysointi DNA: n muutosten, kuten geenien päällekkäisyyden, geenin menetyksen jne. Suhteen. Erityisesti se mittaa DNA-kopiomäärän eroja testinäytteen ja kontrollinäytteen välillä.

Kuvio 02: CGH

Toinen CGH-versio on nyt saatavana; se on edistyneempi menetelmä kuin normaali CGH. Se on tekniikka, jota kutsutaan matriisipohjaiseksi CGH tai aCGH. aCGH mahdollistaa geenien tai sekvenssien deleetioiden tarkan tunnistamisen monissa tuhansissa sekvensseissä yhdessä kokeessa.

Mitkä ovat kalojen ja CGH: n väliset yhtäläisyydet??

• FISH ja CGH ovat kaksi molekyylitekniikkaa.
• Sekä FISH että CGH luottavat nukleiinihappohybridisaatioon.
• Lisäksi molemmat tekniikat tarvitsevat suunniteltuja koettimia spesifisten DNA-kohteiden havaitsemiseksi.
• Käytämme niitä geneettisten sairauksien diagnosointiin synnytyksen aikana ja postnataalisesti.
• Lisäksi sekä FISH että CGH ovat erittäin tehokkaita työkaluja genomimuutosten tutkimiseksi.
• He käyttävät fluoresoivia väriaineita koettimien merkitsemiseen.

Mikä on kalan ja CGH: n ero??

KALA on in situ hybridisaatiomenetelmä, joka käyttää fluoresoivia koettimia spesifisten DNA-sekvenssien havaitsemiseksi, kun taas CGH on molekyylin hybridisaatiotekniikka, joka havaitsee genomisten DNA-sekvenssien muutokset. Joten, tämä on tärkein ero FISH: n ja CGH: n välillä.

Lisäksi FISH vaatii ennakkotietoa kohteen epänormaalisuudesta koetinsekvenssien suunnittelussa, kun taas CGH ei vaadi ennakkotietoa. Lisäerona FISH: n ja CGH: n välillä on myös se, että FISH: n resoluutio on rajoitettu, kun taas aCGH: n resoluutio on korkea.

Alla oleva infografia esittää yhteenvedon FISH: n ja CGH: n välillä.

Yhteenveto - KALAT vs. CGH

FISH ja CGH ovat kaksi molekyylisytogeneettistä tekniikkaa, jotka helpottavat mielenkiinnon kohteena olevien geenisekvenssien havaitsemista. FISH helpottaa spesifisen DNA-sekvenssin havaitsemista kromosomissa käyttämällä fluoresoivasti leimattuja koettimia, kun taas CGH helpottaa genomisen DNA: n muutosten havaitsemista. Joten, tämä on tärkein ero FISH: n ja CGH: n välillä.

Viite:

1. ”Fluoresenssi in situ -hybridisaatio (FISH)” Nature News, Nature Publishing Group, saatavana täältä.
2. Hester, Susan D, et ai. "Vertailu vertaileviin geenihybridisaatiotekniikoihin Microarray-ympäristöissä." Biomolekyylitekniikan lehti: JBT, Biomolekyylisten resurssilaitosten liitto, huhtikuu 2009, saatavana täältä.

Kuvan kohteliaisuus:

1. ”Multiplex ViewRNA FISH -määritys Jurkat- ja HeLa-soluissa”. Ryan Jeffs - Oma työ (CC BY-SA 3.0) Commons Wikimedian kautta
2. “CGH-skeema” - kirjoittanut Mbaudis (keskustelu) (Lähetykset) - Oma työ (CC BY 2.5) Commons Wikimedian kautta