Transkriptio on prosessi, jolla muunnetaan koodaavaan DNA-sekvenssiin tallennettu geneettinen informaatio mRNA-sekvenssiksi. Spesifinen DNA-alue, joka sijaitsee transkriptioyksikön 5'-päässä, aloittaa tämän prosessin. Tämä alue tunnetaan promoottorialueena. Nämä promoottorit ovat tyypillisesti transkription aloituskohdan vieressä. Promoottorin pituus vaihtelee välillä 100 bp - 1000 bp. Promoottorit ovat erilaisia organismityypin mukaan. Eukaryoottiset ja prokaryoottiset promoottorit eroavat toisistaan. Prokaryooteissa havaitaan vain kolmen tyyppisiä promoottorisekvenssejä, nimittäin -10 promoottoris, -35 promoottoria ja upstream-elementtejä. Sisään eukaryootit, on olemassa monia erilaisia promoottorielementtejä, kuten TATA - laatikko, initiaattorielementit, GC - laatikko, CAAT - laatikko jne. Tämä on avainero eukaryoottisten ja prokaryoottisten promoottorien välillä.
1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mitkä ovat eukaryoottisia promoottoreita
3. Mitkä ovat prokaryoottiset promoottorit
4. Eukaryoottisten ja prokaryoottisten promoottorien samankaltaisuudet
5. Vertailu rinnakkain - eukaryoottiset vs. prokaryoottiset promoottorit taulukkomuodossa
6. Yhteenveto
Kolme pääosaa; ydinpromoottori, proksimaalinen promoottori ja distaalinen promoottori muodostavat yhdessä promoottorin. Eukaryoottien yhteydessä löytyy monia lukuja promoottorielementtejä, jotka ovat erittäin hienostuneita ja monimuotoisempia kuin promoottorit. On saatu selville, että eukaryoottisten promoottorien tämän monimutkaisuuden vuoksi DNA: lla on kyky taittaa itsensä takaisin. Tämä selittää myös sen tosiasian, että monien säätelevien sekvenssien vaikutus tapahtuu, vaikka ne sijaitsevatkin monta kilobaseaa poissa transkription kohdasta. Nämä eukaryoottiset promoottorit kykenevät leviämään laajan valikoiman DNA-sekvenssejä.
Kuvio 01: eukaryoottinen promoottori
Esimerkkejä eräistä eukaryoottisista promoottoreista ovat Pribnow-laatikko (TATA-laatikko), GC-laatikko, CAAT-laatikko jne. TATA-ruutu, se on sekvenssi 5 '- TATAA -3', joka on läsnä ydinpromoottorialueella. TATA-ruutuun transkriptiotekijäproteiinit ja histoniproteiinit ovat sitoutuneet. Transkriptiotekijäproteiinien sitoutuminen TATA-ruutuun auttaa RNA-polymeraasin sitoutumista, mikä johtaa sitten transkriptiokompleksin muodostumiseen. Yksinkertaisesti sanottuna näiden proteiinien sitoutuminen ohjaa transkription prosessia. Tämä prosessi estyy, kun histoniproteiinit sitoutuvat TATA-laatikkoon. Siksi TATA-ruutu on tärkeä promoottorielementti, johon sisältyy eukaryoottisen transkription nopeuden säätely.
Prokaryoottisissa organismeissa promoottori, joka liittyy transkriptioon, tunnistetaan liittyvällä tekijällä, jota kutsutaan sigma-tekijäksi. Sigma-tekijät ovat ainutlaatuisia erilaisille promoottorisekvensseille. Siksi sanotaan, että jokainen yksittäinen sigmakerroin tunnistaa yhden ytimen promoottorisekvenssin. Tämä on ainutlaatuinen ominaisuus, joka on läsnä prokaryoottisessa transkriptioprosessissa. Sekä RNA-polymeraasi että sigma-tekijä identifioivat yhdessä oikean promoottorialueen ja muodostavat transkriptiokompleksin.
Prokaryoottinen promoottori sisältää vain kolmen tyyppisiä promoottorielementtejä. Promoottorielementtien vähemmän osallistuminen prokaryooteihin on pääasiallinen syy, miksi niiden transkriptioprosessi on vähemmän hienostunut verrattuna eukaryoottisiin transkriptioihin, joihin liittyy suurempi määrä promoottorisekvenssejä. Prokaryoottien kolmesta promoottorielementistä on kaksi tärkeätä kahta lyhyttä DNA-sekvenssiä. Nämä sekvenssit luokitellaan sijainnin mukaan. Ne ovat -10 promoottoria tai elementti (joka on läsnä 10 bp ylävirtaan transkription aloituskohdasta), -35 promoottori tai elementti (joka on läsnä 35 bp ylävirtaan transkription aloituskohdasta).
Kuvio 02: Prokaryoottinen promoottori
-10-promoottori vastaa eukaryoottista TATA-ruutua tai Pribnow-ruutua ja on välttämätön komponentti transkription aloittamiseksi prokaryooteissa. -35-promoottori koostuu sekvenssistä, joka on TTGACA ja joka osallistuu aktiivisesti prokaryoottisen transkription nopeuden säätelyyn.
Eukaryoottiset vs. prokaryoottiset promoottorit | |
Eukaryoottiset promoottorit ovat säätelysekvenssejä, jotka aloittavat eukaryoottisten organismien transkription. | Prokaryoottiset promoottorit ovat säätelysekvenssejä, jotka aloittavat prokaryoottisten geenien transkription. |
elementit | |
Prokaryoottinen promoottori koostuu ylävirran elementteistä, -10 elementistä ja -35 elementistä. | Eukaryoottinen promoottori koostuu Pribnow-laatikosta (TATA-laatikko), CAAT-laatikosta, GC-laatikosta ja initiaattorielementeistä. |
Promoottori on DNA-alue, johon sisältyy prosessin, jota kutsutaan transkriptio, aloittaminen. Nämä promoottorit löytyvät tyypillisesti ylävirtaan transkription aloituskohtaan. Kolme pääosaa, jotka muodostavat promoottorin, ovat ydinpromoottori, proksimaalinen promoottori ja distaalinen promoottori. Eukaryoottien yhteydessä promoottorialueella on useita promoottoreita, jotka ovat erittäin hienostuneita ja monimuotoisempia kuin prokaryootit. Esimerkkejä joistakin eukaryoottisista promoottorielementeistä ovat Pribnow-laatikko (TATA-laatikko), GC-laatikko, CAAT-laatikko jne. Prokaryooteissa on kaksi tärkeätä promoottorielementtiä, nimittäin -10-elementti (joka on läsnä 10 bp: n ylävirtaan transkription aloituskohdasta), -35 elementtiä (jota on läsnä 35 bp ylävirtaan transkription aloituskohdasta). -10-promoottori aloittaa transkription, ja -35-promoottori säätelee transkriptiota. Kumpaakin tyyppisiä promoottoreita säätelevät erilaiset DNA-säätelysekvenssit, jotka sisältävät tehostajat, äänenvaimentimet, eristimet ja rajaelementit. Tämä on ero eukaryoottisten ja prokaryoottisten promoottorien välillä.
Voit ladata tämän artikkelin PDF-version ja käyttää sitä offline-tarkoituksiin lainauksen yhteydessä. Lataa PDF-versio täältä: Eukaryoottisen ja prokaryoottisen promoottorin ero
1.Kanhere, A. "Promoottorien rakenteelliset ominaisuudet: samankaltaisuudet ja erot prokaryoottien ja eukaryootien välillä." Nucleic Acids Research, voi. 33, ei. 10, helmikuu 2005, sivut 3165-3175., Doi: 10.1093 / nar / gki627.
2. ”Promoottorit.” Addgene. Saatavilla täältä
1. 'Geenirakenteen eukaryote 2 -merkinnät' kirjoittanut Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). ”Eukaryoottinen ja prokaryoottinen geenirakenne”. WikiJournal of Medicine 4 (1). DOI: 10,15347 / WJM / 2017,002. ISSN 20024436., (CC BY 4.0) Commons Wikimedian kautta
2.'Näkymä 15 02 01 ': CNX OpenStax, (CC BY 4.0) Commons Wikimedian kautta