Ero kromosomipinnoittelun ja kromosomimaalauksen välillä

avainero kromosomivyörityksen ja kromosomimaalauksen välillä on se kromosomiviritys on värjäystekniikka, joka näyttää kromosomialueet erotettavissa tummissa ja vaaleissa vyöhykkeissä, mutta kromosomimaalaus on hybridisaatiotekniikka, jossa tietyt kromosomialueet tai segmentit maalataan sekvenssispesifisillä fluoresoivasti leimattuilla koettimilla.

Sytogenetiikassa on välttämätöntä tuottaa organismin näkyvä kariotyyppi kromosomien ja niiden poikkeavuuksien tunnistamiseksi. Kromosominauhat ja kromosomimaalaus ovat kaksi sytogeneettistä tekniikkaa, jotka auttavat kromosomien visualisoinnissa. Molemmat tekniikat ovat hyödyllisiä geneettisten häiriöiden tunnistamisessa.

SISÄLLYS

1. Yleiskatsaus ja keskeiset erot
2. Mikä on kromosomipinnoitus 
3. Mikä on kromosomimaalaus
4. Kromosomipinnoittelun ja kromosomimaalauksen yhtäläisyydet
5. Vertailu rinnakkain - kromosomipinnoittelu vs. kromosomimaalaus taulukkomuodossa
6. Yhteenveto

Mikä on kromosomipinnoitus?

Kromosomiviritys on värjäysmenetelmä, joka näyttää vuorottelevat vaaleat ja tummat vyöt tai alueet kromosomin pituudella. Kaista tarkoittaa kromosomin osaa, joka on selvästi erotettavissa vierekkäisistä segmenteistään näyttämällä tummemmalta tai vaaleammalta. Tummien ja vaaleiden nauhojen tuottamiseksi on välttämätöntä värjätä kromosomit sopivalla väriaineella, kuten fluoresoivalla värillä kinakriini- tai Giemsa-värjäyksellä.

Kromosomaalisia nauhoitusmenetelmiä on useita tyyppejä. Niistä Q-kaistaus, käänteinen (R) kaista ja G-kaista ovat yleisiä kaistaustekniikoita. G-kaistaustekniikka käyttää väriainetta, jota kutsutaan Giemsa-tahraksi, ja se värjää heterokromaattisten alueiden AT-rikkaita alueita tummavärisillä vyöhykkeillä ja GC-rikkaita euchromaattisia alueita kevyesti värjätyillä vyöhykkeillä. R-kaistaus on G-kaistauksen käänteinen, ja se värjää GC-rikkaat alueet tummissa kaistoissa ja AT-rikkaat alueet vaaleissa kaistoissa. Q-vyöhyke puolestaan ​​käyttää fluoresoivaa väriainokinakriiniä ja se värjää kromosomit keltaisella fluoresenssilla, jolla on eri intensiteetti. C-kaistaustekniikka on toinen kaistatustekniikka, joka värjää centomeerialueet. Lisäksi T-kaistaustekniikka visualisoi telomeerialueet.

Kuvio 01: Kromosomipinnoitus

Nauhakuvio on ainutlaatuinen organismeille. Siksi nämä ainutlaatuiset vyöhykekuviot ovat tärkeitä kromosomien tunnistamisessa ja kromosomipoikkeavuuksien havainnoinnissa (kromosomin rikkoutuminen, häviäminen, kaksinkertaistuminen, translokaatio tai käänteiset segmentit).

Mikä on kromosomimaalaus?

Kromosomimaalaus on tekniikka, jossa tietyt kromosomialueet tai segmentit maalataan sekvenssispesifisillä koettimilla, jotka on fluoresoivasti leimattu. Siksi kromosomaalinen maalaus on aina yhteydessä in situ FISH-tekniikka. Se perustuu täysin molekyylin hybridisaatioon kromosomien sekvenssispesifisten koettimien kanssa. Siksi se tarvitsee erityisiä koettimia kohdekromosomien tai kromosomialueiden hybridisoimiseksi.

Kuva 02: Kromosomaalimaalaus

Lisäksi tämä tekniikka vaatii aluksi metafaasissa olevan kohdekromosomaalisen DNA: n denaturaation. Toiseksi hybridisaatiovaihe tapahtuu koettimien kanssa. Kun koettimet ovat löytäneet komplementaarisen sekvenssin, ne hybridisoituvat kromosomin tiettyjen alueiden kanssa. Voimme havaita helposti hybridisoituneet kohdat käyttämällä autoradiografiaa tai immunofluoresenssia. Koettimien valmistelu, denaturointi, hybridisaatio ja visualisointi ovat neljä päävaihetta kromosomaalimaalaukseen.

Sovellusten suhteen kromosomaalinen maalaus on hyödyllinen tunnistettaessa kromosomaalisia uudelleenjärjestelyjä, katkaisupisteitä ja määritettäessä kromosomaalisia materiaaleja. Lisäksi se on tehokas työkalu kromosomien eri geenisekvenssien tarkkaan lokalisointiin mikroskooppisella tasolla. Lisäksi kromosomaalimaalauksesta on apua geenien tunnistamisessa kromosomien halutuille merkkeille.

Mitkä ovat samankaltaisuudet kromosomipinnoittelun ja kromosomimaalauksen välillä?

• Kromosominauhat ja kromosomimaalaus ovat kaksi tekniikkaa, joita käytetään sytogeneettisessä analyysissä.
• Molemmat tekniikat visualisoivat kromosomit yleensä metafaasissa.
• Nämä tekniikat voivat tunnistaa normaalit kromosomit ja aberraatiot.
• Lisäksi nämä tekniikat ovat todella hyödyllisiä geneettisten häiriöiden tunnistamisessa.

Mikä on ero kromosomipinnoituksen ja kromosomimaalauksen välillä??

Kromosomiviritys on värjäystekniikka, joka näyttää erotettavissa olevat kromosomiosat tummissa ja vaaleissa vyöhykkeissä. Samaan aikaan kromosomimaalaus on hybridisaatiotekniikka, joka maalaa kromosomien tietyt alueet sekvenssispesifisillä koettimilla, jotka on fluoresoivasti leimattu. Joten, tämä on avainero kromosomivaihtelun ja kromosomimaalauksen välillä. Lisäksi kromosomiviritys tuottaa vuorottelevia tummia ja vaaleita juovia kromosomin koko pituudella, kun taas kromosomimaalaaminen tuottaa fluoresoivasti leimatut kromosomialueet.

Lisäksi kromosomiviritys riippuu kromosomaalisen DNA: n kyvystä värjätä väriaineella, kun taas kromosomin maalaus riippuu molekyylin hybridisaatiosta kromosomien sekvenssispesifisten koettimien kanssa. Tämä on tärkeä ero kromosomivaihtelun ja kromosomimaalauksen välillä. Näiden lisäksi, toisin kuin kromosomiviritys, kromosomimaalaustekniikka vaatii sekvenssispesifisiä fluoresoivasti leimattuja koettimia.

Yhteenveto - Kromosomipinnoitus vs. kromosomimaalaus

Kromosominauhat ja kromosomimaalaus ovat kahta tekniikkaa, jota käytetään kromosomien visualisointiin, yleensä metafaasissa. Molemmat tekniikat auttavat tunnistamaan numeeriset ja rakenteelliset kromosomaaliset poikkeamat ja geneettiset sairaudet. Kromosomiviritys on värjäystekniikka, joka näyttää kromosomien erityiset alueet tummissa ja vaaleissa vyöhykkeissä, jotka ovat erotettavissa. Samaan aikaan kromosomaalinen maalaus on eräänlainen hybridisaatiotekniikka, joka visualisoi kromosomien spesifiset alueet johtuen hybridisaatiosta fluoresoivasti leimattujen sekvenssispesifisten koettimien kanssa. Joten, tämä on avainero kromosomivaihtelun ja kromosomimaalauksen välillä.

Viite:

1. Thomas, et ai. "Kromosomimaalaus: hyödyllinen taide." OUP Academic, Oxford University Press, 1. syyskuuta 1998, saatavana täältä.
2. ”G Banding.” Wikipedia, Wikimedia Foundation, 19. tammikuuta 2020, saatavana täältä.

Kuvan kohteliaisuus:

1. ”NHGRI-ihmisen uroskaryotyyppi” - National Human Genome Research Institute - (Public Domain) Commons Wikimedia -palvelun kautta
2. ”Kirafan (Giraffa camelopardalis) kariotyyppi” Anastasia I Kulemzina, Polina L Perelman, Darya A Grafodatskaya, Trung T Nguyen, Mary Thompson, Melody E Roelke-Parker ja Alexander S Graphodatsky - Kulemzina AI, Perelman PL DA, Grafodatska. et ai. Vertaileva kromosomimaalaus pronghorn (Antilocapra americana) ja saola (Pseudoryx nghetinhensis) karyotyypeistä ihmisen ja dromedaaristen kamelinkoettimien kanssa. BMC-genetiikka. 2014; 15: 68. doi: 10.1186 / 1471-2156-15-68. (CC BY 2.0) Commons Wikimedian kautta