Agaroosi ja polyakryyliamidi ovat molemmat vesiliukoisia polymeerejä, mutta niiden välillä voidaan nähdä monia eroja alkuperästään lähtien. Sekä agaroosilla että polyakryyliamidilla on jotain yhteistä niiden kyvyssä muodostaa huokoisia geelimatriiseja. Tästä huolimatta näiden kahden välillä on useita selviä eroja. Suurimmat erot näiden kahden polymeerin välillä ovat niiden alkuperän luonteessa, kemiallisessa rakenteessa, niiden erilaisissa käyttötarkoituksissa ja suorituskyvyssä geelielektroforeesissa.
Agaroosi on luonnossa esiintyvä lineaarinen polymeeri, joka on puolestaan johdettu merilevästä löytyvästä kompleksisesta polymeeristä, nimeltään agar. Agaroosi uutetaan agarista poistamalla sen proteiinikomponentti nimeltään agaropectin. Agaroosi antaa agarille kyvyn muodostaa geelejä.
Agaroosin pääasiallinen käyttö on mikrobiologisissa ja molekyylibiologisissa tutkimuksissa. Mikrobiologisissa tutkimuksissa agaroosi, jota on täydennetty sopivilla ravintoaineilla, tarjoaa vankan perustan mikro-organismien, kuten bakteerien ja sienten, viljelyyn. Kun käytetään puolikiinteinä pitoisuuksina, se voi olla hyödyllinen arvioitaessa näiden mikro-organismien liikkuvuutta. Molekyylibiologiassa se toimii tärkeänä työkaluna yhdelle perustavanlaatuisimmalle resoluutioprosessille nimeltään 'geelielektroforeesitaiagaroosigeelielektroforeesi'(Ikä). Geelielektroforeesi on prosessi, joka mahdollistaa nukleiinihappojen tai proteiinien erottamisen tai erottamisen niiden koon ja varauksen perusteella. Tässä agaroosi toimii huokoisena seulamaisena geelinä, jonka läpi erottaminen tapahtuu.
Agarose-rakenne
Polyakryyliamidi on synteettistä polymeeriä ja sitä käytetään monilla eri aloilla. Kuten aiemmin mainittiin, sen käyttö riippuu kyvystään muodostaa geelejä. Tämän lisäksi sen kykyä pitää ja tyhjentää vettä eri konsentraatioissa hyödynnetään kuitenkin myös eri teollisuudenaloilla.
Levinnein ja polyakryyliamidia käytetään yleisesti jätevesien käsittelyssä. Täällä sitä käytetään flokkulointiaineena kaiken suspendoituneen orgaanisen materiaalin poistamiseksi; siten parantaa sameutta ja kirkastaa vettä. Toinen polyakryyliamidin käyttö on paperiteollisuudessa. Täällä sitä käytetään joko veden pidättämiseen tai tyhjentämiseen paperimassasta tarpeen mukaan. Samoin maatalous- ja rakennusteollisuudessa sitä käytetään maanparannusaineena maaperän eroosion estämiseksi ja sen laadun parantamiseksi.
Kuten agaroosi, myös polyakryyliamidia käytetään molekyylibiologiassa tärkeänä erottelutyökaluna samanlaisessa prosessissa nimeltään 'Polyakryyliamidigeelielektroforeesi '(PAGE). Kaikkien tämän lisäksi polyakryyliamidia käytetään myös malmin prosessoinnissa ja flokkulointiaineiden valmistuksessa suspendoituneen orgaanisen materiaalin poistamiseksi; siten parantaa sameutta ja kirkastaa vettä. Toinen polyakryyliamidin käyttö on paperiteollisuudessa. Täällä sitä käytetään joko veden pidättämiseen tai tyhjentämiseen paperimassasta tarpeen mukaan. Samoin maatalous- ja rakennusteollisuudessa sitä käytetään maanparannusaineena maaperän eroosion estämiseksi ja sen laadun parantamiseksi. Tämän lisäksi polyakryyliamidia käytetään myös elintarvikelisäaineiden, pehmeiden piilolinssien ja tekstiilien valmistuksessa.
Polyakryyliamidirakenne
agaroosi: Agaroosi on luonnollista alkuperää oleva polymeeri. Se on johdettu merilevästä.
polyakryyliamidigeelien: Polyakryyliamidi on synteettistä alkuperää eikä sitä löydy missään luonnollisessa tilanteessa.
agaroosi: Agaroosin molekyylikaava on C24H38O19.
polyakryyliamidigeelien: Polyakryyliamidin molekyylikaava on (C 3H5EI)n.
agaroosi: Agaroosi on lineaarinen polysakkaridi. Se koostuu toistuvista disakkaridiyksiköistä, joita kutsutaan agrobioosiksi, joita pitävät vety sidokset.
polyakryyliamidigeelien: Polyakryyliamidi on kemiallisesti silloitettu polymeeri. Se koostuu akryyliamidimonomeereistä ja silloitusaineesta N, N'-metyleenibisakryyliamidista.
agaroosi: Sekä agaroosi että sen monomeeriyksikkö agrobioosi ovat luonteeltaan myrkyttömiä.
polyakryyliamidigeelien: Polyakryyliamidin monomeeriyksikkö, akryyliamidi, on oletettu syöpää aiheuttava aine ja tunnettu neurotoksiini, kun taas sen polymeroitunut muoto ei ole myrkyllinen luonteeltaan.
agaroosi: Agarose-geelivalmiste AGE: lle on vähemmän aikaa vievää, helppoa ja yksinkertaista, eikä se vaadi initiaattoria tai polymerointikatalyyttiä.
polyakryyliamidigeelien: Polyakryyliamidigeelivalmistus PAGE: lle on aikaa vievää ja työlästä, ja se vaatii myös initiaattorin (ammoniumpersulfaatti) ja polymeroivan katalyytin (N, N, N ', N'-tetrametyylietyleenidiamiini - TEMED)..
Polyakryyliamidigeelit ovat kemiallisesti stabiilimpia kuin agaroosigeelit.
Samaan konsentraatioon perustuen polyakryyliamidigeelimatriiseilla on yleensä pienemmät huokoskoot verrattuna agaroosigeelimatriisin huokoskokoon..
Polyakryyliamidigeelien huokoskokoa voidaan muuttaa hallitummalla tavalla kuin agaroosigeelien huokoskokoa.
Polyakryyliamidigeeleillä on korkea erotuskyky, kun taas agaroosigeeleillä on alhainen erotuskyky.
Polyakryyliamidigeelit voivat mahtua suurempia määriä nukleiinihappoa kuin agaroosigeelit erotuskykyyn.
Kuvat kohteliaisuus: Agaroosi ja polyakryyliamidin rakenne Wikicommonsin kautta (Public Domain)